Blnc1在肥胖和NAFLD中的表达分析
验证Blnc1肝脏表达是否与肥胖和肝脏脂肪变性相关。
通过qPCR检测高脂饮食、ob/ob、db/db小鼠及NASH饮食小鼠肝脏中Blnc1表达,并分析其与体重和肝脏甘油三酯含量的相关性。
Long noncoding RNA licensing of obesity-linked hepatic lipogenesis and NAFLD pathogenesis.
包含体外原代肝细胞、体内AAV/腺病毒小鼠模型、全身及肝脏特异性敲除、蛋白质组学与RNA-seq等多层级证据,并有功能与机制验证。
原代小鼠肝细胞 高脂饮食诱导肥胖小鼠 NASH饮食诱导NASH小鼠 Blnc1肝脏特异性敲除小鼠
T0901317灌胃剂量25 mg/kg,每日一次,持续4天 高脂饮食(D12492)喂养时间10周或19周 NASH饮食(D09100301)喂养24周 腺病毒尾静脉注射约0.15 OD/鼠,AAV注射约1×10^11基因组拷贝/鼠 原代肝细胞处理:T0901317 5 μM或SR9238 10 μM处理24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Blnc1肝脏表达是否与肥胖和肝脏脂肪变性相关。
通过qPCR检测高脂饮食、ob/ob、db/db小鼠及NASH饮食小鼠肝脏中Blnc1表达,并分析其与体重和肝脏甘油三酯含量的相关性。
验证Blnc1是否足以促进肝脏脂肪生成。
在原代肝细胞中腺病毒过表达Blnc1,检测LXR激动剂T0901317诱导的基因表达和14C-乙酸掺入脂质;在小鼠中通过AAV过表达Blnc1,检测血浆和肝脏脂质、SREBP1蛋白及脂肪生成基因表达。
验证Blnc1是否为LXR介导的脂肪生成激活所必需。
使用全身Blnc1敲除小鼠和原代肝细胞,给予LXR激动剂T0901317或反向激动剂SR9238,检测脂肪生成基因表达和脂质合成。
验证肝脏Blnc1缺失是否保护小鼠免受高脂饮食诱导的代谢紊乱。
通过腺病毒在Cas9转基因小鼠中表达sgRNA实现肝脏特异性Blnc1敲除,高脂饮食喂养后检测体重、血糖、胰岛素、葡萄糖耐量、胰岛素耐量、肝脏脂质和基因表达。
验证肝脏Blnc1缺失是否改善饮食诱导的NASH。
肝脏特异性Blnc1敲除小鼠喂食NASH饮食24周,检测肝脏损伤标志物、纤维化、炎症基因表达及RNA-seq分析。
鉴定肝脏中与Blnc1相互作用的蛋白质。
使用StA-Blnc1 AAV在小鼠肝脏中表达,链霉亲和素珠纯化Blnc1复合物,质谱鉴定互作蛋白,并通过co-IP和IP/qPCR验证。
验证Blnc1与EDF1和LXRα形成复合物并增强其转录活性。
在HEK293T细胞中共转染Blnc1、HA-EDF1和HA-LXRα,进行IP/qPCR和链霉亲和素沉淀;在原代肝细胞中过表达或敲低EDF1,检测脂肪生成基因表达;进行Srebp1c启动子荧光素酶报告基因和ChIP实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | T0901317 | -- | -- |
| 细胞培养 | SR9238 | -- | -- |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 靶向Edf1的siRNA | Thermo Fisher | S81801, S81802 | |
| 免疫印迹 | 抗hnRNPU抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32315 |
| 抗SREBP1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13551 | |
| 抗HA抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-805 | |
| 抗EDF1抗体 | Proteintech | 12419-1-AP | |
| 抗LXRα抗体 | Abcam | ab41902 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Sigma | T6199 | |
| 抗磷酸化JNK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| 抗总JNK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 抗切割型Caspase3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗YBX1抗体 | Cell Signaling Technology | 4202 | |
| 代谢分析 | 血浆胰岛素ELISA试剂盒 | CrystalChem | -- |
| 羟脯氨酸比色检测试剂盒 | BioVision | -- | |
| ApoBrdU DNA片段化检测试剂盒 | BioVision | -- | |
| 基因表达分析 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| MMLV逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| SYBR Green | Life Technologies | -- | |
| 免疫印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 动物实验 | 综合实验室动物监测系统 | Columbus Instruments | -- |
| 分子克隆 | pGL3-Basic载体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LXR激动剂处理 | T0901317剂量25 mg/kg,每日灌胃一次,持续4天;溶剂为葵花籽油 阅读提示:Methods: Mice段落 |
| 高脂饮食喂养 | 高脂饮食D12492,喂养时间10周或19周;对照饮食为标准鼠粮 阅读提示:Methods: Mice段落;Fig. 3和Fig. 4图注 |
| NASH饮食喂养 | NASH饮食D09100301,喂养24周 阅读提示:Methods: Mice段落;Fig. 6图注 |
| 腺病毒和AAV递送 | 腺病毒尾静脉注射约0.15 OD/鼠;AAV注射约1×10^11基因组拷贝/鼠 阅读提示:Methods: Mice段落 |
| 原代肝细胞处理 | T0901317 5 μM处理24小时;SR9238 10 μM处理24小时;腺病毒转导在分离当天进行 阅读提示:Methods: Cell culture段落;Fig. 1和Fig. 2图注 |