KLF10表达分析
确定KLF10在高血压患者及Ang II处理小鼠CD4+ T细胞中的表达变化。
分析高血压患者PBMC转录因子谱及Ang II处理小鼠脾脏CD3+ T细胞RNA-seq,通过RT-qPCR和免疫荧光验证KLF10表达。
Perivascular Fibrosis Is Mediated by a KLF10-IL-9 Signaling Axis in CD4+ T Cells
包含在体动物模型(TKO与Cre小鼠Ang II输注)、离体细胞实验(原代成纤维细胞、T细胞)、转录组学(bulk RNA-seq、scRNA-seq)及机制验证(ChIP、报告基因、IP)等多个独立证据层级。
Klf10fl/flCD4Cre+(TKO)小鼠 CD4-Cre(Cre)对照小鼠 C57BL/6小鼠 原代主动脉成纤维细胞 HEK293T细胞
Ang II输注剂量及持续时间(28天或42天) CD4+ T细胞中Klf10缺失的确认 血浆IL-9水平及CD4+IL9+细胞比例 抗IL-9中和抗体给药方案 主动脉成纤维细胞分离及培养条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定KLF10在高血压患者及Ang II处理小鼠CD4+ T细胞中的表达变化。
分析高血压患者PBMC转录因子谱及Ang II处理小鼠脾脏CD3+ T细胞RNA-seq,通过RT-qPCR和免疫荧光验证KLF10表达。
评估CD4+ T细胞KLF10缺失对Ang II诱导的血管周围纤维化和多器官功能的影响。
对TKO和Cre小鼠进行Ang II或PBS输注,检测血压、心脏功能(GLS)、主动脉僵硬度(PWV、Circ Strain)、肾功能(尿白蛋白/肌酐、KIM-1)、组织学纤维化分析。
鉴定介导血管周围纤维化的关键细胞因子及产生细胞。
血浆细胞因子谱分析,流式细胞术检测主动脉和脾脏中CD4+IL9+等细胞比例,离体CD4+ T细胞培养检测Il9表达和IL-9分泌。
阐明KLF10调控IL-9表达的分子机制。
ChIP检测KLF10与IL-9启动子结合,报告基因检测KLF10对IL-9启动子活性的影响,免疫共沉淀验证KLF10-HDAC1相互作用,siRNA敲低HDAC1验证其作用。
验证IL-9对成纤维细胞活化和钙信号的影响。
分离并培养主动脉成纤维细胞,用重组IL-9和Ang II处理,检测纤维化基因表达(Col1a1, Acta2等),钙流实验检测胞内钙水平。
揭示血管周围纤维化相关的全转录组变化及成纤维细胞异质性。
对剥离和未剥离主动脉进行bulk RNA-seq,对主动脉进行scRNA-seq,分析成纤维细胞亚群及其激活特征。
验证中和IL-9能否逆转Ang II诱导的血管周围纤维化和器官损伤。
在Ang II处理的TKO和C57BL/6小鼠中给予抗IL-9中和抗体或IgG对照,评估心脏功能、主动脉僵硬度和组织学纤维化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 在体动物模型 | 血管紧张素II | Sigma-Aldrich | A9525 |
| 渗透微泵 | ALZET | Model | |
| 体内给药 | 抗小鼠IL-9抗体 | Bio X Cell | BE0181 |
| 小鼠IgG2a同型对照 | Bio X Cell | BE0085 | |
| 免疫荧光染色 | 抗KLF10抗体 | Invitrogen | PA5-19845 |
| 抗IL-9抗体 | Abcam | Ab227037 | |
| 抗KLF10抗体 | Abcam | Ab73537 | |
| 抗KLF10抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-130408 | |
| 免疫共沉淀 | 抗HDAC1抗体 | GeneTex | Gtx100513 |
| 免疫荧光染色 | 抗CD4抗体 | Abcam | Ab183685 |
| 抗Col8a1抗体 | Abcam | Ab236653 | |
| 抗PDGFRa抗体 | Thermo Scientific | MA541209 | |
| 抗Col1a1抗体 | Novus Biologicals | NBP1-30054 | |
| 抗aSMA抗体 | Sigma-Aldrich | A5228 | |
| Cy3标记驴抗大鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch Lab | 712-165153 | |
| Alexa 647标记驴抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch Lab | 711-605152 | |
| Alexa 488标记驴抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch Lab | 711-545152 | |
| DAPI | BioLegend | 422801 | |
| 流式细胞术 | PE标记大鼠抗小鼠CD90.2抗体 | BD Biosciences | 553006 |
| BUV563标记大鼠抗小鼠CD45抗体 | BD Biosciences | 612924 | |
| Pacific Blue标记大鼠抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 155612 | |
| PE标记大鼠抗小鼠F480抗体 | BioLegend | 123109 | |
| PE Cyanine7标记大鼠抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | 100422 | |
| PerCP-Cy5.5标记大鼠抗小鼠CD8抗体 | BioLegend | 100734 | |
| FITC标记大鼠抗小鼠IFNγ抗体 | eBioscience | 11-7311-82 | |
| PE标记大鼠抗小鼠IL4抗体 | eBioscience | 12-7041-82 | |
| APC标记大鼠抗小鼠IL9抗体 | BioLegend | 514106 | |
| FITC标记大鼠抗小鼠IL17抗体 | BioLegend | 506908 | |
| Alexa Fluor 488标记大鼠抗小鼠FoxP3抗体 | eBioscience | 53-5773-82 | |
| 细胞培养 | HEK293T细胞 | ATCC | CRL-3216 |
| 细胞因子处理 | 重组小鼠IL-9 | R&D System | 409-ML |
| T细胞活化 | 小鼠T细胞活化剂CD3/CD28 | Gibco | 11452D |
| 肾功能检测 | 小鼠白蛋白ELISA试剂盒 | Abcam | ab207620 |
| 肌酐检测试剂盒 | Abcam | ab65340 | |
| 小鼠KIM-1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab213477 | |
| 组织染色 | Von Kossa染色试剂盒 | Abcam | ab150687 |
| Alexa Fluor 488标记麦胚凝集素 | Invitrogen | W11261 | |
| 细胞刺激 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma | P1585 |
| 离子霉素 | Sigma Aldrich | I0634 | |
| 布雷菲德菌素A | Sigma Aldrich | B5936 | |
| 流式细胞术 | Cytofix/Cytoperm试剂盒 | BD Biosciences | 554714 |
| 细胞分离 | 小鼠CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-454 |
| 小鼠CD3IFNε微珠试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-094-973 | |
| CD45微珠试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-052-301 | |
| 抗PE微珠 | Miltenyi Biotec | 130-048-801 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668019 |
| 报告基因实验 | Il9启动子报告基因 | GeneCopoeia | MPRM39766-PG04 |
| 基因敲低 | HDAC1 siRNA | Thermofisher | s119558 |
| 非特异性siRNA | Thermofisher | 4390843 | |
| 报告基因实验 | Secrete-Pair双荧光素酶检测 | GeneCopoeia | LF032 |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signal | 9003 |
| qPCR | SYBR Green预混液 | Promega | M7122 |
| 免疫沉淀 | Pierce蛋白G磁珠 | Thermo Scientific | 88847 |
| 钙流实验 | Fluo-8免洗钙检测试剂盒 | Abcam | ab112129 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、周龄、Ang II输注剂量及持续时间(28天或42天) 阅读提示:Methods: Animals; Figure 2A |
| 细胞分离与培养 | 主动脉成纤维细胞和CD4+ T细胞的分离方法、培养条件、刺激物浓度及时间 阅读提示:Methods: Cell isolation and culture; Figure 6A, D |
| 免疫分析 | 流式细胞术的抗体克隆、稀释度、细胞制备步骤;血浆细胞因子检测试剂盒 阅读提示:Methods: Flow cytometry; Major Resources Table |
| 分子机制实验 | ChIP实验的抗体、引物、剪切条件;报告基因实验的质粒构建、转染试剂和检测方法 阅读提示:Methods: ChIP, luciferase assay; Figure 4 |
| 转录组学 | RNA提取方法、文库制备、测序平台、生物信息学分析流程(如Seurat版本、参数) 阅读提示:Methods: RNA-seq, scRNA-seq; Supplemental Methods |
| 功能和组织学评估 | 超声心动图、PWV测量、组织染色(Masson、Sirius Red、Von Kossa)的具体操作和定量方法 阅读提示:Methods: Echocardiography, histology; Figure 2 |