识别OA中硒代谢通路调控因子的表达变化
寻找在OA条件下表达特异性改变的硒代谢通路调控因子
分析GEO公共转录组数据集(人OA软骨、IL-1β处理软骨外植体和软骨细胞、多种OA动物模型),并对人OA软骨及小鼠软骨进行免疫组化和染色
Selenophosphate synthetase 1 deficiency exacerbates osteoarthritis by dysregulating redox homeostasis.
含人OA软骨样本、多种细胞模型、条件敲除小鼠模型及体内挽救实验,具备功能与机制验证
人OA软骨样本 原代小鼠关节软骨细胞 Sephs1-iCKO小鼠(Sephs1fl/fl; Col2a1-CreERT2) Sephs1条件敲除小鼠(Sephs1fl/fl; Col2a1-Cre)
软骨特异性Sephs1敲除效率:原代软骨细胞中Sephs1转录本及SEPHS1蛋白检测 ROS水平:CM-H2DCFDA测H2O2、DHE测O2•−,流式与免疫荧光定量 衰老指标:γ-H2AX核焦点与SA-β-Gal阳性率 NAC处理浓度与Sephs1 siRNA敲低后γ-H2AX和SA-β-Gal阳性变化 TMX注射方案:80 μg/g体重,连续5天腹腔注射;DMM术后6或8周取材
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找在OA条件下表达特异性改变的硒代谢通路调控因子
分析GEO公共转录组数据集(人OA软骨、IL-1β处理软骨外植体和软骨细胞、多种OA动物模型),并对人OA软骨及小鼠软骨进行免疫组化和染色
验证SEPHS1缺失是否减少应激相关硒蛋白并升高ROS
分离Sephs1fl/fl与Sephs1fl/fl; Col2a1-Cre小鼠原代软骨细胞,进行Western blot、qRT-PCR、CM-H2DCFDA和DHE染色;并用siRNA敲低Sephs1
验证ROS升高是否导致DNA损伤和细胞衰老
检测γ-H2AX焦点、SA-β-Gal活性、SASP因子表达,并进行RNA测序和GSEA;用NAC处理验证ROS的作用
验证成年软骨中Sephs1缺失是否加速衰老相关OA
使用他莫昔芬诱导的软骨特异性Sephs1敲除小鼠(Sephs1-iCKO),在12月龄注射TMX,18月龄分析OA表型
验证Sephs1缺失是否加重DMM诱导的创伤后OA,以及NAC能否挽救
12周龄Sephs1-iCKO小鼠行DMM手术,给予NAC或硒酸盐补充,分析组织学、μCT和疼痛行为
验证膳食硒缺乏是否与SEPHS1缺失协同加剧OA
12周龄小鼠喂饲硒缺乏饮食或对照饮食,行DMM手术,分析OA表型
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma Aldrich | -- |
| 玉米油 | Sigma Aldrich | -- | |
| N-乙酰半胱氨酸 | -- | -- | |
| 基因组DNA提取 | 组织基因组DNA提取SV小量制备试剂盒 | MG MED | -- |
| 免疫组织化学 | SEPHS1抗体 | Santa Cruz | sc-365945 |
| p16INK4a抗体 | Proteintech | 10883-1-AP | |
| MMP13抗体 | Abcam | ab51072 | |
| GPX1抗体 | Abcam | ab22604 | |
| SELENOW抗体 | Rockland | 600-401-A29 | |
| 4-羟基壬烯醛抗体 | Abcam | ab46545 | |
| IL-6抗体 | Santa Cruz | sc-130326 | |
| GROα抗体 | R&D systems | MAB453 | |
| ADAMTS5抗体 | Abcam | ab41037 | |
| CTX-II抗体 | Novus | NBP2-59386 | |
| NITEGE抗体 | MD Bioproducts | 1042003 | |
| HMGB1抗体 | Abcam | ab18256 | |
| II型胶原抗体 | Sigma Aldrich | MAB8887 | |
| NBT/BCIP即用型片剂 | Roche | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Sigma Aldrich | -- |
| 硝酸纤维素膜 | GE Healthcare | -- | |
| ECL底物 | Thermo Scientific | -- | |
| iBright FL1000成像系统 | Thermo Scientific | -- | |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| siRNA转染 | METAFECTENE PRO转染试剂 | Biontex | -- |
| ROS检测 | CM-H2DCFDA荧光探针 | Thermo Scientific | -- |
| 二氢乙锭 | Thermo Scientific | -- | |
| 流式分析 | FACS Canto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞成像 | EVOS FL细胞成像系统 | Thermo Scientific | -- |
| qRT-PCR | TRI试剂 | Molecular Research Center, Inc. | -- |
| EasyScript逆转录酶 | TransGen Biotech | -- | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Thermo Scientific | -- | |
| StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA测序 | TruSeq链特异性mRNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| Kapa文库定量试剂盒 | Kapa Biosystems | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| 疼痛行为测试 | 动态负重系统 | Bioseb | -- |
| incapacitance测痛仪 | IITC Life Science | 600MR | |
| 热板镇痛仪 | Columbus Instruments | -- | |
| μCT成像 | 活体微型CT扫描仪 | Bruker | Skyscan 1276 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人OA软骨样本分析 | 样本来源为接受全膝关节置换术的OA患者,仅使用女性患者样本;OA损伤区取胫骨平台内侧,对照取外侧相对未损伤区 阅读提示:Methods的Collection of human tissue samples及Fig. 1b、c图注 |
| 软骨细胞Sephs1敲除或敲低 | 原代软骨细胞来自5日龄ICR小鼠;siRNA 50 nM转染12 h后换液48 h,转染两次 阅读提示:Methods的Cell culture及RNA sequencing小节 |
| ROS与衰老检测 | CM-H2DCFDA 5 μM 30 min、DHE 1 μM 15 min;SA-β-Gal 37 °C 12–16 h;NAC处理浓度见图注 阅读提示:Methods的ROS detection与SA-β-Gal staining小节及Fig. 2k、l图注 |
| 诱导性Sephs1敲除小鼠 | 12周龄或12月龄小鼠腹腔注射TMX 80 μg/g体重,连续5天,溶于玉米油 阅读提示:Methods的Mice小节及Fig. 3a–c图注 |
| DMM创伤后OA模型与补充处理 | 12周龄(WT)或13周龄(Sephs1fl/fl或CreERT2)小鼠行DMM;NAC 1 mg/ml或硒酸钠1 ppm饮水,从术前5天开始;术后6或8周取材 阅读提示:Methods的Experimental OA in mice小节及Fig. 4、5图注 |
| 硒缺乏饮食实验 | 硒缺乏饮食0.026 μg/g Se,对照0.4 μg/g Se;从DMM术前5天开始,术后继续6周 阅读提示:Methods的Selenium-deficient diet in mice小节及Fig. 6图注 |