DHA诱导内质网应激反应
验证DHA是否引发内质网应激及翻译抑制
对3D7和Cam3.II_rev trophozoites进行DHA短时脉冲处理,检测eIF2α磷酸化(Western blot)和蛋白质合成(3H-色氨酸掺入);并与DTT、氯喹、WR99210比较。
Artemisinin kills malaria parasites by damaging proteins and inhibiting the proteasome.
使用多种疟原虫株、基因敲除/敲低、GFP-DD报告株、蛋白质合成与蛋白酶体活性检测,并验证机制链路和药物拮抗。
恶性疟原虫3D7株(K13野生型) 恶性疟原虫Cam3.II_rev株(K13野生型) PK4-HA-glmS核酶诱导敲低疟原虫株 GFP-DD报告疟原虫株
DHA脉冲处理浓度和时间(如100 nM或1 μM处理60–90分钟) eIF2α磷酸化Western blot检测及PK4敲低(10 mM GlcN)验证 聚泛素化蛋白Western blot检测及CHX、C1、MLN4924共处理浓度和时间 蛋白酶体活性检测(Proteasome-GLO和native gel)及DHA处理时间(60分钟或3小时) 寄生虫存活率评估(药物脉冲后72小时寄生率,SYTO-61流式检测)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DHA是否引发内质网应激及翻译抑制
对3D7和Cam3.II_rev trophozoites进行DHA短时脉冲处理,检测eIF2α磷酸化(Western blot)和蛋白质合成(3H-色氨酸掺入);并与DTT、氯喹、WR99210比较。
鉴定负责eIF2α磷酸化的激酶
利用eIK1、eIK2敲除株和PK4-HA-glmS敲低株,以及PERK抑制剂I处理,检测DHA/DTT诱导的eIF2α磷酸化。
验证DHA是否导致聚泛素化蛋白积累并抑制蛋白酶体活性
DHA处理trophozoites后Western blot检测泛素化蛋白;用Proteasome-GLO和native gel检测蛋白酶体活性;用GFP-DD报告株检测蛋白酶体依赖的降解和蛋白折叠状态。
检验抑制泛素化或翻译能否拮抗DHA杀伤
用CHX、C1(E1抑制剂)、MLN4924预处理trophozoites,再DHA处理,检测泛素化蛋白、eIF2α磷酸化、GFP-DD荧光和寄生虫存活率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 二硫苏糖醇 | Sigma-Aldrich | -- |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- | |
| WR99210 | Sigma-Aldrich | -- | |
| D-(+)-氨基葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 流式分析 | SYTO-61 | Life Technologies | -- |
| 蛋白质提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 药物处理 | 环氧霉素 | Sapphire Bioscience or Sigma | -- |
| b-AP15 | Calbiochem | -- | |
| RA190 | Calbiochem | -- | |
| 化合物1 | Takeda Pharmaceuticals | -- | |
| MLN4924 | MedChemExpress | -- | |
| Shield-1配体 | Cheminpharma | -- | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | ThermoFisher | -- |
| GlutaMAX | ThermoFisher | -- | |
| HEPES | ThermoFisher | -- | |
| AlbuMAX II | Life Technologies | -- | |
| Western blot | 兔抗泛素抗体 | Dako | Z0458 |
| 兔抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3933 | |
| 兔抗磷酸化eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 119A11 | |
| 鼠抗eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | L57A5 | |
| 鼠抗GFP抗体 | Roche | -- | |
| 鼠抗HA抗体 | Sigma | H3663 | |
| 鼠抗20S alpha抗体 | Abcam | 22674 | |
| 山羊抗兔IgG-过氧化物酶 | Sigma-Aldrich | A0545 | |
| 山羊抗鼠IgG-过氧化物酶 | Chemicon | AP127P | |
| 蛋白质合成检测 | 3H-色氨酸 | Perkin Elmer | -- |
| 蛋白酶体活性检测 | Proteasome-GLO检测试剂 | Bio-Rad | -- |
| suc-LLVY-AMC | Enzo Life Sciences | -- | |
| BCA蛋白定量 | BCA实验 | Pierce | -- |
| 凝胶染色 | SimplyBlue安全染液 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DHA诱导内质网应激反应 | DHA浓度(100 nM–1 μM)、处理时间(60–90分钟)、虫株(3D7、Cam3.II_rev)、对照(0.1% DMSO、1 mM DTT) 阅读提示:Methods中Western blotting部分及Fig. 1图注 |
| PK4介导eIF2α磷酸化 | PK4敲低条件(10 mM GlcN从环状体阶段加入)、PERK抑制剂I浓度(20 μM,3–4小时)、eIK1/eIK2敲除株背景 阅读提示:Fig. 1e–g图注及Results对应段落 |
| 蛋白酶体功能检测 | DHA处理时间(60分钟或3小时)、Proteasome-GLO裂解物量(1 μg)、native gel上样量(50 μg)、suc-LLVY-AMC浓度(100 μM) 阅读提示:Methods中Proteasome-GLO和native gel部分及Fig. 2c–e图注 |
| GFP-DD报告实验 | Shield-1维持时间(24小时)、洗脱后药物处理时间(4小时)、流式细胞术门控(SYTO-61) 阅读提示:Fig. 2f–h图注及Methods中流式细胞术部分 |
| 药物脉冲存活率实验 | 虫株同步化时间(环状体0–2 h.p.i.,trophozoite 24–27 h.p.i.)、药物脉冲时间(3小时)、DHA后续处理时间(3小时)、存活率评估时间(72小时)、SYTO-61浓度(2 μM) 阅读提示:Methods中Assessment of parasite viability部分及Fig. 3e–g图注 |