体内黏膜损伤修复模型建立与CD47功能验证
验证CD47缺失或阻断是否损害肠道黏膜伤口愈合。
利用微型视频内镜和活检钳在小鼠降结肠背侧制造5–7个黏膜伤口,于伤后24和72小时测量伤口面积;比较Cd47−/−小鼠、腹腔或局部注射抗CD47抗体miap301/miap410的C57Bl/6小鼠与对照组的伤口闭合。
Epithelial CD47 is critical for mucosal repair in the murine intestine in vivo.
包含Cd47全敲、IEC特异性敲除及诱导敲除小鼠体内模型,DSS和活检损伤实验,体外原代肠类器官迁移实验及信号通路验证。
Cd47−/−小鼠及Cd47f/f对照小鼠 VillinCre;Cd47f/f(Cd47ΔIEC)和VillinERT2-Cre;Cd47f/f(Cd47ERΔIEC)小鼠 小鼠小肠类器官来源的原代上皮2D单层 人LGR5+干细胞来源结肠类器官的2D上皮单层
DSS处理方案:2.5% w/v DSS饮水,Cd47ΔIEC小鼠4天、Cd47ERΔIEC小鼠3天,随后5天正常饮水恢复,共3个循环 活检损伤模型:在麻醉小鼠降结肠背侧制造5–7个活检伤口,于伤后24和72小时量化伤口面积 抗体中和实验:miap301或miap410腹腔注射400 µg,或伤口局部注射10 µg;体外使用10 µg/ml B6H12.2或miap301/miap410处理24小时 CD47诱导敲除:8周龄Cd47ERΔIEC小鼠连续5天腹腔注射1 mg/100 µl他莫昔芬,末次注射后15天使用 基因型对照:Cd47f/f同窝对照,每组5–6只小鼠,至少两次独立实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CD47缺失或阻断是否损害肠道黏膜伤口愈合。
利用微型视频内镜和活检钳在小鼠降结肠背侧制造5–7个黏膜伤口,于伤后24和72小时测量伤口面积;比较Cd47−/−小鼠、腹腔或局部注射抗CD47抗体miap301/miap410的C57Bl/6小鼠与对照组的伤口闭合。
确定上皮细胞特异性CD47缺失是否影响肠道稳态及是否自发引起免疫介导损伤。
将Cd47f/f小鼠与VillinCre或VillinERT2-Cre小鼠杂交获得Cd47ΔIEC和Cd47ERΔIEC小鼠;通过免疫荧光和Western blot验证IEC中CD47缺失;检测体重、肠道通透性、组织学及固有层免疫细胞组成。
验证上皮CD47缺失是否直接导致黏膜伤口闭合缺陷。
对Cd47ΔIEC和诱导型Cd47ERΔIEC小鼠实施活检诱导的结肠黏膜伤口,于伤后24和72小时量化伤口闭合;伤后3天取材进行E-Cadherin、Villin和Ki67染色,评估再上皮化和增殖。
在第二种黏膜损伤模型中验证CD47缺失对黏膜修复的影响。
对Cd47ΔIEC和Cd47ERΔIEC小鼠给予三个循环的2.5% DSS饮水后正常饮水恢复,每日评估疾病活动指数(DAI),实验终点取结肠进行H&E染色和损伤/溃疡面积评分,并检测PMN浸润。
验证CD47缺失或阻断是否直接影响上皮细胞迁移而非增殖。
由小鼠CD47(+/−)肠类器官或人结肠类器官制备2D上皮单层,进行划痕伤口实验,用活细胞显微成像定时记录伤口闭合;并用CD47阻断抗体或非阻断抗体处理人及小鼠单层。
阐明CD47调控上皮迁移的分子机制。
用原位邻近连接实验(PLA)检测小鼠结肠中CD47与β1整合素的靠近;Western blot检测新鲜分离IEC和划伤后单层中β1整合素、p-SrcY416、p-FAKY397/Y861、p130CasY410及总蛋白水平;免疫荧光检测伤口旁上皮pFAKY861与β1整合素共定位及板状伪足黏着斑。
验证CD47缺失是否影响TSP-1、TGF-β1活化及下游Smad信号和胶原沉积。
Western blot检测新鲜分离IEC中TSP-1、TGF-β1成熟/前体形式、p-Smad2/3和总Smad2/3;Masson三色染色检测活检伤口和慢性DSS结肠炎后的胶原沉积。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma | T5648 |
| 玉米油 | Sigma | C8267 | |
| DSS诱导结肠炎 | 葡聚糖硫酸钠 | Affymetrix | 14489 |
| 抗体中和实验 | miap301抗CD47抗体 | BioXCell | BE0270 |
| miap410抗CD47抗体 | BioXCell | BE0283 | |
| 纯化大鼠IgG2A(克隆2A3) | BioXCell | BP0089 | |
| 抗CD47抗体(克隆B6H12.2) | ATCC hybridoma | -- | |
| 抗小鼠CD47抗体(克隆2D3) | Thermofisher Scientific | 14-0478-82 | |
| Western blot | 抗β1整合素抗体(克隆KMI6) | AbCam | ab95623 |
| 抗血小板反应蛋白-1抗体 | AbCam | ab85762 | |
| 免疫荧光 | 抗Ki67抗体 | AbCam | ab15580 |
| Western blot | 抗磷酸化FAK(Tyr397)抗体 | Cell Signaling Technology | 3283 |
| 抗FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| 抗磷酸化p130CAS(Tyr410)抗体 | Cell Signaling Technology | 4011 | |
| 抗p130CAS抗体(E1L9H) | Cell Signaling Technology | 13846 | |
| 磷酸化Src(Tyr416)抗体(克隆D49G4) | Cell Signaling Technology | 6943 | |
| 抗Src抗体(克隆32G6) | Cell Signaling Technology | 2123 | |
| 磷酸化SMAD2(Ser465/Ser467,克隆E8F3R)抗体 | Cell Signaling Technology | 18338 | |
| 磷酸化Smad3(Ser423/425,克隆C25A9)抗体 | Cell Signaling Technology | 9520 | |
| 抗Smad2/3抗体 | Cell Signaling Technology | 5678 | |
| 抗磷酸化FAK(Tyr861)抗体 | Millipore | 07-832 | |
| 抗TGF-β1抗体(克隆7F6) | Novus Biologicals | NBP2-22114 | |
| 免疫荧光 | 抗小鼠CD47抗体 | R&D systems | AF1866 |
| 抗小鼠E-钙黏蛋白抗体 | R&D systems | AF748 | |
| 大鼠抗小鼠β1整合素抗体 | R&D systems | MAB2405 | |
| Western blot | 抗β-肌动蛋白抗体(克隆AC-15) | Sigma Aldrich | A5441 |
| 抗GAPDH抗体 | Sigma Aldrich | G9545 | |
| 免疫荧光 | 抗Villin抗体 | GeneTex | GTX109940 |
| 流式细胞术 | PerCP抗小鼠CD45抗体(克隆30-F11) | BD Pharmingen | 557235 |
| PE-Cy7抗小鼠CD3e抗体(克隆145-2C11) | BD Pharmingen | 552774 | |
| BV421抗小鼠Siglec F抗体(克隆E50-2440) | BD Pharmingen | 562681 | |
| BV510抗小鼠CD4抗体(克隆RM4-5) | BD Pharmingen | 563106 | |
| PE-Cyanine7抗小鼠F4/80抗体(克隆BM8) | Invitrogen | 25-4801-82 | |
| PE抗小鼠CD19抗体(克隆1D3) | Invitrogen | 12-0193-83 | |
| PE抗小鼠CD11b抗体(克隆M1/70) | Invitrogen | RM2804 | |
| APC抗小鼠CD11c抗体(克隆N418) | Invitrogen | 17-0114-82 | |
| PE抗CD11b抗体(克隆M1/70) | Invitrogen | 12-0112-83 | |
| FITC抗CD8a抗体(克隆53-6.7) | Invitrogen | 11-0081-85 | |
| 抗人β1整合素抗体(克隆HUTS-21) | BD Pharmingen | 556048 | |
| 免疫荧光 | 抗小鼠Ly6G抗体(克隆1A8) | Biolegend | 127602 |
| 流式细胞术 | PE/Cy7抗小鼠Ly6C抗体(克隆HK1.4) | Biolegend | 128018 |
| PerCP抗小鼠Ly6G抗体(克隆1A8) | Biolegend | 127654 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 555鬼笔环肽 | Invitrogen | A34055 |
| DAPI | Invitrogen | D1306 | |
| Zenon-Alexa Fluor 488小鼠IgG2a标记试剂盒 | Thermofisher Scientific | Z25102 | |
| 原位邻近连接实验 | DuoLink PLA探针和试剂 | Sigma Aldrich | -- |
| Anti-Goat plus/DUO92003 | Sigma Aldrich | DUO92003 | |
| probemaker minus/DUO92010 | Sigma Aldrich | DUO92010 | |
| 类器官培养 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 重组人EGF | R&D Systems | -- | |
| 抗生素-抗真菌剂(100×) | Corning | -- | |
| CD47敲除 | z-4-羟基他莫昔芬 | Sigma Aldrich | H7904 |
| 细胞培养 | IV型胶原 | Sigma | C5533 |
| 胰蛋白酶/EDTA(0.05%胰蛋白酶/0.5 mM EDTA) | Invitrogen | -- | |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Invitrogen | -- | |
| SB202190 | StemCell Tech | -- | |
| A83-01 | StemCell Tech | -- | |
| 流式细胞术 | Liberase TM | Roche Applied Science | -- |
| DNase I | Sigma Aldrich | -- | |
| Polymorphprep密度梯度分离液 | Cosmo Bio Usa Inc | AXS1114683 | |
| Western blot | Clarity Western ECL底物 | BioRad | -- |
| BioRad DC蛋白定量试剂 | BioRad | -- | |
| 免疫荧光 | Pro-Long抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 慢性DSS诱导结肠炎及修复 | DSS浓度2.5% w/v、分子量40 kDa;Cd47ΔIEC每循环DSS 4天+水5天,Cd47ERΔIEC每循环DSS 3天+水5天;共3个循环;Cd47ERΔIEC在末次他莫昔芬后2周开始DSS;每组5–6只小鼠,两次独立实验。 阅读提示:Methods 'Dextran sulfate sodium treatment'及Fig. 4图注 |
| 活检诱导黏膜伤口模型 | 每只小鼠5–7个伤口,位于降结肠背侧;麻醉剂氯胺酮100 mg/kg+赛拉嗪5 mg/kg;伤后24和72小时量化伤口面积;每组5–6只小鼠,两次独立实验。 阅读提示:Methods 'Wound healing assays'及Fig. 1、Fig. 3图注 |
| 抗CD47抗体体内中和 | 腹腔注射400 µg或伤口局部注射10 µg miap301/miap410,对照为rat IgG2A(克隆2A3);局部注射在伤后24小时进行;每组5只小鼠,两次独立实验。 阅读提示:Methods 'Wound healing assays'及Fig. 1图注 |
| CD47诱导敲除 | 8周龄Cd47ERΔIEC小鼠连续5天腹腔注射1 mg/100 µl他莫昔芬(溶于玉米油),末次注射后15天使用;验证IEC中CD47缺失。 阅读提示:Methods 'Mice'及Fig. 2图注 |
| 体外上皮单层划痕实验 | 小鼠CD47敲除用1 µM 4-羟基他莫昔芬处理类器官72小时;人单层用10 µg/ml IgG、B6H12.2或2D3处理24小时;小鼠单层用10 µg/ml rat IgG2A、miap301或miap410处理24小时;划痕后10分钟间隔成像,24小时量化;三次独立实验,每组三个重复。 阅读提示:Methods 'Wound healing assays'及Fig. 5图注 |