转录组变化及ONECUT1在人胚胎干细胞胰腺分化中的作用

Transcriptional changes and the role of ONECUT1 in hPSC pancreatic differentiation

作者信息Sandra Heller, Zhijian Li, Qiong Lin, Ryan Geusz, Markus Breunig, Meike Hohwieler, Xi Zhang, Gopika G Nair, Thomas Seufferlein, Matthias Hebrok, Maike Sander, Cécile Julier, Alexander Kleger, Ivan G Costa
PMID34789845
期刊Commun Biol
发布时间2021-11-17
DOI10.1038/s42003-021-02818-3

摘要

胰腺发育过程中的细胞类型特化受到转录与表观遗传网络的严格调控。然而,大多数转录因子的确切功能仅在鼠类中有所描述。为将这些概念转化至人类胰腺发育研究,可采用替代模型系统,如人类多能干细胞体外胰腺分化模型。本研究通过分析阶段特异性RNA测序、ChIP测序及ATAC测序数据,系统解析了胰腺发育过程中的转录调控机制。人类多能干细胞胰腺分化过程的转录组与开放染色质图谱显示,已知胰腺转录因子呈现阶段特异性表达模式,并揭示ONECUT1作为胰腺祖细胞命运决定的关键调控因子。此外,数据表明ONECUT1还参与调控胰腺祖细胞后续内分泌特化的准备工作。通过解析转录调控网络,本研究确立了ONECUT1在该网络中的重要作用,相关成果将为人类发育与疾病研究提供重要资源。

实验方法

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