潘氏细胞是肠道炎症的起源部位

Paneth cells as a site of origin for intestinal inflammation.

作者信息Timon E Adolph, Michal F Tomczak, Lukas Niederreiter, Hyun-Jeong Ko, Janne Böck, Eduardo Martinez-Naves, Jonathan N Glickman, Markus Tschurtschenthaler, John Hartwig, Shuhei Hosomi, Magdalena B Flak, Jennifer L Cusick, Kenji Kohno, Takao Iwawaki, Susanne Billmann-Born, Tim Raine, Richa Bharti, Ralph Lucius, Mi-Na Kweon, Stefan J Marciniak, Augustine Choi, Susan J Hagen, Stefan Schreiber, Philip Rosenstiel, Arthur Kaser, Richard S Blumberg
PMID24089213
期刊Nature
发布时间2013-11-14
DOI10.1038/nature12599

实验完整度

高

包含体外MODE-K细胞、多种IEC特异性及潘氏细胞特异性小鼠模型、TEM、ChIP与体内药物干预等功能与机制验证

主要模型

MODE-K小鼠小肠上皮细胞系 V-Cre介导的肠上皮细胞特异性基因敲除小鼠 Defa6-Cre介导的潘氏细胞特异性Xbp1敲除小鼠 GFP-LC3转基因报告小鼠

重点核对

Xbp1T-ΔIEC小鼠以连续3天或5天腹腔注射1 mg他莫昔芬诱导Xbp1缺失 Salubrinal按1 mg/kg/d腹腔给药,评价GFP-LC3斑点及肠炎 Rapamycin按1.5 mg/kg/d腹腔给药连续14天 BAY11-7082在Xbp1ΔIEC小鼠按5 mg/kg隔日给药14天,在Xbp1T-ΔIEC小鼠按20 mg/kg给药5天 小鼠8–10周龄用于全部实验,随机分配至处理组

摘要

自噬相关16样1(ATG16L1)作为遗传风险因素,揭示了自噬在克罗恩病(CD)中的关键作用。高度流行的ATG16L1风险等位基因纯合或小鼠亚效(HM)活性会导致潘氏细胞功能障碍。由于Atg16l1HM小鼠不会自发发生肠道炎症,ATG16L1导致疾病的机制仍不清楚。在肠上皮细胞(IEC)中缺失未折叠蛋白反应(UPR)转录因子X-box结合蛋白-1(Xbp1)(其人类直系同源基因携带罕见炎症性肠病(IBD)风险变异)会导致内质网(ER)应激、潘氏细胞损伤和自发性肠炎。未缓解的ER应激是IBD上皮的共同特征,且CD的若干遗传风险因素影响潘氏细胞。在此我们显示,IEC中UPR(Xbp1ΔIEC)或自噬功能(Atg16l1ΔIEC或Atg7ΔIEC)的损伤会导致彼此代偿性激活,而若两种机制均受损,则会发生严重的自发性CD样透壁性回肠炎。Xbp1ΔIEC小鼠的亚效潘氏细胞中表现出自噬体形成,这通过蛋白激酶RNA样内质网激酶(PERK)、延伸起始因子2α(eIF2α)和激活转录因子4(ATF4)与ER应激相关联。回肠炎依赖于共生微生物群,并源于IEC死亡增加、肌醇需求酶1α(IRE1α)调控的NFκB激活和肿瘤坏死因子信号,这些在自噬缺陷时协同增加。ATG16L1抑制IRE1α活性,而IEC中自噬的增强可改善ER应激诱导的肠道炎症,并缓解NFκB过度激活和IEC死亡。ER应激、自噬诱导和自发性回肠炎源于潘氏细胞特异性Xbp1缺失。因此,潘氏细胞内受遗传和环境控制的UPR功能可能决定了在ATG16L1亚效功能下发生肠道炎症的阈值,并提示回肠CD是潘氏细胞的一种特定疾病。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
ATG16L1及自噬功能如何通过肠上皮细胞(尤其潘氏细胞)的UPR与ER应激机制参与克罗恩病样肠道炎症的发生。
核心机制
XBP1缺失引起ER应激并激活PERK/eIF2α/ATF4轴诱导自噬作为代偿;ATG16L1/ATG7依赖的自噬抑制IRE1α-NFκB-TNF信号,自噬缺陷时该代偿丧失,导致IEC死亡增加和透壁性回肠炎。
主要证据
在shXbp1 MODE-K细胞、Xbp1ΔIEC、Atg16l1ΔIEC、Atg7ΔIEC及双敲小鼠和Xbp1ΔPC小鼠中,通过免疫印迹、TEM、ChIP、TUNEL、流式细胞术及肠炎组织学评分,显示双敲小鼠发生透壁性炎症,salubrinal、rapamycin和BAY11-7082可减轻炎症。
研究意义
作者提出潘氏细胞内受遗传和环境调控的UPR功能可能决定ATG16L1亚效功能下肠道炎症发生的阈值,并提示回肠CD可能是潘氏细胞的一种特定疾病。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外验证Xbp1缺失诱导自噬

明确XBP1缺失的肠上皮细胞是否发生自噬诱导。

用shXbp1慢病毒载体稳定转导MODE-K细胞,检测ATG7、Beclin1、LC3-I/II转换、巴弗洛霉素处理后的自噬流、GFP-LC3斑点及电镜自噬泡。

2

体内验证Xbp1缺失在潘氏细胞诱导自噬

在体内定位Xbp1缺失诱导自噬的细胞类型。

在Xbp1ΔIEC和Xbp1T-ΔIEC小鼠中检测原代IEC的LC3转换、p62、ATG16L1及电镜自噬泡,并用GFP-LC3报告共定位溶酶体阳性潘氏细胞。

3

解析PERK/eIF2α/ATF4通路介导自噬

确定UPR诱导自噬的信号通路。

在shXbp1 MODE-K细胞中检测p-PERK、p-eIF2α、ATF4、CHOP,用siPerk、siGadd34及抗ATF4 ChIP-qPCR检测LC3b和Atg7启动子结合,并用salubrinal处理小鼠。

4

构建自噬与Xbp1双基因敲除小鼠并评估肠炎

验证自噬缺失对XBP1缺陷所致肠炎的影响。

构建Atg7/Xbp1ΔIEC和Atg16l1/Xbp1ΔIEC小鼠,进行肠炎组织学评分、H&E与电镜观察,并追踪18周病程。

5

验证IRE1α-NFκB-TNF及IEC死亡机制

明确双敲小鼠严重肠炎的效应通路。

检测TUNEL、p-IκBα、p-IRE1α、NFκB活性,使用Ern1/Xbp1ΔIEC、Tnfrsf1a−/−及无菌重派生小鼠,并用BAY11-7082干预。

6

验证自噬诱导对ER应激性肠炎的治疗作用

检测增强自噬能否缓解XBP1缺陷所致肠炎。

用rapamycin处理Xbp1ΔIEC及双敲小鼠,检测自噬、NFκB、TUNEL和肠炎评分。

7

潘氏细胞特异性Xbp1缺失验证起源细胞

验证潘氏细胞是否为炎症起源部位。

构建Defa6-Cre;Xbp1fl/fl(Xbp1ΔPC)小鼠,确认Cre仅在溶酶体阳性潘氏细胞中活性,检测自噬、ER应激、潘氏细胞颗粒及肠炎。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
他莫昔芬MP Biomedicals--
抗LC3B抗体Sigma AldrichL7543
抗β-actin抗体Cell Signaling Technology4970
抗eIF2α抗体Cell Signaling Technology9722
抗磷酸化eIF2α抗体Cell Signaling Technology3597
抗PERK抗体Cell Signaling Technology3192
抗磷酸化PERK抗体Cell Signaling Technology3179
抗ATG7抗体Cell Signaling Technology8558
抗Beclin-1抗体Cell Signaling Technology3495
抗CHOP抗体Cell Signaling Technology5554
抗p62抗体Cell Signaling Technology5114
抗IRE1α抗体Cell Signaling Technology3294
抗磷酸化IRE1α抗体Abcam48187
抗ATG16L1抗体MBLM150-3
抗GRP78抗体Novus BiologicalsNBP1-06274
抗ATF4抗体Santa Cruz Biotechnologysc-200
抗IRE1α抗体Santa Cruz Biotechnology20790
肿瘤坏死因子Peprotech315-01A
巴弗洛霉素A1Sigma AldrichB1793
雷帕霉素LC LaboratoriesR-5000
BAY11-7082Calbiochem--
salubrinalAlexis BiochemicalsALX-270-428
JNK抑制剂SP600125Sigma AldrichSP600125
N-乙酰半胱氨酸Sigma AldrichA9165
谷胱甘肽CalbiochemNOVG3541
TUNEL细胞死亡检测试剂盒Roche--
BrdU原位检测试剂盒BD Pharmingen--
Annexin VBiolegend--
碘化丙啶Biolegend--
CM-H2DCFDAMolecular Probes--
Lipofectamine LTXInvitrogen--
NFκB p65转录因子检测试剂盒Thermo Scientific--
Dispase酶----
Percoll分离液----
葡聚糖硫酸钠TdB Consultancy--
QIAEX凝胶提取试剂盒Qiagen--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
他莫昔芬诱导Xbp1缺失
给药剂量1 mg、连续3天或5天、腹腔注射、小鼠周龄8–10周
阅读提示:Methods中的Mice小节及相应Figure legend
Salubrinal体内干预
1 mg/kg/d、腹腔注射、首次他莫昔芬前24小时开始、3天或5天方案
阅读提示:Methods中的Salubrinal, rapamycin and BAY11-7082 treatment in vivo小节及Extended Data Fig. 2a、3g
Rapamycin体内干预
1.5 mg/kg/d、连续14天腹腔注射
阅读提示:Methods中的Salubrinal, rapamycin and BAY11-7082 treatment in vivo小节
BAY11-7082体内干预
Xbp1ΔIEC小鼠5 mg/kg隔日14天;Xbp1T-ΔIEC小鼠20 mg/kg连续5天
阅读提示:Methods中的Salubrinal, rapamycin and BAY11-7082 treatment in vivo小节
肠炎组织学评分
五分项评分系统、范围因子、评分者盲法
阅读提示:Methods中的Histology小节
DSS结肠炎模型
4% DSS饮水5天、疾病活动指数评分
阅读提示:Methods中的Dextran Sodium Sulfate induced colitis小节
统计设计
每组通常n=6–10、检验方法、p<0.05
阅读提示:Methods中的Statistical methods小节