细胞因子白细胞介素-6和干扰素-α诱导不同的小胶质细胞表型

The cytokines interleukin-6 and interferon-α induce distinct microglia phenotypes

作者信息Phillip K West, Andrew N McCorkindale, Boris Guennewig, Thomas M Ashhurst, Barney Viengkhou, Emina Hayashida, So Ri Jung, Oleg Butovsky, Iain L Campbell, Markus J Hofer
PMID35429976
发布时间2022-04-16
DOI10.1186/s12974-022-02441-x

实验完整度

该研究包含多个独立证据层级:转基因小鼠模型(GFAP-IL6/GFAP-IFN)、离体FACS分选和RNA-seq、流式细胞术、免疫组化、形态学分析及转录组荟萃分析,并明确包含功能验证(增殖、凋亡、形态)和机制验证(信号通路激活、转录组变化)。

主要模型

GFAP-IL6转基因小鼠 GFAP-IFN转基因小鼠

重点核对

1、3、6月龄的GFAP-IL6、GFAP-IFN和野生型小鼠 BrdU腹腔注射剂量为100 mg/kg,连续5天 小胶质细胞的形态分析(总突起长度、分支数、终末点数) 流式细胞术评估小胶质细胞表面标志物 RNA-seq分析(FDR≤0.05)

摘要

背景:中枢神经系统(CNS)中细胞因子白细胞介素(IL)-6或干扰素(IFN)-α的产生升高分别与视神经脊髓炎谱系疾病或脑干扰素病等神经系统疾病的发病机制有关。CNS靶向慢性产生IL-6(GFAP-IL6)或IFN-α(GFAP-IFN)的转基因小鼠再现了这些人类疾病的重要临床和病理特征。小胶质细胞的激活是人类疾病和转基因小鼠中的显著表现,但对其如何促进疾病病理学知之甚少。方法:在这里,我们结合离体和原位技术来表征GFAP-IL6与GFAP-IFN小鼠中小胶质细胞的分子、细胞和转录组表型。此外,进行了转录组荟萃分析,将GFAP-IL6和GFAP-IFN小鼠的小胶质细胞反应与一系列神经退行性和神经炎症性疾病中的小胶质细胞反应进行比较。结果:我们证明小胶质细胞对脑内IL-6与IFN-α表现出刺激特异性反应,导致独特而广泛的分子和细胞适应性变化。在GFAP-IL6小鼠中,小胶质细胞增殖,突起缩短、分支减少,并引发与吞噬作用和脂质加工相关的转录组和分子变化。相比之下,GFAP-IFN小鼠脑内的小胶质细胞表现出增殖和凋亡增加,突起更大、过度分支,并显示出与抗原呈递和抗病毒反应相关的转录组和表面标志物变化。此外,转录组荟萃分析显示,IL-6和IFN-α都促进了神经退行性和神经炎症性疾病动物模型中核心小胶质细胞反应的形成,如阿尔茨海默病、tau蛋白病、多发性硬化和脂多糖诱导的内毒素血症。结论:我们的研究结果表明,小胶质细胞对IL-6和IFN-α的反应高度刺激特异性、广泛,并产生调节神经炎症和神经退行性疾病中小胶质细胞反应的发散表型。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
小胶质细胞如何响应中枢神经系统中慢性IL-6与IFN-α的产生,并导致不同的表型?
核心机制
IL-6和IFN-α分别通过STAT3和STAT1信号通路,诱导小胶质细胞发生刺激特异性反应,包括增殖、凋亡、形态变化和转录组重编程。
主要证据
GFAP-IL6小鼠小胶质细胞增殖增加、形态分支减少,表达吞噬和脂质处理相关基因;GFAP-IFN小鼠小胶质细胞增殖和凋亡增加、形态过度分支,表达抗原呈递和抗病毒相关基因。
研究意义
该研究揭示小胶质细胞对IL-6和IFN-α的反应高度特异,为神经炎症和神经退行性疾病的机制提供了见解。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

激活细胞因子信号通路验证

验证GFAP-IL6和GFAP-IFN小鼠小胶质细胞中IL-6和IFN-α信号的激活

通过免疫印迹和免疫组化检测pY705-STAT3和pY701-STAT1的表达

2

小胶质细胞增殖和凋亡检测

评估小胶质细胞的增殖和凋亡差异

使用BrdU标记和TUNEL染色检测小胶质细胞的增殖和凋亡

3

小胶质细胞形态分析

量化小胶质细胞形态差异

使用组织透明化和免疫荧光,结合Imaris软件进行三维重建和形态测量

4

转录组分析

揭示小胶质细胞的转录组变化

分选小胶质细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因和GO富集

5

表面标志物流式分析

检测小胶质细胞表面标志物变化

使用高维流式细胞术和UMAP分析小胶质细胞表面蛋白

6

转录组荟萃分析

比较不同神经病理状态下的小胶质细胞反应

整合本研究和公共RNA-seq数据,进行聚类分析和功能富集

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
5-溴-2'-脱氧尿苷----
抗pY701-STAT1抗体Santa Cruz Biotechnologysc135648
抗pY705-STAT3抗体Cell Signaling Technologies9145L
生物素化山羊抗兔IgGVector LaboratoriesBA-1000
VECTASTAIN Elite ABC 辣根过氧化物酶试剂盒Vector LaboratoriesPK-7200
亲和素/生物素封闭试剂盒Vector LaboratoriesSP-2001
生物素化番茄凝集素Sigma-AldrichL0651
HRP偶联链霉亲和素Vector LaboratoriesSA-5004
DM4000B显微镜Leica Microsystems--
SPOT Flex相机Diagnostic Instruments--
兔抗Iba1抗体Wako Pure Chemical Industries019-19741
大鼠抗BrdU抗体BioRad LaboratoriesMCA2060GA
山羊抗兔IgG-AF488Thermo Fisher ScientificA-11034
山羊抗大鼠IgG-AF594Thermo Fisher ScientificA-11007
Fluoroshield™ DAPI封片剂Sigma-Aldrich--
TUNEL反应混合物RocheTMR Red
Zeiss AxioScan.Z1切片扫描显微镜Carl Zeiss--
Zeiss LSM800共聚焦激光扫描显微镜Carl Zeiss--
蛋白酶抑制剂混合物IIIMerck Millipore539134
磷酸酶抑制剂混合物IIMerck Millipore524625
抗pS727-STAT1抗体Cell Signaling Technology9177
抗STAT1抗体Cell Signaling Technology9172
抗STAT3抗体Cell Signaling Technology4904
抗GAPDH抗体Merck MilliporeMAB374
HRP偶联山羊抗兔IgGCell Signaling Technology7074P2
过氧化物酶偶联山羊抗小鼠IgGSigma-AldrichA0168
化学发光检测试剂Merck MilliporeWBKLS0500
iBright™ 1500成像系统Thermo Fisher Scientific--
VA-044引发剂Wako Pure Chemical Industries--
十二烷基硫酸钠----
Histodenz密度梯度介质Sigma-Aldrich--
Hoechst 33342染色液Sigma-AldrichB2261
Imaris 9.2.1软件Oxford Instruments--
Percoll分离液----
大鼠抗4D4抗体provided by Oleg Butovsky--
山羊抗大鼠IgG-APCBiolegendPoly4054
7AAD染料BD Bioscience51-68981E
BD Influx™细胞分选仪BD Bioscience--
RNeasy® plus微量试剂盒QIAGEN Inc.--
SMARTer®链特异性总RNA测序试剂盒(Pico输入哺乳动物)Takara Bio Inc.--
HiSeq 2500测序平台Illumina--
RevertAid第一链cDNA合成试剂盒Thermo Fisher Scientific--
SensiFAST™ SYBR® Lo-ROX预混液Meridian Bioscience--
7500 Fast实时荧光定量PCR仪Thermo Fisher Scientific--
大鼠抗CD16/32-BB700抗体BD Bioscience2.4G2
LIVE/DEAD™可固定蓝色死细胞染料Thermo Fisher Scientific--
大鼠抗B220-BUV661抗体BD BioscienceRA3-6B2
大鼠抗CD115-AF594抗体BiolegendAFS98
大鼠抗CD11b-BUV737抗体BD BioscienceM1/70
仓鼠抗CD11c-APC-R700抗体BD BioscienceN418
仓鼠抗CD3e-PE/Cy5.5抗体Thermo Fisher Scientific145-2C11
大鼠抗CD4-BV570抗体BiolegendRM4-5
大鼠抗CD45-APC/Cy7抗体BD Bioscience30-F11
大鼠抗CD62L-BV650抗体BiolegendMEL-14
大鼠抗CD69-BV785抗体BD BioscienceH1.2F3
仓鼠抗CD80-PE/CF594抗体BD Bioscience16-10A1
大鼠抗CD86-BV605抗体BiolegendGL1
大鼠抗CD8a-BUV805抗体BD Bioscience53-6.7
大鼠抗F4/80-BUV395抗体BD BioscienceT45-2342
大鼠抗Ly6C-PE/Cy7抗体BiolegendHK1.4
大鼠抗Ly6G-BUV563抗体BD Bioscience1A8
大鼠抗MHC-II (I-A/I-E)-BV510抗体BD BioscienceM5/114.15.2
小鼠抗NK1.1-PE/Cy5抗体BiolegendPK136
大鼠抗SCA-1-BV711抗体BiolegendD7
兔抗TMEM119-PE抗体Abcam106-6
LSR-X流式细胞仪BD Bioscience--
LSR-II流式细胞仪BD Bioscience--
FlowJo软件10版BD Bioscience--
大鼠抗FCRLS抗体provided by Oleg Butovsky--
小鼠抗MHC-I (H-2 Kb/H-2Db)-PE抗体Biolegend28-8-6
大鼠抗CD11b-PerCP/Cy5.5抗体BD BioscienceM1/70
Spectre R包----
FlowSOM算法----
UMAP降维算法----
Prism 9统计软件GraphPad Software--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
小鼠模型
GFAP-IL6和GFAP-IFN转基因小鼠的遗传背景(GFAP-IL6为C57BL/6,GFAP-IFN为C57BL/6×BALB/c混合背景)及野生型同窝对照
阅读提示:Methods: Mice
细胞因子信号通路检测
免疫组化/免疫印迹检测pY705-STAT3和pY701-STAT1的抗体及稀释度
阅读提示:Methods: Histology, Immunoblotting
小胶质细胞增殖和凋亡
BrdU给药方案(剂量、时间、天数)及TUNEL染色的具体步骤
阅读提示:Methods: Mice, Histology
小胶质细胞形态分析
组织透明化试剂(4%丙烯酰胺、0.05%双丙烯酰胺、0.25% VA-044)及抗体孵育时间
阅读提示:Methods: Tissue clearing
转录组分析
小胶质细胞分选方案(eGFP+4D4+细胞)及RNA-seq文库构建条件(SMARTer试剂盒,14个PCR循环)
阅读提示:Methods: FACS, Library preparation, RNA-seq
流式细胞术
细胞表面标志物抗体组合及浓度
阅读提示:Methods: Flow cytometry