母体丁酸盐喂养与RRV诱导新生小鼠胆道闭锁模型建立
验证母体摄入丁酸盐是否影响新生小鼠对实验性胆道闭锁的易感性。
孕鼠饮水给予200 mmol/L丁酸钠或对照水,新生小鼠出生24 h内腹腔注射RRV,观察黄疸、存活、血清ALT和总胆红素、EHBD和肝脏组织学及病毒滴度。
Maternal regulation of biliary disease in neonates via gut microbial metabolites.
含体外细胞实验、新生小鼠RRV模型、16s rRNA测序、NMR代谢组及102例BA婴儿粪便宏基因组
新生BALB/c小鼠RRV诱导胆道闭锁模型 RRV感染小鼠肝脏单个核细胞 小鼠胆管细胞系mCL 胆道闭锁婴儿粪便样本队列
母鼠饮水添加200 mmol/L丁酸钠(pH 7.5),孕期及产后4周持续给药 新生小鼠出生24 h内腹腔注射1.5×10^6 ffu RRV,对照注射PBS或生理盐水 新生小鼠口服丁酸盐0.3 mg/g体重或腹腔注射谷氨酰胺0.25 mg/g、肌苷0.2 mg/g体重,隔日给药 谷氨酰胺8–16 mM处理及NAC 5 mM预处理用于NK细胞-胆管细胞共培养杀伤实验 人粪便样本:102例BA与28例年龄匹配对照,采集诊断时术前粪便
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证母体摄入丁酸盐是否影响新生小鼠对实验性胆道闭锁的易感性。
孕鼠饮水给予200 mmol/L丁酸钠或对照水,新生小鼠出生24 h内腹腔注射RRV,观察黄疸、存活、血清ALT和总胆红素、EHBD和肝脏组织学及病毒滴度。
确定丁酸盐是否直接保护新生小鼠并影响肝脏免疫细胞活化。
RRV感染新生小鼠口服丁酸钠,检测黄疸、存活、病毒滴度和组织学;流式细胞术分析肝脏单个核细胞亚群;体外培养肝脏MNC并加入丁酸盐检测Il10和Foxp3 mRNA。
寻找与疾病抵抗相关的微生物和代谢物特征。
采集母鼠分娩前及新生小鼠感染后12–14天粪便,进行16s rRNA测序OTU分析和1H-NMR代谢组学;用粪便上清刺激肝脏MNC检测Il10、Foxp3、Tnfa表达。
评估小鼠微生物和代谢特征与人类胆道闭锁的相关性。
对102例BA婴儿和28例正常对照粪便进行鸟枪法宏基因组测序,分析菌群组成及MetaCyc功能通路。
验证谷氨酰胺或肌苷对胆道闭锁表型的直接作用及谷氨酰胺保护胆管细胞的机制。
RRV感染新生小鼠腹腔注射谷氨酰胺、肌苷或联合处理,检测黄疸、存活、ALT、胆红素和组织学;体外NK细胞-胆管细胞共培养检测裂解率,并检测GSH水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 母体给药 | 丁酸钠 | Sigma-Aldrich | 303410 |
| 新生小鼠腹腔注射 | 肌苷 | Sigma-Aldrich | I4125 |
| L-谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | G5792 | |
| 口服灌胃 | Hamilton注射器Model 1702 | Hamilton | 80201 |
| 柔性口服灌胃导管 | PetSurgical | MDAFN2425S | |
| 血浆生化检测 | 总胆红素试剂盒 | Pointe Scientific Inc. | B7538-120 |
| DiscretPak ALT试剂盒 | Catachem | V164-0A | |
| Synergy H1混合读板器 | BioTek | -- | |
| 肝脏单个核细胞分离 | gentleMACS组织解离器 | Miltenyi Biotec | 130-093-235 |
| 流式细胞术 | FITC抗小鼠CD3抗体 | eBioscience | 11-0032-82 |
| Pacific Blue抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | 100531 | |
| APC抗小鼠CD8a抗体 | eBioscience | 17-0081-81 | |
| PE/Cy7抗小鼠CD25抗体 | SouthernBiotech | 1595-17 | |
| PerCP/Cy5.5抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100218 | |
| FITC抗小鼠/大鼠Foxp3抗体 | eBioscience | 11-5773-80 | |
| PE抗小鼠IL-10抗体 | eBioscience | 12-7101-41 | |
| APC抗小鼠CD49b抗体 | BioLegend | 108910 | |
| PerCP/Cy5.5抗小鼠CD11b抗体 | eBioscience | 101228 | |
| APC/Cy7抗小鼠Gr-1抗体 | BioLegend | 108424 | |
| Pacific Blue抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123124 | |
| FITC抗小鼠CD11c抗体 | BioLegend | 117306 | |
| APC-eFluor 780抗人/小鼠B220抗体 | eBioscience | 47-0452-82 | |
| APC抗小鼠PDCA-1抗体 | Miltenyi Biotec | 130-102-260 | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | Life Technologies Corporation | 00-5523-00 | |
| 流式分析 | FACSCantoII双激光流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞培养 | Percoll密度梯度分离液 | Sigma-Aldrich | P4937 |
| RNA提取 | miRNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | 217004 |
| RT-qPCR | AriaMx实时PCR系统 | Agilent Technologies | -- |
| NK细胞分离 | 小鼠NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-115-818 |
| 细胞因子处理 | 重组小鼠IL-10 | BioLegend | 575804 |
| 细胞毒性检测 | CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G1780 |
| GSH测定 | 谷胱甘肽检测试剂盒 | BioVision | K261 |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo | -- |
| NMR代谢组学 | NANOSEP 3K离心过滤器 | Pall Life Sciences | OD003C34 |
| 核磁管 | Bruker | Z112272 | |
| Bruker Avance II 600 MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- | |
| DNA提取 | QIAamp粪便DNA迷你试剂盒 | Qiagen | 51504 |
| DNA定量 | Qubit双链DNA高灵敏度检测试剂盒 | ThermoFisher Scientific Inc. | Q32854 |
| 测序文库 | MiSeq试剂盒v2 | Illumina | MS-102-2003 |
| 测序 | Illumina MiSeq测序平台 | Illumina | -- |
| 人粪便DNA提取 | MagPure粪便DNA KF试剂盒 | Angen Biotech | MD5115 |
| 人粪便DNA定量 | Qubit双链DNA BR检测试剂盒 | ThermoFisher Scientific | Q32850 |
| 文库纯化 | AxyPrep磁珠PCR纯化试剂盒 | Axygen | MAG-PCR-CL-250 |
| Agencourt AMPure XP PCR纯化试剂盒 | Beckman Coulter | A63881 | |
| 人粪便宏基因组测序 | Illumina Novaseq 6000测序平台 | BGI-Shenzhen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 母体丁酸盐喂养 | 丁酸钠浓度200 mmol/L、pH 7.5、孕期至产后4周持续给药 阅读提示:Methods 'Mice, experimental model of BA, and experimental procedures' 及 Fig. 1A |
| RRV诱导胆道闭锁 | 新生BALB/c小鼠出生24 h内腹腔注射1.5×10^6 ffu RRV(20 µl) 阅读提示:Methods 'Mice, experimental model of BA, and experimental procedures' |
| 新生小鼠药物处理 | 口服丁酸盐0.3 mg/g体重每日;腹腔注射谷氨酰胺0.25 mg/g、肌苷0.2 mg/g体重隔日,均自感染后1天开始 阅读提示:Methods 'Mice, experimental model of BA, and experimental procedures' 及 Fig. 6A |
| 体外NK细胞杀伤实验 | 效靶比1:16、谷氨酰胺8–16 mM、NAC 5 mM预处理2 h、共培养时间3–5 h 阅读提示:Methods 'In vitro cytotoxicity assay' 及 Fig. 7 |
| 人粪便宏基因组队列 | BA 102例、对照28例,诊断时术前采集,年龄匹配范围2周至6个月 阅读提示:Methods 'Human study and stool sample collection' 及 Fig. 5A |