建立原代肝细胞胶原三明治培养模型并评估Tjp1敲除对节律的影响
验证TJP1对肝细胞昼夜节律振幅的自主调控作用。
小鼠原代肝细胞在胶原三明治(SD+)或普通培养(SD−)下,用地塞米松同步化后不同时间点收样,检测Rev-Erbα表达和节律振幅;通过免疫染色和TER评估紧密连接形成。
The tight junction protein TJP1 regulates the feeding-modulated hepatic circadian clock.
包含原代肝细胞、多种基因敲除小鼠模型、Co-IP、体外激酶实验及在体功能验证
原代小鼠肝细胞(胶原三明治培养) 肝脏特异性Tjp1敲除小鼠 肝脏特异性Raptor敲除小鼠 肝脏特异性Tsc1敲除小鼠
原代肝细胞胶原三明治培养与地塞米松同步化(0.1 μM) 氨基酸刺激和Torin1处理(250 nM)的时序与浓度 小鼠禁食(ZT12至ZT4)再喂食(2小时)方案 腺病毒尾静脉注射剂量(5×10^8 pfu/小鼠) 高胰岛素-正葡萄糖钳实验的胰岛素输注速率(6 mU kg−1 min−1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TJP1对肝细胞昼夜节律振幅的自主调控作用。
小鼠原代肝细胞在胶原三明治(SD+)或普通培养(SD−)下,用地塞米松同步化后不同时间点收样,检测Rev-Erbα表达和节律振幅;通过免疫染色和TER评估紧密连接形成。
在体内验证TJP1对肝脏昼夜节律的调控。
利用Alb-Cre构建Tjp1 LKO小鼠,检测肝脏和SCN中E-box基因表达,以及PER1/CRY1的核转位。
明确TJP1是否与PER1结合以及mTOR是否调节该结合。
免疫共沉淀联合质谱鉴定TJP1相互作用蛋白;氨基酸和Torin1处理原代肝细胞,检测TJP1:PER1结合及PER1核转位;体外激酶实验验证mTOR磷酸化TJP1。
确定mTOR磷酸化TJP1是否足以促进PER1核转位。
在Tjp1 LKO小鼠中腺病毒表达TJP1野生型、6A(磷酸化缺陷)或6D(磷酸化模拟)突变体,检测PER1核转位和Rev-Erbα表达。
检验mTOR活性变化是否影响肝脏节律振幅。
使用Torin1处理或Raptor LKO、Tsc1 LKO小鼠,检测Rev-Erbα表达、节律振幅和PER1核转位。
在生理性进食状态下验证mTOR-TJP1通路的作用。
小鼠禁食(ZT12至ZT4)再喂食2小时,检测WT、Raptor LKO、Tsc1 LKO和Tjp1 LKO小鼠中PER1核转位和Rev-Erbα表达。
确定TJP1是mTOR调控肝脏节律的关键下游介质。
构建Raptor/Tjp1双敲除小鼠,以及在Tsc1 LKO背景下表达TJP1/6A突变体,检测PER1核转位和Rev-Erbα表达。
探究TJP1缺失是否改善代谢表型。
Tjp1 LKO小鼠喂食常规饮食或高脂饮食16周,进行高胰岛素-正葡萄糖钳实验,检测血糖、胰岛素、甘油三酯等指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 地塞米松 | -- | -- |
| Torin1 | -- | -- | |
| 氨基酸混合物 | Sigma | M5550 | |
| 胶原溶液 | BD Biosciences | -- | |
| RPMI1640培养基 | -- | -- | |
| M199培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 支原体检测试剂盒 | Sigma | MP0035 | |
| 亚细胞组分分离 | 溶酶体分离试剂盒 | Sigma | LYSISO1 |
| 跨上皮电阻测定 | Transwell小室 | Corning | CLS3450-24EA |
| 电阻测量系统 | Millipore | MERS00002 | |
| 免疫共沉淀 | HA磁珠 | Thermo | 26182 |
| 抗mCherry抗体 | Origene | TA180028 | |
| 抗TJP1抗体 | Invitrogen | 61-7300 | |
| Protein A/G Plus琼脂糖 | Thermo | 26161 | |
| 蛋白质印迹 | BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher | 23227 |
| 抗PER1抗体 | ABclonal | A8449 | |
| 抗PER2抗体 | ABclonal | A13168 | |
| 抗CRY1抗体 | ABclonal | A6890 | |
| 抗CLDN1抗体 | ABclonal | A2196 | |
| 抗LAMP1抗体 | ABclonal | A2582 | |
| 抗LMNA抗体 | ABclonal | A0249 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009 | |
| 抗BMAL1抗体 | Proteintech | 14268-1-AP | |
| 抗Rev-Erbα抗体 | Proteintech | 14506-1-AP | |
| 抗Cingulin抗体 | Proteintech | 21369-1-AP | |
| 抗V5抗体 | Proteintech | 66007-1-Ig | |
| 兔抗TJP1抗体 | Thermo Fisher | 61-7300 | |
| 鼠抗TJP1抗体 | Thermo Fisher | 339100 | |
| 抗TJP2抗体 | Thermo Fisher | 374700 | |
| 大鼠抗TJP1抗体 | Millipore | MABT11 | |
| 抗CLOCK抗体 | Cell Signaling Technology | 5157S | |
| 抗S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 2708 | |
| 抗磷酸化S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9234 | |
| 抗mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983 | |
| 抗RAPTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2280T | |
| 抗EEA1抗体 | Cell Signaling Technology | 3288 | |
| 抗TSC1抗体 | Cell Signaling Technology | 6935S | |
| 抗TJP3抗体 | Cell Signaling Technology | 3704 | |
| 抗KDEL抗体 | Abcam | ab12223 | |
| 抗COX IV抗体 | Abcam | ab33985 | |
| 抗TGN46抗体 | Abcam | ab50595 | |
| 抗mCherry抗体 | Origene | TA180028 | |
| 抗LAMP1抗体 | Sigma-Aldrich | L1418 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T6199 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗GFP抗体 | COVANCE | MMS-118P | |
| 抗HA抗体 | COVANCE | MMS-101P | |
| 抗His抗体 | MBL | D291-3 | |
| 磷酸化S1614 TJP1抗体 | Beijing Prorevo Biotech Co. Ltd. | -- | |
| 体外激酶实验 | 截短型mTOR | Millipore | 14-770 |
| 蛋白纯化 | 镍亲和树脂 | QIAGEN | -- |
| Superdex 200凝胶过滤柱 | GE Healthcare | -- | |
| RNA提取与qPCR | 总RNA纯化试剂盒 | GeneMark | -- |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo | -- | |
| LightCycler 480 II实时PCR仪 | Roche | -- | |
| 代谢指标检测 | 自动血糖仪 | LifeScan | -- |
| 甘油三酯检测试剂盒 | Sigma | TR0100 | |
| 胆固醇检测试剂盒 | Cayman | 10007640 | |
| 胰岛素ELISA试剂盒 | Mercodia | 10-1247-01 | |
| 游离脂肪酸检测试剂盒 | Wako | 294-636 | |
| 总胆汁酸试剂盒 | Diazyme | DZ092A | |
| PhenoMaster代谢监测系统 | TSE Systems | -- | |
| EchoMRI体成分分析仪 | EchoMRI | -- | |
| 高胰岛素-正葡萄糖钳实验 | [6,6-2H]葡萄糖 | -- | -- |
| Q Exactive质谱仪 | Thermo | -- | |
| ultimate 3000超高效液相色谱 | Thermo | -- | |
| 质谱分析 | LTQ Orbitrap质谱仪 | Thermo | -- |
| 免疫荧光 | 落射荧光显微镜 | Zeiss | -- |
| 透射电子显微镜 | Tecnai Spirit 120 kV透射电子显微镜 | Tecnai | -- |
| 腺病毒包装 | PfuUltra II Fusion HS DNA聚合酶 | Agilent | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原代肝细胞分离与胶原三明治培养 | 胶原浓度(1 mg/ml)、肝细胞接种密度(3×10^6/10 cm dish)、地塞米松同步化浓度(0.1 μM)及收样时间点 阅读提示:Methods中Cell culture和Collagen gel sandwich cultures小节;Fig. 1a图注 |
| 氨基酸刺激与Torin1处理 | 无氨基酸RPMI1640孵育时间(6小时或过夜)、Torin1浓度(250 nM)及预处理时间(30分钟或1小时)、氨基酸刺激时间(30分钟) 阅读提示:Methods中Cell culture小节;Fig. 2a和2b图注 |
| 小鼠禁食再喂食实验 | 禁食时间窗(ZT12至ZT4)、再喂食时长(2小时)、取材时间点(ZT6)、小鼠年龄(8–12周)和性别(雄性) 阅读提示:Methods中Mouse experiments小节;Fig. 5图注 |
| 腺病毒尾静脉注射 | 腺病毒剂量(5×10^8 pfu/小鼠)、注射体积和表达时间 阅读提示:Methods中Mouse experiments和Plasmids and adenoviruses小节 |
| 高胰岛素-正葡萄糖钳实验 | 胰岛素输注速率(6 mU kg−1 min−1)、[6,6-2H]glucose输注方案(初始600 μg kg−1,持续30 μg kg−1 min−1)、血糖目标(100±5 mg/dl)、采样时间点(t=−10, 0, 110, 120 min) 阅读提示:Methods中Hyperinsulinemic-euglycemic clamps小节 |
| 肝脏特异性基因敲除小鼠构建 | Tjp1 LKO(Alb-Cre,删除外显子3)、Raptor LKO(腺病毒-Cre,1×10^9 pfu)、Tsc1 LKO(Alb-Cre)的构建策略和对照设置 阅读提示:Methods中Mouse strains小节 |