母体通过肠道微生物代谢物调控新生儿胆道疾病

Maternal regulation of biliary disease in neonates via gut microbial metabolites.

作者信息Jai Junbae Jee, Li Yang, Pranavkumar Shivakumar, Pei-Pei Xu, Reena Mourya, Unmesha Thanekar, Pu Yu, Yu Zhu, Yongkang Pan, Haibin Wang, Xufei Duan, Yongqin Ye, Bin Wang, Zhu Jin, Yuanmei Liu, Zhiqing Cao, Miki Watanabe-Chailland, Lindsey E Romick-Rosendale, Michael Wagner, Lin Fei, Zhenhua Luo, Nicholas J Ollberding, Shao-Tao Tang, Jorge A Bezerra
PMID35013245
发布时间2022-01-10
DOI10.1038/s41467-021-27689-4

实验完整度

高

含体外细胞实验、新生小鼠RRV模型、16s rRNA测序、NMR代谢组及102例BA婴儿粪便宏基因组

主要模型

新生BALB/c小鼠RRV诱导胆道闭锁模型 RRV感染小鼠肝脏单个核细胞 小鼠胆管细胞系mCL 胆道闭锁婴儿粪便样本队列

重点核对

母鼠饮水添加200 mmol/L丁酸钠(pH 7.5),孕期及产后4周持续给药 新生小鼠出生24 h内腹腔注射1.5×10^6 ffu RRV,对照注射PBS或生理盐水 新生小鼠口服丁酸盐0.3 mg/g体重或腹腔注射谷氨酰胺0.25 mg/g、肌苷0.2 mg/g体重,隔日给药 谷氨酰胺8–16 mM处理及NAC 5 mM预处理用于NK细胞-胆管细胞共培养杀伤实验 人粪便样本:102例BA与28例年龄匹配对照,采集诊断时术前粪便

摘要

新生儿期母体微生物组的定植会留下持久的生物学印记,但其如何影响生命早期的疾病易感性仍不清楚。我们假设给孕鼠喂食丁酸盐会影响新生小鼠对胆道闭锁(一种新生儿严重胆管病)的易感性。在此,我们发现给母鼠施用丁酸盐可使新生小鼠对胆管炎症和损伤产生抵抗并提高存活率。肝脏免疫细胞激活的预防和存活特征与拟杆菌门和梭菌纲的粪便特征相关,并伴有新生小鼠粪便代谢物中谷氨酸/谷氨酰胺和次黄嘌呤的增加。在患胆道闭锁的人类新生儿中,这些细菌的粪便微生物组特征呈现不足,同时谷氨酸/谷氨酰胺通路受到抑制而次黄嘌呤通路增加。直接给新生小鼠施用丁酸盐或谷氨酰胺可减轻疾病表型,但只有谷氨酰胺能使胆管上皮细胞抵抗自然杀伤细胞的细胞毒性。因此,母体摄入丁酸盐会影响新生小鼠的粪便微生物种群和代谢物以及实验性胆道闭锁的表型表达,其中谷氨酰胺促进胆管上皮细胞的存活。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
母体摄入丁酸盐是否通过影响新生儿肠道微生物组组成与功能,调节新生小鼠对实验性胆道闭锁的易感性。
核心机制
母体丁酸盐富集新生儿肠道拟杆菌门和梭菌纲并增加谷氨酸/谷氨酰胺,谷氨酰胺通过提高胆管上皮细胞内GSH使胆管细胞抵抗NK细胞介导的细胞毒性,从而保护胆管。
主要证据
丁酸盐喂养母鼠的RRV感染新生小鼠胆管通畅、黄疸和死亡率降低;粪便16s rRNA测序和1H-NMR代谢组显示微生物与代谢物特征改变;谷氨酰胺处理提高存活率并减少NK细胞对胆管细胞的裂解,且伴随GSH升高;BA婴儿粪便中相应菌群和代谢通路呈现不足。
研究意义
提示新生儿发育中的微生物组是受母体影响、可调节生命早期疾病易感性的因素,并提出丁酸盐和/或谷氨酰胺可能用于调节BA或其他儿童肝胆疾病的免疫反应并辅助组织修复。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

母体丁酸盐喂养与RRV诱导新生小鼠胆道闭锁模型建立

验证母体摄入丁酸盐是否影响新生小鼠对实验性胆道闭锁的易感性。

孕鼠饮水给予200 mmol/L丁酸钠或对照水,新生小鼠出生24 h内腹腔注射RRV,观察黄疸、存活、血清ALT和总胆红素、EHBD和肝脏组织学及病毒滴度。

2

丁酸盐直接给药与免疫细胞表型分析

确定丁酸盐是否直接保护新生小鼠并影响肝脏免疫细胞活化。

RRV感染新生小鼠口服丁酸钠,检测黄疸、存活、病毒滴度和组织学;流式细胞术分析肝脏单个核细胞亚群;体外培养肝脏MNC并加入丁酸盐检测Il10和Foxp3 mRNA。

3

粪便微生物组与代谢物分析

寻找与疾病抵抗相关的微生物和代谢物特征。

采集母鼠分娩前及新生小鼠感染后12–14天粪便,进行16s rRNA测序OTU分析和1H-NMR代谢组学;用粪便上清刺激肝脏MNC检测Il10、Foxp3、Tnfa表达。

4

人婴儿粪便宏基因组分析

评估小鼠微生物和代谢特征与人类胆道闭锁的相关性。

对102例BA婴儿和28例正常对照粪便进行鸟枪法宏基因组测序,分析菌群组成及MetaCyc功能通路。

5

谷氨酰胺/肌苷体内干预与体外细胞毒性机制验证

验证谷氨酰胺或肌苷对胆道闭锁表型的直接作用及谷氨酰胺保护胆管细胞的机制。

RRV感染新生小鼠腹腔注射谷氨酰胺、肌苷或联合处理,检测黄疸、存活、ALT、胆红素和组织学;体外NK细胞-胆管细胞共培养检测裂解率,并检测GSH水平。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
丁酸钠Sigma-Aldrich303410
肌苷Sigma-AldrichI4125
L-谷氨酰胺Sigma-AldrichG5792
Hamilton注射器Model 1702Hamilton80201
柔性口服灌胃导管PetSurgicalMDAFN2425S
总胆红素试剂盒Pointe Scientific Inc.B7538-120
DiscretPak ALT试剂盒CatachemV164-0A
Synergy H1混合读板器BioTek--
gentleMACS组织解离器Miltenyi Biotec130-093-235
FITC抗小鼠CD3抗体eBioscience11-0032-82
Pacific Blue抗小鼠CD4抗体BioLegend100531
APC抗小鼠CD8a抗体eBioscience17-0081-81
PE/Cy7抗小鼠CD25抗体SouthernBiotech1595-17
PerCP/Cy5.5抗小鼠CD3抗体BioLegend100218
FITC抗小鼠/大鼠Foxp3抗体eBioscience11-5773-80
PE抗小鼠IL-10抗体eBioscience12-7101-41
APC抗小鼠CD49b抗体BioLegend108910
PerCP/Cy5.5抗小鼠CD11b抗体eBioscience101228
APC/Cy7抗小鼠Gr-1抗体BioLegend108424
Pacific Blue抗小鼠F4/80抗体BioLegend123124
FITC抗小鼠CD11c抗体BioLegend117306
APC-eFluor 780抗人/小鼠B220抗体eBioscience47-0452-82
APC抗小鼠PDCA-1抗体Miltenyi Biotec130-102-260
Foxp3/转录因子染色缓冲液套装Life Technologies Corporation00-5523-00
FACSCantoII双激光流式细胞仪BD Biosciences--
Percoll密度梯度分离液Sigma-AldrichP4937
miRNeasy迷你试剂盒Qiagen217004
AriaMx实时PCR系统Agilent Technologies--
小鼠NK细胞分离试剂盒Miltenyi Biotec130-115-818
重组小鼠IL-10BioLegend575804
CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒PromegaG1780
谷胱甘肽检测试剂盒BioVisionK261
Pierce BCA蛋白定量试剂盒Thermo--
NANOSEP 3K离心过滤器Pall Life SciencesOD003C34
核磁管BrukerZ112272
Bruker Avance II 600 MHz核磁共振波谱仪Bruker--
QIAamp粪便DNA迷你试剂盒Qiagen51504
Qubit双链DNA高灵敏度检测试剂盒ThermoFisher Scientific Inc.Q32854
MiSeq试剂盒v2IlluminaMS-102-2003
Illumina MiSeq测序平台Illumina--
MagPure粪便DNA KF试剂盒Angen BiotechMD5115
Qubit双链DNA BR检测试剂盒ThermoFisher ScientificQ32850
AxyPrep磁珠PCR纯化试剂盒AxygenMAG-PCR-CL-250
Agencourt AMPure XP PCR纯化试剂盒Beckman CoulterA63881
Illumina Novaseq 6000测序平台BGI-Shenzhen--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
母体丁酸盐喂养
丁酸钠浓度200 mmol/L、pH 7.5、孕期至产后4周持续给药
阅读提示:Methods 'Mice, experimental model of BA, and experimental procedures' 及 Fig. 1A
RRV诱导胆道闭锁
新生BALB/c小鼠出生24 h内腹腔注射1.5×10^6 ffu RRV(20 µl)
阅读提示:Methods 'Mice, experimental model of BA, and experimental procedures'
新生小鼠药物处理
口服丁酸盐0.3 mg/g体重每日;腹腔注射谷氨酰胺0.25 mg/g、肌苷0.2 mg/g体重隔日,均自感染后1天开始
阅读提示:Methods 'Mice, experimental model of BA, and experimental procedures' 及 Fig. 6A
体外NK细胞杀伤实验
效靶比1:16、谷氨酰胺8–16 mM、NAC 5 mM预处理2 h、共培养时间3–5 h
阅读提示:Methods 'In vitro cytotoxicity assay' 及 Fig. 7
人粪便宏基因组队列
BA 102例、对照28例,诊断时术前采集,年龄匹配范围2周至6个月
阅读提示:Methods 'Human study and stool sample collection' 及 Fig. 5A