NK细胞特异性HIF-1α敲除小鼠构建与皮肤稳态表型分析
验证NK细胞中HIF-1α缺失对皮肤免疫细胞组成的影响
将loxP-flanked Hif1a等位基因与Ncr1(NKp46)启动子驱动的Cre重组酶杂交获得HIF-1α KO小鼠,对稳态皮肤进行免疫表型分析
NK cells in hypoxic skin mediate a trade-off between wound healing and antibacterial defence.
含NK细胞特异性基因敲除小鼠、离体NK细胞功能实验、RNA测序及体外杀菌实验等多层验证
HIF-1α fl/fl Ncr1-Cre小鼠(NK细胞特异性HIF-1α敲除) VHL fl/fl Ncr1-Cre小鼠(NK细胞特异性VHL敲除) HIF-2α fl/fl Ncr1-Cre小鼠 离体纯化脾脏NK细胞
HIF-1α KO小鼠与WT同窝对照的皮肤伤口闭合面积于第2、4、6天测量 NK1.1抗体PK136按4 mg/kg体重腹腔注射于第-2、0、2、4天清除NK细胞 GAS经皮下接种约10^7 CFU并检测第2、4天皮肤病灶及脾脏CFU 纯化脾脏NK细胞与GAS按MOI=1在常氧(20% O2)或低氧(2% O2)下共培养4 h测定CFU RNA测序比较第2天伤口或GAS病灶中WT与HIF-1α KO的差异表达基因
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证NK细胞中HIF-1α缺失对皮肤免疫细胞组成的影响
将loxP-flanked Hif1a等位基因与Ncr1(NKp46)启动子驱动的Cre重组酶杂交获得HIF-1α KO小鼠,对稳态皮肤进行免疫表型分析
检验NK细胞HIF-1α对伤口愈合速度的影响
在背部皮肤制作4个6 mm全层圆形切除伤口,隔日测量伤口面积至第6天
验证NK细胞对伤口愈合和血管生成的贡献
在致伤前使用抗NK1.1抗体PK136腹腔注射清除NK细胞,对照注射同型对照抗体
评估HIF-1α缺失对血管生成和炎症/修复型巨噬细胞平衡的影响
对伤口组织进行CD31免疫组化定量血管密度,流式检测M1(CD80+、MHCII+)和M2(CD206+)巨噬细胞及Arg1/Nos2表达比
确定NK细胞HIF-1α缺失对皮肤整体转录程序的影响
对第2天伤口或GAS病灶进行RNA测序和GO富集分析
检测HIF-1α缺失是否促进细菌从伤口向全身播散
将Alexa Fluor 488标记的金黄色葡萄球菌BioParticles注射至第4天伤口边缘,45分钟后流式检测脾脏中颗粒
验证NK细胞HIF-1α在抗菌防御中的作用
将GAS与Cytodex珠混合后皮下接种,监测皮肤坏死病灶大小及脾脏和病灶CFU
检验NK细胞是否以HIF-1α依赖方式直接杀伤细菌
纯化脾脏NK细胞与GAS按MOI=1共培养4小时,铺板计数CFU
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| NK细胞清除 | 抗NK1.1单克隆抗体PK136 | -- | -- |
| 细菌培养 | Todd-Hewitt肉汤 | Sigma | T1438 |
| GAS感染模型 | Cytodex珠 | Sigma | C0646 |
| 组织消化 | gentleMACS C管 | Miltenyi | 130-093237 |
| Dispase II | Roche | 04942078001 | |
| Liberase TL | Roche | 5401119001 | |
| DNA酶I | Roche | 04716728001 | |
| 细胞刺激 | 细胞刺激混合物(含蛋白转运抑制剂) | eBioscience | 00-4975-93 |
| 胞内染色 | 固定/透化试剂 | BD-Bioscience | 554714 |
| 流式分析 | LIVE/DEAD可固定Aqua死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher | L34957 |
| 胞内染色 | 胞内固定与透化缓冲液套装 | eBioscience | 88-8824-00 |
| 核染色 | Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | 00-5523-00 |
| NK细胞纯化 | NK细胞分离试剂盒II | Miltenyi | 130-115-818 |
| LS柱 | Miltenyi | 130-042-401 | |
| MidiMACS分离器 | Miltenyi | 130-042-302 | |
| NK细胞分离试剂盒 | Stem Cell Technologies | 19855 | |
| 增殖实验 | CFSE | ThermoFisher | C34554 |
| 白细胞介素-2 | PeproTech | 212-12 | |
| LIVE/DEAD可固定近红外死细胞染色剂 | ThermoFisher | L34975 | |
| 迁移实验 | Transwell迁移小室 | Corning | 3421 |
| CCL5趋化因子 | PeproTech | 500-P118 | |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| RT-qPCR | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 |
| SYBR Green I Master混合物 | Roche | 04887352001 | |
| 划痕实验 | 血管内皮生长因子A | Lonza | LONCC-3156 |
| GAS激活实验 | 高尔基体阻断剂 | ThermoFisher | 554724 |
| 高尔基体阻断剂 | ThermoFisher | 555029 | |
| 免疫组化抗原修复 | 柠檬酸缓冲液 | Dako | S2369 |
| 免疫组化 | 亲和素/生物素封闭试剂盒 | VectorLabs | SP-2001 |
| ABC试剂盒 | VectorLabs | PK-6100 | |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342 | Sigma | 14533 |
| 免疫组化 | 大鼠抗CD31抗体 | DIANOVA | DIA-310 |
| 山羊抗NKp46抗体 | R&D | AF2225 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 皮肤切除伤口模型 | 伤口数量与直径(4个6 mm全层圆形切除伤口)、麻醉与镇痛方案、测量时间点(第0至6天隔日) 阅读提示:Methods中Excisional skin wounds和Macroscopic wound size measurement小节 |
| NK细胞清除 | PK136剂量(4 mg/kg体重)、注射时间点(第-2、0、2、4天)、同型对照体积(100 μl) 阅读提示:Methods中Depletion of NK cells during wound healing小节及Fig. 1c |
| GAS皮肤感染模型 | GAS菌株(5448)、接种量(约10^7 CFU)、Cytodex珠混合比例、检测时间点(48或96 h) 阅读提示:Methods中Bacterial strains and media和Mouse model of GAS infection小节 |
| 体外杀菌实验 | MOI(1)、常氧(20% O2)与低氧(2% O2)条件、共培养时间(4 h)、CFU计数方法 阅读提示:Methods中Bacterial killing assays小节及Fig. 7c图注 |
| RNA测序 | 每组动物数(3只WT和3只KO)、差异表达阈值(log2FC 0.5,P<0.05)、GO分析工具 阅读提示:Methods中RNAseq小节及Fig. 2h、Fig. 5h图注 |