亚中心体定位揭示augmin-γTuRC作为中心粒稳定支架的一部分

Sub-centrosomal mapping identifies augmin-γTuRC as part of a centriole-stabilizing scaffold.

作者信息Nina Schweizer, Laurence Haren, Ilaria Dutto, Ricardo Viais, Cristina Lacasa, Andreas Merdes, Jens Lüders
PMID34654813
发布时间2021-10-15
DOI10.1038/s41467-021-26252-5

实验完整度

高

结合ExM/U-ExM/RIM成像、RNAi/敲除、BioID质谱、多种细胞系及患者成纤维细胞和条件敲除小鼠神经元,进行功能与机制验证。

主要模型

U2OS细胞系 hTERT RPE1 p53 KO细胞系 患者来源GCP4突变成纤维细胞 条件性Haus6敲除小鼠海马神经元

重点核对

siRNA序列及转染试剂:CEP192 5′-AAGGAAGACAUUUUCAUCUCU-3′、HAUS6 5′-CAGUUAAGCAGGUACGAA-3′等,Lipofectamine RNAiMAX 同步化方案:10 µM STLC处理约18小时,10 µM RO-3306释放入G1,或100 nM BI2536共处理 VX-680处理:1 µM处理约72小时以产生多倍体细胞 血清饥饿诱导纤毛发生:48小时 BioID:50 µM生物素过夜标记,链霉亲和素富集,质谱鉴定

摘要

中心粒的生物发生和维持对于细胞生成纤毛和组装作为微管组织中心(MTOC)的中心体至关重要。中心粒生物发生和MTOC功能都需要微管成核因子γ-微管蛋白环复合物(γTuRC)。普遍认为γTuRC从与中心粒近端相关的中心粒周围物质(PCM)中使微管成核。然而,γTuRC也定位在更远端和中心粒腔内,但这些发现的意义尚不清楚。在此,我们鉴定了中心体γTuRC在空间和功能上不同的亚群。腔定位由augmin介导,augmin通过POC5与中心粒内支架相连。破坏腔定位会损害中心粒完整性并干扰纤毛组装。在患有小头畸形伴脉络膜视网膜病变患者的γTuRC突变成纤维细胞中也观察到纤毛发生缺陷。这些结果鉴定了augmin-γTuRC在中心粒腔内的非经典作用,并与人类疾病相关。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
中心体γTuRC的亚中心体分布是否与其功能相关,特别是中心粒腔内的γTuRC有何作用?
核心机制
POC5在内支架招募augmin,augmin进而招募γTuRC至中心粒腔;腔内的augmin-γTuRC以不依赖微管成核的方式维持中心粒完整性并促进纤毛组装。
主要证据
ExM/U-ExM/RIM显示γTuRC与augmin在中心粒腔共定位且依赖POC5;RNAi或敲除POC5、HAUS6、GCP4导致中心粒腔γTuRC丢失、中心粒稳定性下降、长度缩短和纤毛发生缺陷;患者GCP4突变成纤维细胞纤毛发生减少且腔GCP4信号降低。
研究意义
鉴定了augmin-γTuRC在中心粒腔内的非经典作用,提示某些人类遗传病的表型可能不仅与微管成核功能相关,也与该腔內角色保障中心粒完整性从而允许纤毛发生有关。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

中心体γTuRC亚群定位分析

确定γTuRC在中心粒上的空间分布是否均一。

利用ExM观察U2OS细胞中NEDD1、γ-tubulin、GCP4与中心粒标记的共定位,并与PCM组分CDK5RAP2和pericentrin比较;进行微管再生实验分析成核位点。

2

腔定位依赖augmin和POC5的验证

检验中心粒腔γTuRC的招募机制。

通过siRNA敲低CEP192、HAUS6、HAUS5、NEDD1或POC5,利用ExM/U-ExM分析中心粒壁和腔中γ-tubulin、HAUS6、POC5的定位;在条件性Haus6敲除神经元中验证。

3

augmin与POC5相互作用的鉴定

寻找与augmin相互作用的中心粒腔蛋白。

在稳定表达BirA-HAUS6的U2OS细胞中进行BioID,链霉亲和素富集后质谱鉴定邻近蛋白;用ExM/U-ExM/RIM分析POC5、HAUS6和γ-tubulin的相对定位。

4

中心粒稳定性功能验证

检测POC5、augmin和γTuRC对中心粒完整性的影响。

在对照和POC5、HAUS6或GCP4敲低细胞中,利用STLC延长有丝分裂时间,计数centrin或centrobin焦点;在RPE1细胞中重复HAUS6敲低实验。

5

中心粒长度和结构分析

评估augmin缺失对中心粒形态的影响。

用VX-680处理对照和HAUS6敲低或敲除细胞,U-ExM测量中心粒长度和直径,免疫荧光检测CP110、ninein等标志物。

6

纤毛发生功能验证

确定POC5、GCP4和γTuRC对纤毛组装的影响。

在RPE1细胞中敲低POC5或GCP4,血清饥饿诱导纤毛发生,计数纤毛并测量长度;分析GCP4突变患者成纤维细胞的纤毛发生和中心粒腔GCP4信号。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基----
DMEM/F12培养基----
胎牛血清----
Lipofectamine 2000转染试剂Invitrogen--
遗传霉素----
Lipofectamine RNAiMAX转染试剂Invitrogen--
STLC----
RO-3306----
BI2536----
VX-680----
多西环素----
ProLong Gold抗淬灭封片剂Thermofisher--
DAPI----
小鼠抗γ-微管蛋白抗体(TU-30)ExbioTU-30
兔抗α-微管蛋白抗体(ab18251)Abcamab18251
小鼠抗乙酰化α-微管蛋白抗体(克隆6-11B-1)Merck6-11B-1
小鼠抗多聚谷氨酰化微管蛋白抗体(GT335)AdipoGenGT335
兔抗GFP抗体(A6455)InvitrogenA6455
鸡抗GFP抗体(GFP-1020)Aves LabsGFP-1020
小鼠抗centrin 1抗体(克隆20H5)Millipore20H5
兔抗POC5抗体(A303-341A)Bethyl LaboratoriesA303-341A
小鼠抗SAS-6抗体(sc-81431)Santa Cruzsc-81431
兔抗ODF2抗体(43840)Abcam43840
小鼠抗ARL13B抗体(sc-515784)Santa Cruzsc-515784
兔抗CP110抗体(12780-1-AP)Proteintech12780-1-AP
兔抗CEP164抗体(22227-1-AP)Proteintech22227-1-AP
小鼠抗GAPDH抗体(sc-47724)Santa Cruz Biotechnologysc-47724
辣根过氧化物酶偶联的山羊抗小鼠或山羊抗兔二抗(AB_10015289, AB_2313567)Jackson ImmunoResearch LaboratoriesAB_10015289, AB_2313567
生物素----
链霉亲和素琼脂糖树脂----
涡轮核酸酶Sigma Aldrich--
Orbitrap Fusion Lumos三合一质谱仪Thermo Scientific--
Dionex Ultimate 3000色谱系统Thermo Scientific--
Acclaim PepMapR RSLC C18分析柱Thermo Scientific--
Orca AG相机Hamamatsu--
Leica DMI6000B显微镜Leica--
MRm相机Zeiss--
Axiovert 200 M显微镜Zeiss--
Orca-flash4 V2 + CMOS相机Hamamatsu--
配备Yokogawa CSU-X1 5000 rpm转盘单元的Leica Dmi8显微镜Leica--
QXGA SLM Fourth Dimension空间光调制器Fourth Dimension--
Nikon Eclipse Ti-E显微镜Nikon--
ORCA FLASH FUSION sCMOS相机Hamamatsu--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
中心粒腔蛋白定位分析
细胞系(U2OS)、ExM/U-ExM样品制备、抗体稀释比例、成像设备参数
阅读提示:Methods中“Immunofluorescence microscopy (IF) and expansion microscopy (ExM)”及“Ultra expansion microscopy (U-ExM)”小节;Fig. 1、2、3图注
RNAi敲低实验
siRNA序列、转染试剂、转染次数与时间、同步化方案(STLC/RO-3306浓度与时间)
阅读提示:Methods中“RNA interference”和“Cell culture treatments and assays”小节
BioID邻近标记
生物素浓度与标记时间、裂解缓冲液、链霉亲和素富集条件、质谱参数
阅读提示:Methods中“BioID”和“Mass spectrometry analysis”小节;Fig. 3a图注
中心粒稳定性与长度分析
STLC/BI2536/VX-680浓度与处理时间、计数标准(centrin或centrobin焦点数)、U-ExM测量方法
阅读提示:Methods中“Cell culture treatments and assays”及“Length measurements”小节;Fig. 4、5图注
纤毛发生实验
血清饥饿时长、细胞系(RPE1 p53 KO、患者成纤维细胞)、纤毛标记抗体、计数标准
阅读提示:Methods中“Cell culture treatments and assays”小节;Fig. 6图注