染色体不稳定的肿瘤细胞特异性依赖KIF18A进行增殖

Chromosomally unstable tumor cells specifically require KIF18A for proliferation.

作者信息Carolyn Marquis, Cindy L Fonseca, Katelyn A Queen, Lisa Wood, Sarah E Vandal, Heidi L H Malaby, Joseph E Clayton, Jason Stumpff
PMID33619254
发布时间2021-02-22
DOI10.1038/s41467-021-21447-2

实验完整度

高

包含多种CIN和近二倍体细胞系体外增殖、有丝分裂、纺锤体形态、中心体完整性及活细胞成像验证,并涉及信号通路机制解析。

主要模型

染色体不稳定三阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-231、MDA-MB-468和HCC1806 染色体不稳定结直肠癌细胞系HT29、LoVo、SW480和LS1034 近二倍体细胞系MCF10A、HCT116 HeLa Kyoto细胞

重点核对

siRNA浓度5 pmol,转染试剂Lipofectamine RNAiMAX,双敲低时浓度降至0.7倍 紫杉醇处理浓度:20 nM(3小时)或10 nM(24小时),诺考达唑5 μM(3小时),monastrol 20 μM,UMK57 500 nM 活细胞成像每2分钟拍摄一次,持续16-20小时;固定细胞免疫荧光使用γ-tubulin、α-tubulin、centrin-1等抗体 细胞增殖检测使用Cytation 5成像系统,每2小时拍摄一次,持续96小时

摘要

染色体不稳定(CIN)是肿瘤细胞的特征,由微管动力学和控制异常导致有丝分裂纺锤体缺陷引起。因此,CIN细胞对靶向有丝分裂纺锤体调节的治疗反应可能与二倍体细胞不同。本文通过抑制参与有丝分裂纺锤体控制的驱动蛋白亚群来验证这一设想。KIF18A是三阴性乳腺癌或结直肠癌来源的CIN细胞增殖所必需的,但近二倍体细胞则不需要。抑制KIF18A后,CIN肿瘤细胞表现出有丝分裂延迟、多极纺锤体和细胞死亡增加。对KIF18A敲低的敏感性与中心体碎裂强相关,后者需要动态微管,但不依赖双极纺锤体形成或有丝分裂阻滞。结果表明,CIN肿瘤细胞特有的纺锤体微管动力学改变可用于降低CIN细胞的增殖能力。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
染色体不稳定的肿瘤细胞是否对参与有丝分裂纺锤体控制的驱动蛋白(如KIF18A)抑制具有选择性依赖,从而为靶向CIN肿瘤提供治疗策略。
核心机制
CIN细胞中微管聚合增强,导致对有丝分裂驱动蛋白KIF18A的更强依赖;KIF18A缺失引起纺锤体微管动力学失衡,导致中心体碎片化和多极纺锤体形成,进而抑制增殖并诱导细胞死亡。
主要证据
在多种CIN肿瘤细胞系和近二倍体细胞中比较KIF18A敲低效果,发现CIN细胞增殖显著受抑、有丝分裂延迟、多极纺锤体增加和细胞死亡增加;中心体碎裂与敏感性相关,且需要动态微管;紫杉醇和诺考达唑可减少KIF18A敲低诱导的多极纺锤体;UMK57或KIF2C过表达增强缺陷。
研究意义
KIF18A可能成为特异性抑制CIN肿瘤细胞生长而毒性较低的有效靶点,为利用CIN肿瘤细胞特有的微管动力学弱点提供治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

比较KIF18A敲低对CIN和近二倍体细胞增殖的影响

验证CIN肿瘤细胞是否特异性依赖KIF18A进行增殖。

使用多种CIN肿瘤细胞系(MDA-MB-231、MDA-MB-468、HCC1806、HT29、LoVo、SW480、LS1034、HeLa Kyoto)和近二倍体细胞(MCF10A、HCT116),通过siRNA敲低KIF18A,利用自动化活细胞成像评估细胞密度变化。

2

检测KIF18A敲低对细胞死亡的影响

探究KIF18A敲低是否诱导CIN细胞死亡。

在HT29和MCF10A细胞中敲低KIF18A,使用CellTox Green染料标记死亡细胞,通过活细胞成像计算相对细胞死亡;Western blot检测cleaved-caspase 3表达。

3

分析KIF18A敲低对有丝分裂进程的影响

确定KIF18A敲低是否引起CIN细胞有丝分裂延迟或阻滞。

在CIN和近二倍体细胞中敲低KIF18A,通过固定细胞免疫荧光计算有丝分裂指数,通过DIC活细胞成像测量核膜破裂(NEB)至后期起始(AO)时间及有丝分裂失败比例。

4

评估KIF18A敲低对纺锤体形态和中心体完整性的影响

检验KIF18A敲低是否诱导多极纺锤体和中心体碎片化。

固定细胞免疫荧光标记γ-tubulin、α-tubulin和centrin-1,计数多极纺锤体(≥3个γ-tubulin聚集中心);活细胞成像使用SiR-tubulin标记微管,观察纺锤体极分裂。

5

确定动态微管在KIF18A敲低诱导的中心体碎片化中的作用

验证动态微管是否为中心体碎片化所必需。

在KIF18A敲低的MDA-MB-231细胞中,分别用紫杉醇(20 nM)或诺考达唑(5 μM)处理3小时,固定后分析多极纺锤体比例;比较临床相关浓度紫杉醇(10 nM,24小时)对MDA-MB-231和MCF10A细胞纺锤体形态的影响。

6

检验双极纺锤体形成和KIF11依赖性微管滑动在中心体碎片化中的作用

判断中心体碎片化是否依赖双极纺锤体或KIF11产生的力。

在KIF18A敲低的MDA-MB-231细胞中,使用monastrol(20 μM)诱导单极纺锤体,分析中心体碎片化;并测试紫杉醇(20 nM)对单极纺锤体中心体碎片化的影响。

7

探究增加微管动力学对KIF18A敲低效应的影响

验证增加动粒微管周转是否增强KIF18A敲低诱导的缺陷。

在KIF18A敲低的MDA-MB-231细胞中,使用UMK57(500 nM)处理或过表达mCherry-MCAK或mCherry-CPB-MCAK,检测增殖、有丝分裂指数和多极纺锤体。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM/F-12培养基Gibco--
RPMI 1640培养基Gibco--
McCoys 5A培养基Gibco--
马血清Gibco--
Lipofectamine RNAiMAX转染试剂Invitrogen--
Opti-MEM减血清培养基Gibco--
Silencer和Silencer Select KIF18A siRNAInvitrogen--
KIF18B siRNADharmacon--
KIF4A siRNAInvitrogen--
KID/KIF22 siRNAInvitrogen--
MCAK/KIF2C siRNADharmacon--
MAD2 siRNAInvitrogen--
CLASP1 siRNADharmacon--
HSET/KIFC1 siRNADharmacon--
乱序序列阴性对照siRNAInvitrogen--
紫杉醇Selleck Chemicals--
诺考达唑Selleck Chemicals--
monastrolSelleck Chemicals--
UMK57Duane Compton--
Cytation 5细胞成像多模式阅读器Biotek--
Gen5软件Biotek--
Biospa 8自动化培养箱Biotek--
CellTox绿色染料PromegaG8742
Hoechst染料InvitrogenH3570
小鼠抗α-微管蛋白(DM1α)Millipore SigmaT6199
人抗着丝点抗体(ACA)antibodies Incorporated15-235
兔抗γ-微管蛋白Abcamab11317
小鼠抗γ-微管蛋白Sigma-AldrichT5326
兔抗KIF18ABethyl LaboratoriesA301-080A
小鼠抗centrin-1Millipore Sigma04-1624
兔抗mCherryAbcamab167453
Alexa Fluor 488、594和647二抗Molecular Probes--
含DAPI的Prolong Gold抗淬灭封片剂Molecular Probes--
Ti-E或Ti-2E倒置显微镜Nikon Instruments--
NIS Elements软件Nikon Instruments--
Clara冷却电荷耦合器件(CCD)相机Andor--
Prime Bsi sCMOS相机Teledyne Photometrics--
Spectra-X光源Lumencore--
SiR-微管蛋白CytoskeletonCY-SC002
4-15%梯度胶BioRad--
PVDF膜BioRad--
Odyssey封闭缓冲液Li-Cor--
小鼠抗GAPDHMilliporeMAB374
兔抗KIF18ABethyl LaboratoriesA301-080A
兔抗Kif4ABethyl LaboratoriesA301-074A
兔抗KIF22Millipore SigmaHPA048213
兔抗MCAKAbcamab187652
兔抗MAD2Bethyl LaboratoriesA300-301A
兔抗Cleaved Caspase-3Cell Signaling Technology9661
山羊抗兔IgG DyLight 800偶联物InvitrogenSA5-10036
山羊抗小鼠IgG DyLight 680InvitrogenSA5-10170
Odyssey CLx成像系统Li-Cor--
RNeasy Mini试剂盒Qiagen--
2100 BioanalyzerAgilent Technologies--
人GAPDH Taqman探针(Hs01015428_m1)Thermo Fisher ScientificHs01015428_m1
人KIF18A Taqman探针(Hs02786624_g1)Thermo Fisher ScientificHs02786624_g1
Promega GenePrint® 10系统PromegaB9510
4D核转染系统Lonza--
LTX转染试剂Thermo Fisher Scientific--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞增殖检测
细胞系来源(ATCC)、培养基类型、血清浓度、siRNA浓度(5 pmol)、转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX)、成像时间(96小时)、数据分析方法(归一化至对照)
阅读提示:Methods: Cell culture and transfections; Proliferation and cytotoxicity assays; Figure 1 legend
有丝分裂时长分析
活细胞成像间隔(2分钟)、成像时长(16-20小时)、NEB和AO定义、细胞系、siRNA处理时间(24小时前)
阅读提示:Methods: Live imaging; Mitotic timing and mitotic index analyses; Figure 3 legend
多极纺锤体分析
固定和染色方法(甲醇或PFA/甲醇)、抗体稀释比例、多极纺锤体定义(≥3个γ-tubulin聚集中心)、成像物镜(40x、60x、100x)、z轴切片间隔(200 nm)
阅读提示:Methods: Immunofluorescence; Mitotic spindle morphology analyses; Figure 4 legend
药物处理实验
药物浓度(紫杉醇20 nM或10 nM、诺考达唑5 μM、monastrol 20 μM、UMK57 500 nM)、处理时间(3小时或24小时)、溶剂对照(DMSO)、加药时间(siRNA后24小时)
阅读提示:Methods: Drug treatments; Figure 6 and Figure 7 legends; Figure 8 legend
siRNA敲低效率验证
siRNA来源和序列、qRT-PCR引物(KIF18A Hs02786624_g1, GAPDH Hs01015428_m1)、Western blot抗体、敲低效率计算
阅读提示:Methods: Knockdown quantification analysis; qRT-PCR; Supplementary Fig. 1