建立肠道上皮特异性NIK敲除小鼠并评估M细胞维持
确定上皮NIK信号是否对M细胞维持至关重要。
使用Villin-Cre生成NikΔIE小鼠,通过GP2染色、UEA1凝集素和qPCR检测M细胞标志物,并评估抗原采样和粪便IgA。
Intestinal non-canonical NFκB signaling shapes the local and systemic immune response.
包含多种基因敲除/过表达小鼠模型、肠类器官实验、骨髓嵌合体、患者样本及RNA-seq分析,并有功能与机制验证。
肠道上皮特异性NIK敲除小鼠(NikΔIE) 肠道上皮特异性RANK敲除小鼠(RankΔIE) 肠道上皮特异性NIK过表达小鼠(NikVilRosaΔT3) 小鼠肠道类器官(enteroids)
DSS诱导结肠炎模型中DSS浓度(2%)和处理时间(5-7天) 他莫昔芬诱导基因敲除的剂量(100 mg/kg)和DSS开始时间(他莫昔芬处理后10天) CLP脓毒症模型的盲肠结扎和穿刺细节(23G针头,两次穿孔) 肠类器官培养中RANKL、Tweak、LTα/β的处理浓度和时间(100 ng/mL, 100 ng/mL, 10 ng/mL,24或72小时) 骨髓移植的辐射剂量(6 Gy两次)和细胞数量(2×10^6)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定上皮NIK信号是否对M细胞维持至关重要。
使用Villin-Cre生成NikΔIE小鼠,通过GP2染色、UEA1凝集素和qPCR检测M细胞标志物,并评估抗原采样和粪便IgA。
探究上皮NIK信号是否保护 against 结肠炎。
对NikΔIE和对照小鼠给予2% DSS 7天,监测体重、结肠长度、出血和腹泻评分,并进行H&E和组织学分析。
确定RANKL是否通过NIK诱导M细胞分化。
从野生型或NikΔIE小鼠十二指肠和结肠制备肠类器官,用RANKL、Tweak或LTα/β处理,检测p52和M细胞标志物。
验证RANK信号是否通过M细胞保护 against 结肠炎。
生成RankΔIE小鼠和RankF/F;VilERT2Cre小鼠,评估M细胞标志物、粪便IgA和DSS结肠炎易感性。
确定M细胞缺失是否影响肠道淋巴滤泡中T细胞的IL-17表达。
通过RNA-seq、流式细胞术和qPCR检测PP中Th17细胞和IL-17表达,并评估TLR2/4敲除和骨髓嵌合体。
确定IL-17通过IgA产生保护 against 结肠炎。
使用Il17−/−小鼠、B细胞移植到Jh−/−小鼠,评估粪便IgA和DSS结肠炎严重程度。
探究NIK信号是否影响IgA包被结肠炎相关细菌。
通过16S rRNA测序分析菌群,流式分选IgA包被细菌,qPCR检测结肠炎相关细菌。
确定肠道NIK信号是否影响全身免疫反应和脓毒症生存。
在Il17−/−、IgA−/−、pIgR−/−、NikF/F;VilERT2Cre和RankF/F;VilERT2Cre小鼠中进行CLP,监测生存和血清IL-17、IgA。
测试组成性NIK激活是否加剧结肠炎。
生成NikVilRosaΔT3小鼠,评估M细胞标志物、IL-17和DSS结肠炎易感性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗原采样 | Flouresbrite YG微球(0.2 μM) | Polysciences Inc. | -- |
| 肠类器官培养 | 基质胶 | Corning | -- |
| Rock抑制剂(Y27632) | Miltenyi | -- | |
| 肠类器官处理 | 人重组RANKL | ProSpec | -- |
| Tweak | PeproTech Inc. | -- | |
| Western blot | 抗NIK抗体(货号# 4994) | Cell signaling technology | 4994 |
| 抗p52抗体(货号# 4882) | Cell signaling technology | 4882 | |
| 抗E-cadherin抗体(货号# 3195) | Cell signaling technology | 3195 | |
| 抗Occludin抗体(货号# 13409-1-AP) | Proteintech | 13409-1-AP | |
| 抗Actin抗体(货号# 66009-1-Ig) | Proteintech Inc | 66009-1-Ig | |
| 抗GAPDH抗体(货号# sc-25778) | Santa Cruz Biotechnology Inc | sc-25778 | |
| 免疫染色 | 多克隆兔抗Ki67(货号# VP-RM04) | Vector Laboratories | VP-RM04 |
| 抗GP2(货号# D278-5,mAb-PE) | MBL International | D278-5 | |
| NIK抗体(货号# sc-7211) | Santa Cruz Biotechnology Inc | sc-7211 | |
| 流式细胞术 | APC eFluor780标记的抗CD45(货号#47-0451-82) | eBioscience | 47-0451-82 |
| PE-Cy7标记的抗CD4(货号#25-0041-82) | eBioscience | 25-0041-82 | |
| APC标记的抗Foxp3(货号#17-5773-82) | eBioscience | 17-5773-82 | |
| FITC标记的抗CD3e(货号#11-0031-81) | eBioscience | 11-0031-81 | |
| PE标记的抗CXCR5(货号#12-7185-80) | eBioscience | 12-7185-80 | |
| eFluor450标记的抗PD-1(货号#48-9981-80) | eBioscience | 48-9981-80 | |
| Alexa Fluor647标记的抗B220(货号#103229) | BioLegend | 103229 | |
| PE标记的抗IL17A(货号#506903) | BioLegend | 506903 | |
| PE标记的IgA(货号# 12-4204-82) | eBioscience | 12-4204-82 | |
| ELISA | 小鼠IL17 ELISA试剂盒 | Lifespan Biosciences Inc | -- |
| 小鼠特异性IgA试剂盒 | Bethyl Laboratories | -- | |
| B细胞分离 | B220 MACS磁珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| 抗PE MACS磁珠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DSS诱导结肠炎 | DSS浓度、处理时间、小鼠年龄和性别、样本量 阅读提示:Methods 'Animal treatments'和图注 |
| 肠类器官培养与处理 | 肠类器官来源、RANKL/Tweak/LTα/β浓度、处理时间、Matrigel浓度 阅读提示:Methods 'Enteroid culture and treatment' |
| CLP脓毒症模型 | 结扎位置、穿刺针头型号、穿孔次数、术后复苏、监测频率 阅读提示:Methods 'CLP sepsis model' |
| 骨髓移植 | 辐射剂量、移植细胞数量、移植途径 阅读提示:Methods 'Bone marrow and PP B cell transplant' |
| 他莫昔芬诱导基因敲除 | 他莫昔芬剂量、给药途径、DSS开始时间 阅读提示:Methods 'Animal treatments' |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号、稀释比例、固定破膜条件、刺激条件(PMA/离子霉素/BFA) 阅读提示:Methods 'Flow cytometry' |
| IgA包被细菌分选 | 粪便悬液制备、离心速度、IgA抗体浓度、MACS分选时间 阅读提示:Methods 'Magnetic activated cell sorting for IgA-coated bacteria' |