路易体痴呆中神经退行性疾病致病基因的分析

Analysis of neurodegenerative disease-causing genes in dementia with Lewy bodies

作者信息Tatiana Orme, Dena Hernandez, Owen A Ross, Celia Kun-Rodrigues, Lee Darwent, Claire E Shepherd, Laura Parkkinen, Olaf Ansorge, Lorraine Clark, Lawrence S Honig, Karen Marder, Afina Lemstra, Ekaterina Rogaeva, Peter St George-Hyslop, Elisabet Londos, Henrik Zetterberg, Kevin Morgan, Claire Troakes, Safa Al-Sarraj, Tammaryn Lashley, Janice Holton, Yaroslau Compta, Vivianna Van Deerlin, John Q Trojanowski, Geidy E Serrano, Thomas G Beach, Suzanne Lesage, Douglas Galasko, Eliezer Masliah, Isabel Santana, Pau Pastor, Pentti J Tienari, Liisa Myllykangas, Minna Oinas, Tamas Revesz, Andrew Lees, Brad F Boeve, Ronald C Petersen, Tanis J Ferman, Valentina Escott-Price, Neill Graff-Radford, Nigel J Cairns, John C Morris, Stuart Pickering-Brown, David Mann, Glenda Halliday, David J Stone, Dennis W Dickson, John Hardy, Andrew Singleton, Rita Guerreiro, Jose Bras
PMID31996268
发布时间2020-01-29
DOI10.1186/s40478-020-0879-z

摘要

路易体痴呆(DLB)是一种临床异质性疾病,对医疗系统造成沉重负担。然而,该疾病的遗传基础尚未明确界定,其与其他神经退行性疾病的界限也不清晰。本研究对1118例高加索人种DLB患者进行了全外显子组测序,重点关注导致单基因神经退行性疾病的基因。我们分析了60个与DLB、阿尔茨海默病、帕金森病、额颞叶痴呆以及非典型帕金森病或痴呆障碍相关的基因变异,以确定它们在DLB中的发生频率。研究聚焦于既往报道为致病性的变异,同时描述了临床意义仍不明确的报道致病性变异以及具有强风险关联的变异。我们在APP、CHCHD2、DCTN1、GRN、MAPT、NOTCH3、SQSTM1、TBK1和TIA1基因中发现了意义未明的罕见错义变异。此外,我们鉴定出一种致病性GRN p.Arg493*突变,这可能进一步扩展了该突变相关的表型多样性。本队列中既往报道致病性突变的罕见性表明,其他神经退行性疾病与DLB的遗传重叠并不显著。鉴于遗传因素在DLB中的作用已明确,这些数据提示其他遗传位点在该疾病中发挥作用。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Illumina Nextera Rapid Expanded Exome捕获试剂盒(62 Mb)IlluminaNextera Rapid Expanded Exome capture (62 Mb)
Agilent SureSelect Exome捕获试剂盒(v4)AgilentSureSelect Exome Capture Kit (v4)
Illumina HiSeq2500测序仪IlluminaHiSeq2500
Roche FastStart PCR预混液Roche Diagnostics CorpFastStart PCR Master Mix
Applied Biosystems BigDye终止子v3.1测序试剂Applied BiosystemsBigDye terminator version 3.1 sequencing chemistry
ABI3730XL遗传分析仪Applied Biosystems3730XL