人乳腺癌组织中CaMKK2表达分析
评估CaMKK2在乳腺癌肿瘤细胞和间质细胞中的表达及其与分子亚型的关联。
对Vienna(47例)和Roswell Park(68例)乳腺癌组织芯片进行CaMKK2免疫组化染色,由病理学家评分,并与分子亚型(LA、LB、TN)进行关联分析。
CaMKK2 in myeloid cells is a key regulator of the immune-suppressive microenvironment in breast cancer.
包含人乳腺癌组织芯片、小鼠移植瘤与自发瘤模型、髓系特异性基因敲除、体外BMDM功能实验及3D微流控芯片验证
E0771小鼠乳腺癌细胞系原位移植模型 MMTV-PyMT小鼠乳腺癌原位移植模型 LysMCre+Camkk2fl/fl髓系特异性敲除小鼠 Camkk2−/−全身敲除小鼠
E0771细胞接种数量:4×10^5细胞/小鼠用于Camkk2−/−与WT比较;2×10^5细胞/小鼠用于STO-609药效实验 STO-609给药方案:腹腔注射,100 μmoles/kg体重,每周3次,移植后第2天开始 CD8+ T细胞清除:抗CD8抗体(YTS 169.4)或IgG对照(clone LTF-2,1 mg/ml),每3天一次,从肿瘤接种前一周开始 BMDM分化条件:含30% L929条件培养基培养5天,并加入25% E0771肿瘤条件培养基或等体积常规培养基 T细胞增殖检测:CFSE标记T细胞与BMDM按100:1比例共培养,anti-CD3抗体10 ng/ml刺激,72小时后流式检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CaMKK2在乳腺癌肿瘤细胞和间质细胞中的表达及其与分子亚型的关联。
对Vienna(47例)和Roswell Park(68例)乳腺癌组织芯片进行CaMKK2免疫组化染色,由病理学家评分,并与分子亚型(LA、LB、TN)进行关联分析。
确定CaMKK2在肿瘤浸润免疫细胞亚群中的表达分布。
将E0771细胞接种至Tg(Camkk2-EGFP)报告小鼠乳腺脂肪垫,制备肿瘤单细胞悬液,流式检测EGFP在髓系和淋系亚群中的表达。
验证宿主CaMKK2缺失是否抑制乳腺肿瘤生长。
将MMTV-PyMT肿瘤组织块或E0771细胞原位移植到Camkk2−/−和WT小鼠乳腺脂肪垫,测量肿瘤体积;对肿瘤进行H&E和Masson三色染色及CD31免疫组化。
分析CaMKK2缺失后肿瘤内免疫细胞组成和功能标志物的变化。
对WT和Camkk2−/−小鼠E0771肿瘤切片进行CD3和F4/80免疫组化;制备单细胞悬液流式分析免疫亚群;全肿瘤裂解液qPCR检测Gzmb、Prf1、Foxp3、Pdcd1及Cxcl9/10/11等基因表达。
确定肿瘤抑制是否依赖CD8+ T细胞以及髓系细胞CaMKK2缺失是否足够。
用抗CD8抗体清除Camkk2−/−小鼠CD8+ T细胞后移植E0771细胞;构建LysMCre+Camkk2fl/fl小鼠并与对照比较肿瘤生长和CD11b+MHC II+细胞积累。
研究CaMKK2缺失对肿瘤条件培养基诱导的巨噬细胞分化程序和表型的影响。
从WT和Camkk2−/−小鼠骨髓制备BMDM,在常规培养基或E0771肿瘤条件培养基中分化5天,进行微阵列分析、qPCR和流式检测M1/M2标志物。
明确CaMKK2是否将肿瘤因子信号与AMPK活化偶联。
对WT和Camkk2−/− BMDM在RM或TCM条件下制备蛋白裂解液,免疫印迹检测CaMKK2、磷酸化CaMKI、磷酸化AMPKα和总AMPKα。
评估CaMKK2缺失的BMDM对T细胞增殖、细胞因子产生和趋化的影响。
CFSE标记的T细胞与WT或Camkk2−/− TCM-BMDM在anti-CD3抗体存在下共培养72小时,流式检测增殖和细胞因子;用transwell实验检测BMDM上清募集T细胞的能力。
在模拟肿瘤微环境的3D空间中比较WT和Camkk2−/− BMDM募集抗原特异性CD8+ T细胞的能力。
将E0771细胞与WT或Camkk2−/− BMDM混合包埋于胶原水凝胶中,置于微流控芯片两侧肿瘤腔;中央免疫腔加载OVA特异性EGFP-CD8+ T细胞和DsRed BMDC,实时成像追踪T细胞迁移。
验证药理抑制CaMKK2是否以CD8+ T细胞依赖方式抑制肿瘤生长并重塑免疫微环境。
在E0771、4T1、Met1移植瘤模型和MMTV-PyMT自发模型中给予STO-609或GSK1901320,测量肿瘤体积;流式分析瘤内免疫细胞;在CD8+ T细胞清除的Camkk2−/−小鼠中测试STO-609效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | 抗CaMKK2兔单克隆抗体HPA017389 | Sigma | HPA017389 |
| 兔Envision检测试剂盒K4004 | Dako | K4004 | |
| 抗CD3抗体ab5690 | Abcam | ab5690 | |
| 抗CD31抗体ab134168 | Abcam | ab134168 | |
| F4/80抗体MCA497GA | Bio-Rad | MCA497GA | |
| Vectastain Elite ABC试剂盒PK-4010 | Vector Laboratories | PK-4010 | |
| DAB底物试剂盒SK-4100 | Vector Laboratories | SK-4100 | |
| 免疫印迹 | 抗CaMKK2抗体610544 | BD Biosciences | 610544 |
| 抗肌动蛋白抗体AC-40 A4700 | Sigma-Aldrich | A4700 | |
| 抗磷酸化CaMK1(Thr177)抗体PA5-38434 | ThermoFisher | PA5-38434 | |
| 抗磷酸化AMPKα(Thr172)抗体40H9 | Cell Signaling | 2535 | |
| 抗AMPKα抗体F6 | Cell Signaling | 2793 | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD8单克隆抗体YTS 169.4 | -- | -- |
| IgG对照同型克隆LTF-2 | BioXCell | BE0090 | |
| T细胞功能实验 | Pan T细胞分离试剂盒II | Miltenyi | 130-095-130 |
| EasySep CD4分离试剂盒 | Stemcell Technology | 19752 | |
| EasySep CD8分离试剂盒 | Stemcell Technology | 19753 | |
| CellTrace CFSE细胞增殖试剂盒 | Invitrogen | C34554 | |
| 纯化NA/LE仓鼠抗小鼠CD3e克隆145-2C11 | BD Biosciences | -- | |
| Dynabeads小鼠T细胞激活剂CD3/CD28 | ThermoFisher | 11456D | |
| 抗CD28抗体 | Biolegend | 102102 | |
| 抗CD3抗体 | Invitrogen | 16-0031-85 | |
| 肿瘤消化 | 胶原酶 | Roche | -- |
| DNase I | Roche | -- | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| Dulbecco改良Eagle培养基(DMEM) | Gibco | -- | |
| 胎牛血清(FBS) | Hyclone | -- | |
| BMDM分化 | L929分化培养基 | -- | -- |
| 药物处理 | STO-609 | Tocris Biosciences | -- |
| GSK1901320 | -- | -- | |
| 二甲基亚砜(DMSO) | Sigma | D2438 | |
| 3D微流控芯片 | OVA257–264肽 | Sigma-Aldrich | -- |
| 牛胶原I(PureCol) | Advanced Matrix | 5005 | |
| 纤连蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| IL-2 | R&D System | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肿瘤移植模型 | E0771细胞接种数量因实验目的不同(WT/KO比较用4×10^5,药效实验用2×10^5);MMTV-PyMT肿瘤组织块移植;4T1和Met1细胞接种数量及matrigel比例 阅读提示:Methods中“Murine mammary tumors”小节及对应图注(Fig. 2a,b;Fig. 8a) |
| STO-609给药 | 给药剂量100 μmoles/kg,腹腔注射,每周3次,不同肿瘤模型开始给药时间不同(E0771第1天或第2天,Met1第7天,4T1第2天);溶剂为DMSO 阅读提示:Methods中“Drug treatments”小节及Fig. 8a图注 |
| CD8+ T细胞清除 | 抗CD8抗体YTS 169.4或IgG对照LTF-2浓度1 mg/ml,每3天一次,接种前一周开始;清除效果用外周血流式验证 阅读提示:Methods中“CD8+ cell depletion”小节及Supplementary Fig. 4A |
| BMDM分化与处理 | 骨髓细胞浓度2×10^6 cells/ml,含30% L929条件培养基分化5天,并加入25% E0771肿瘤条件培养基或等体积常规培养基;BMDM纯度>95% CD11b+F4/80+ 阅读提示:Methods中“Bone marrow-derived macrophages (BMDM)”小节及图4、6图注 |
| T细胞增殖实验 | T细胞与BMDM比例100:1,anti-CD3抗体10 ng/ml,CFSE标记浓度2 μM,共培养72小时后流式检测 阅读提示:Methods中“T cell functional assays”小节及Fig. 7a,b图注 |
| 3D微流控芯片实验 | E0771与BMDM比例1:5,胶原I浓度2.3 mg/ml,OVA257–264肽1 μM,OT-I T细胞与BMDC比例10:1,成像时间点0、18、44、72小时 阅读提示:Methods中“Tumor microenvironment on-a-chip model”小节及Supplementary Fig. 9 |
| 人乳腺癌组织芯片分析 | Vienna数据集47例,Roswell Park数据集68例;染色强度评分0-3分,弱(0、0.5、1)或过表达(≥2);HER2阳性病例因数量少被排除 阅读提示:Methods中“Human tissues”和“CaMKK2 IHC analysis”小节及Table 1 |