TET1是米色脂肪细胞选择性产热表观遗传抑制因子

TET1 is a beige adipocyte-selective epigenetic suppressor of thermogenesis.

作者信息Sneha Damal Villivalam, Dongjoo You, Jinse Kim, Hee Woong Lim, Han Xiao, Pete-James H Zushin, Yasuo Oguri, Pouya Amin, Sona Kang
PMID32855402
发布时间2020-08-27
DOI10.1038/s41467-020-18054-y

实验完整度

高

含离体米色脂肪细胞增益/缺失功能、脂肪选择性敲除小鼠体内代谢表型、ChIP及RNA-Seq机制验证

主要模型

永生化米色和棕色脂肪细胞系 3T3-L1白色脂肪细胞 原代腹股沟白色脂肪细胞 Fabp4-Cre脂肪选择性Tet1敲除小鼠

重点核对

米色脂肪细胞中Tet1敲低或过表达后,Forskolin刺激下Ucp1等产热基因表达及线粒体呼吸变化 Adi-Tet1KO小鼠在4°C冷暴露下的直肠核心体温、氧气消耗及血清甘油水平 高脂饮食(60%热量来自脂肪)喂养后体重、体成分、胰岛素和葡萄糖耐量 Tet1突变体(Tet1∆CD、Tet1CD、Tet1CDM)过表达对Ucp1的抑制效应 TET1与HDAC1共免疫沉淀及ChIP-reChIP在Ucp1和Ppargc1a调控区的共结合

摘要

已有研究提示米色脂肪产热受到感知温度等环境信号的表观遗传调控因子严密控制。本文报道,皮下脂肪中DNA去甲基化酶TET1的表达受寒冷及其他米色脂肪细胞产热刺激因子抑制。TET1在米色脂肪细胞中作为关键产热基因(包括Ucp1和Ppargc1a)的自主抑制因子发挥作用。利用Fabp4-Cre构建的脂肪选择性Tet1敲除小鼠耐寒能力改善、能量消耗增加,并抵抗饮食诱导的肥胖和胰岛素抵抗。此外,TET1对米色脂肪细胞产热基因调控的抑制作用在很大程度上不依赖DNA去甲基化酶活性。相反,TET1与HDAC1协同介导表观遗传改变以抑制产热基因转录。综上,TET1是米色脂肪选择性产热基因程序的强效表观遗传破坏因子。我们的发现可能为增加肥胖及相关代谢紊乱中能量消耗的治疗策略提供线索。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
TET1是否在米色脂肪细胞中作为表观遗传调控因子抑制产热基因程序,及其作用是否依赖DNA去甲基化酶活性。
核心机制
TET1与HDAC1协同介导表观遗传改变,抑制Ucp1和Ppargc1a等产热基因转录,且该抑制作用 largely 不依赖其DNA去甲基化酶活性。
主要证据
在永生化米色脂肪细胞中Tet1敲低增强、过表达抑制Forskolin诱导的产热基因表达和线粒体呼吸;脂肪选择性Tet1敲除小鼠耐寒能力改善、能量消耗增加并抵抗饮食诱导肥胖和胰岛素抵抗;Co-IP和ChIP-reChIP证实TET1与HDAC1在Ucp1和Ppargc1a调控区共结合。
研究意义
提示TET1是米色脂肪选择性产热基因程序的表观遗传破坏因子,其发现可能为增加肥胖及相关代谢紊乱能量消耗的治疗策略提供线索。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

温度与cAMP信号对TET1表达的调控分析

确定TET1表达是否受产热刺激调控并与Ucp1表达呈负相关。

比较野生型C57BL/6J小鼠在室温、4°C寒冷或30°C热中性环境24小时后iWAT、eWAT和BAT中Tet1和Ucp1的mRNA及蛋白表达;在3T3-L1、永生化米色和棕色脂肪细胞分化前后检测TET1表达;在原代米色脂肪细胞中用Forskolin或去甲肾上腺素刺激3小时检测Tet1和Ucp1 mRNA。

2

TET1在米色脂肪细胞中的细胞自主功能验证

检验TET1是否以细胞自主方式抑制米色脂肪细胞产热基因表达和线粒体呼吸。

在成熟永生化米色脂肪细胞中用shRNA敲低Tet1、Tet2或Tet3,或用慢病毒过表达Tet1,检测Forskolin刺激下Ucp1、Ppargc1a、Cidea、Elovl3等产热基因表达,以及基础和去甲肾上腺素刺激下的线粒体呼吸。

3

脂肪选择性Tet1敲除小鼠的体内代谢表型分析

确定TET1在体内对寒冷耐受、能量消耗和饮食诱导肥胖的调控作用。

利用Fabp4-Cre构建脂肪选择性Tet1敲除小鼠(Adi-Tet1KO),在4°C冷暴露下监测直肠温度、氧气消耗和血清甘油;冷暴露7天后检测iWAT和BAT组织学及UCP1、PGC1α蛋白表达和线粒体呼吸;高脂饮食喂养后评估体重、体成分、胰岛素和葡萄糖耐量。

4

TET1作用是否依赖DNA去甲基化酶活性的遗传与药理学验证

判断TET1对产热基因的抑制是否需要其DNA去甲基化酶活性。

在米色脂肪细胞中过表达Tet1 WT、Tet1∆CD、Tet1CD或Tet1CDM突变体,检测Forskolin刺激下Ucp1表达和线粒体呼吸;敲低Dnmt1/3a/3b后联合敲低Tet1检测Ucp1;用α-KG或琥珀酸二乙酯预处理后检测Forskolin诱导的Ucp1;用5hmC-Seal-Seq分析冷暴露前后iWAT中5hmC水平;用亚硫酸氢盐PCR测序分析Ucp1和Tet1启动子/增强子CpG甲基化。

5

TET1与HDAC1协同抑制产热基因的表观遗传机制验证

确定TET1是否通过与HDAC1相互作用介导产热基因抑制。

在HEK293T细胞中共转染Ty1-Tet1 WT或Ty1-Tet1∆CD与Myc-HDAC1进行共免疫沉淀;在过表达Ty1-Tet1的米色脂肪细胞中进行HDAC1和Ty1的ChIP-reChIP及ChIP-qPCR,检测Ucp1和Ppargc1a调控区结合;在WT和KO iWAT中进行H3K27ac ChIP-qPCR;用CRISPR-Cas敲除HDAC1后检测TET1过表达对Ucp1和Ppargc1a的抑制。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
罗格列酮Cayman--
胰岛素Sigma--
地塞米松Sigma--
异丁基甲基黄嘌呤Sigma--
α-酮戊二酸Sigma--
琥珀酸二乙酯Sigma--
CL316,243Sigma--
Tet1抗体GeneTexGTX1242071
β-actin抗体Thermo FisherMA5-14739
UCP1抗体AbcamAb10983
PGC1α抗体AbcamAb54481
H3K27ac抗体AbcamAb4729
CD45-PerCP/Cy5.5抗体Biolegend103131
F4/80-PE/Cy7抗体Biolegend123113
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
蛋白A/G PLUS琼脂糖Santa CruzSC-2003
DNeasy血液与组织DNA提取试剂盒Qiagen69504
寡霉素----
FCCP----
鱼藤酮----
TRIzol试剂----
RETROscript第一链合成试剂盒Ambion--
SYBR Green qPCR预混液Applied Biosystems--
RNeasy Mini试剂盒Qiagen74104
UDP-叠氮葡萄糖Active Motif55020
T4 β-葡萄糖基转移酶ThermofisherEO0831
Zymo DNA清洁浓缩试剂盒ZymoD4014
链霉亲和素C1磁珠Thermofisher65001
EZ DNA甲基化-闪电试剂盒Zymo ResearchD5030
Topo TA克隆系统Invitrogen--
AAV8-hAdp-iCre病毒Vector Biolabs--
AAV8-Null对照病毒Vector Biolabs--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物温度挑战
小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、年龄、冷暴露温度(4°C)和热中性温度(30°C)、暴露时长(24小时或7天)、每组样本量
阅读提示:Methods Animals小节及图1、图4图注
脂肪选择性Tet1敲除
Cre品系(Fabp4-Cre)、敲除效率(iWAT、eWAT、BAT脂肪细胞 fraction 中>80%)、对照设置、非脂肪组织验证
阅读提示:Results相应段落及Supplementary Fig. 3
高脂饮食代谢表型
饮食配方(60%热量来自脂肪)、起始年龄(8周龄)、喂养时长(至多3个月)、体重监测频率、体成分和耐量试验时间点
阅读提示:Methods Animals小节及图5图注
米色脂肪细胞 gain/loss-of-function
细胞系(永生化米色脂肪细胞)、分化阶段(成熟day 5)、转导时长(48小时)、Polybrene浓度(8 μg/ml)、Forskolin和去甲肾上腺素浓度(文中未明确说明)、每组n数
阅读提示:Methods Cell culture小节及图2、图3图注
TET1-HDAC1机制验证
ChIP抗体(Ty1、HDAC1、IgG)、ChIP-qPCR n=3、H3K27ac ChIP-qPCR n=3、HDAC1敲除验证
阅读提示:Methods ChIP-qPCR小节及图7图注