建立多种同系小鼠转移模型并评估YB1抗转移效果
验证YB1抑制癌症转移是否具有广谱性及剂量依赖性。
用4T1-BALB/c原位和实验性肺转移模型,以及CT26、MB49、B16F10、L1210等实验性转移模型,尾静脉给予YB1后计数肺转移结节或活体成像。
IFN-γ-dependent NK cell activation is essential to metastasis suppression by engineered Salmonella.
多种同系小鼠转移模型、IFN-γ敲除小鼠、NK细胞抗体清除、CyTOF免疫分析、NK细胞功能与细胞毒性实验
4T1-BALB/c原位及实验性肺转移模型 CT26、MB49、B16F10、L1210实验性转移模型 NOD SCID及NSG免疫缺陷小鼠模型 IFN-γ敲除C57BL/6J小鼠MB49实验性转移模型
YB1给药剂量:BALB/c小鼠2×10^7 CFU,NOD SCID、NSG、C57BL/6J及IFN-γ敲除小鼠8×10^6 CFU,尾静脉注射 IFN-γ中和抗体1.25 mg/kg于第0、2、4天腹腔注射,对照为anti-mouse IgG NK细胞清除用anti-Asialo-GM1抗体30 µL于第−1、1、3天及20 µL于第7、10、13天腹腔注射 4T1实验性转移模型:1×10^5细胞尾静脉注射;MB49为8×10^5细胞 主要检测终点:肺转移结节计数、荧光素酶活体成像、CyTOF及流式细胞术
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证YB1抑制癌症转移是否具有广谱性及剂量依赖性。
用4T1-BALB/c原位和实验性肺转移模型,以及CT26、MB49、B16F10、L1210等实验性转移模型,尾静脉给予YB1后计数肺转移结节或活体成像。
明确YB1作用于转移的早期定植还是已形成的转移灶。
在原位模型不同时间点(第7、12、19天)给予YB1,并用荧光素酶标记的4T1-Luci和MB49-Luci追踪尾静脉注射后癌细胞在肺部的早期存活。
确定YB1抗转移所依赖的关键炎症因子。
用中和抗体清除TNF-α或IFN-γ,在IFN-γ敲除小鼠中建立MB49实验性转移模型,并单独给予重组IFN-γ。
判断适应性免疫是否必要。
在无功能性B、T细胞的NOD SCID小鼠中建立4T1原位和实验性转移模型,评估YB1效果。
筛选参与YB1抗转移的先天免疫细胞亚群。
对PBS、YB1、YB1+抗IFN-γ三组NOD SCID小鼠肺浸润免疫细胞进行CyTOF,t-SNE降维和PhenoGraph聚类。
确认NK细胞而非中性粒细胞或嗜碱性粒细胞是抗转移关键。
用anti-Asialo-GM1清除NK细胞、anti-Ly6G清除中性粒细胞,并在NSG小鼠中验证。
验证IFN-γ对NK细胞积累、活化和杀伤功能的正反馈调控。
流式检测肺浸润NK细胞表型、IFN-γ产生、CD107a脱颗粒及对YAC-1的杀伤,并在IFN-γ清除后复测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 二氨基庚二酸 | Sigma | D1377-5G |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- | |
| 组织消化 | IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C5138 |
| IV型DNase I | Sigma-Aldrich | D5025 | |
| 活体成像 | D-荧光素 | Gold Biotechnology | -- |
| PE IVIS Spectrum活体成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 细胞因子定量 | 小鼠Th1/Th2 10plex FlowCytomix多重试剂盒 | eBioscience | BMS820FF |
| 定制ProcartaPlex多重免疫分析panel | eBioscience | -- | |
| 血清IFN-γ定量 | ELISA试剂盒 | ThermoFisher Scientific | KMC4022 |
| 血浆TNF-α定量 | ELISA试剂盒 | R&D | MTA00B |
| 流式细胞术 | BD LSR Fortessa分析仪 | BD | -- |
| ACEA Novocyte流式细胞仪 | ACEA | -- | |
| 流式细胞术固定破膜 | 固定破膜试剂盒 | BD | 554714 |
| CyTOF | 顺铂 | Fluidigm | -- |
| Maxpar固定I缓冲液 | Fluidigm | -- | |
| Maxpar Perm-S缓冲液 | Fluidigm | -- | |
| EQ四元素校准微球 | Fluidigm | -- | |
| CyTOF2质谱流式仪 | Fluidigm | Version 6.7.1014 | |
| NK细胞清除 | 抗Asialo-GM1抗体 | BioLegend | 146002 |
| NK细胞清除对照 | 兔多克隆IgG | BioXcell | BE0095 |
| 中性粒细胞清除 | 抗Ly6G抗体 | BioXCell | BP0075-1 |
| 中性粒细胞清除对照 | 大鼠IgG2A | BioXCell | BP0089 |
| 细胞因子中和 | 抗TNF-α抗体 | eBioscience | 16-7423-81 |
| 抗IFN-γ抗体 | eBioscience | 16-7411-85 | |
| 细胞因子中和对照 | 抗小鼠IgG | eBioscience | 16-4888-38 |
| IFN-γ处理 | 重组IFN-γ | BioLegend | -- |
| NK细胞纯化 | NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-115-818 |
| 杀伤实验靶细胞标记 | 细胞示踪紫 | ThermoFisher | C34571 |
| 免疫抑制 | 泼尼松龙 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| YB1给药与转移模型建立 | YB1剂量(BALB/c 2×10^7 CFU;NOD SCID、NSG、C57BL/6J、IFN-γ敲除小鼠8×10^6 CFU)、给药途径(尾静脉)、给药与癌细胞接种时间间隔(3天或6天) 阅读提示:Methods中Bacterial treatment及Orthotopic and experimental metastasis models小节,Fig. 1、2图注 |
| IFN-γ中和与敲除验证 | 抗IFN-γ抗体剂量1.25 mg/kg、腹腔注射时间第0、2、4天、对照抗体;IFN-γ敲除小鼠品系JAX stock #002287 阅读提示:Methods中Antibody-mediated depletion of cytokines小节及Animals小节,Fig. 3d–f图注 |
| NK细胞清除 | anti-Asialo-GM1剂量30 µL(第−1、1、3天)和20 µL(第7、10、13天)、腹腔注射、对照抗体、清除效率验证(外周血CD3−NKp46+细胞缺失) 阅读提示:Methods中NK cell depletion in vivo小节,Fig. 6a–c图注 |
| CyTOF免疫细胞分析 | 取材时间第5天、每组n=4、活细胞门控CD45+、t-SNE和PhenoGraph分析参数、18个细胞簇定义 阅读提示:Methods中Mass cytometry (CyTOF) analysis小节,Fig. 5图注及Supplementary Table 1 |
| NK细胞功能与细胞毒性检测 | PMA/Ionomycin刺激5 h、YAC-1共培养5 h(脱颗粒)或4 h(杀伤)、效靶比3:1、2:1、1:1、每组n=3–4 阅读提示:Methods中Degranulation assay、Flow cytometry-based killing assay小节,Fig. 6g–i、7h–j图注 |