检测T细胞攻击后IEC的线粒体呼吸功能
评估T细胞介导损伤对IEC生物能量学的影响
利用allo-HCT模型(BALB/c→B6)和syngeneic对照,在移植后21天分离CD326+ IEC,使用Seahorse分析OCR和ECAR,并测量复合物活性。
Mitochondrial complex II in intestinal epithelial cells regulates T cell-mediated immunopathology
包含多个证据层级:细胞代谢检测(Seahorse、代谢物谱)、化学抑制剂和基因敲除模型(Sdhaf1-/-、SdhaΔ/IEC)的功能验证、体内GVHD模型及人类样本验证。
小鼠骨髓移植(HCT)诱导的移植物抗宿主病(GVHD)模型(BALB/c→B6) T细胞转移结肠炎模型(CD45RBhigh T细胞→RAG-1-/-) 抗CTLA-4抗体诱导的结肠炎模型 人类结肠活检样本(GVHD和非GVHD)
T细胞介导的肠道损伤模型中肠道上皮细胞(IEC)中SDHA蛋白水平显著降低,而其他器官(如肾、心)无变化 SdhaΔ/IEC(IEC特异性敲除SDHA)小鼠在allo-HCT后GVHD严重程度和死亡率显著增加 化学SDHA抑制剂(丙二酸、衣康酸、atpenin A5)处理可加重allo-HCT小鼠GVHD并增加死亡率 SDHA减少导致IEC氧消耗率(OCR)降低、琥珀酸蓄积和ROS产生增加
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估T细胞介导损伤对IEC生物能量学的影响
利用allo-HCT模型(BALB/c→B6)和syngeneic对照,在移植后21天分离CD326+ IEC,使用Seahorse分析OCR和ECAR,并测量复合物活性。
确定T细胞介导损伤对IEC中TCA循环中间产物的影响
通过LC/MS分析移植后21天IEC中TCA循环代谢物水平,包括琥珀酸、苹果酸、富马酸等,并检查糖酵解是否代偿。
确认SDHA蛋白水平降低并探究琥珀酸蓄积机制
通过Western blot、免疫荧光和免疫电镜检测IEC中SDHA蛋白水平,利用13C标记代谢物进行代谢流分析以排除其他来源的琥珀酸合成。
确定SDHA减少是否只限于T细胞介导的肠道损伤
在多种T细胞介导的结肠炎模型(MHC不匹配、mHA不匹配、T细胞转移、抗CTLA-4)以及非T细胞介导的DSS结肠炎模型中检测SDHA和琥珀酸水平。
评估SDHA活性降低对IEC细胞死亡和线粒体功能的影响
使用SDHA抑制剂(丙二酸、衣康酸、4-辛基衣康酸)处理原代结肠上皮细胞,检测ROS产生、ATP生成和细胞死亡,并进行CTL杀伤实验。
证明IEC中SDHA减少加重GVHD严重程度
使用化学抑制剂(丙二酸、衣康酸、atpenin A5)全身给药,并利用Sdhaf1-/-和IEC特异性敲除小鼠(SdhaΔ/IEC)作为HCT受体,评估存活率和GVHD严重程度。
确认在人类GVHD样本中SDHA表达下降
收集31例疑似下消化道GVHD患者的结肠活检样本,通过免疫荧光染色定量SDHA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 完全上皮细胞培养基 | Cell Biologics | M6621 |
| 4-辛基衣康酸 | Sigma-Aldrich | SML2338 | |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L4005 | |
| 造血细胞移植 | CD90.2微珠 | Miltenyi Biotec | 130-121-278 |
| 丙二酸二甲酯 | Sigma-Aldrich | 136441 | |
| 衣康酸二甲酯 | Sigma-Aldrich | 09533 | |
| 阿培宁A5 | Cayman Chemical | 11898 | |
| 琥珀酸 | Sigma-Aldrich | S3674 | |
| 结肠炎模型 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | 0216011010 |
| 抗CTLA-4单克隆抗体 | Bio X Cell | BE0164 | |
| 代谢物分析 | 13C-葡萄糖 | Cambridge Isotopes | CLM-1396-1 |
| 13C-棕榈酸钾 | Sigma-Aldrich | 605751 | |
| 无脂肪酸牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A6003 | |
| 细胞分离 | 无钙镁HBSS | Thermo Fisher Scientific | 14185052 |
| 碳酸氢钠 | Sigma-Aldrich | S6014 | |
| 胎牛血清 | Gemini Bio Products | 100-106 | |
| APC抗CD326抗体 | Biolegend | 118214 | |
| 抗APC磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-090-855 | |
| SDH染色 | 琥珀酸二钠六水合物 | Sigma-Aldrich | 8201510100 |
| EDTA二钠 | Sigma-Aldrich | 324503 | |
| 磷酸二氢钠一水合物 | Sigma-Aldrich | S3522 | |
| 磷酸氢二钠七水合物 | Sigma-Aldrich | S9390 | |
| 氮蓝四唑 | Sigma-Aldrich | 484235 | |
| 线粒体分离 | 蔗糖 | Sigma-Aldrich | S0389 |
| 甘露醇 | Sigma-Aldrich | M9546 | |
| EGTA | Sigma-Aldrich | E0396 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | 78429 | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Thermo Scientific | 89901 |
| 抗SDHA抗体 | Abcam | ab14715 | |
| 总OXPHOS啮齿动物抗体混合物 | Abcam | ab110413 | |
| 抗ClpP抗体 | Abcam | ab124822 | |
| Tom20抗体 | Cell Signaling Technology | 42406 | |
| 抗β肌动蛋白抗体 | Abcam | 8226 | |
| 抗兔HRP二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| 抗鼠HRP二抗 | Santa Cruz Biotechnology | sc-516102 | |
| 超敏ECL底物 | Thermo Scientific | -- | |
| BN-PAGE | NativePAGE样品缓冲液 | Thermo Scientific | BN2008 |
| NativePAGE凝胶 | Thermo Scientific | BN1001 | |
| 胶体蓝染色试剂盒 | Thermo Scientific | LC6025 | |
| NuPage 2D孔 | Thermo Scientific | NP0326 | |
| 总OXPHOS蓝色天然抗体混合物 | Abcam | ab110412 | |
| 免疫荧光 | Triton-X100 | Sigma-Aldrich | X100 |
| COX IV抗体 | Abcam | ab16056 | |
| Cy3标记抗鼠IgG二抗 | BioLegend | 405309 | |
| DyLight488标记抗兔IgG二抗 | BioLegend | 406404 | |
| 含DAPI的Prolong Gold封片剂 | Thermo Scientific | P36931 | |
| 哌莫硝唑 | Hypoxyprobe, Inc. | -- | |
| 透射电镜 | 山羊金标记物封闭液 | AURION | 905.002 |
| 10nm金标记抗鼠IgG二抗 | AURION | 810.022 | |
| 线粒体DNA分析 | DNeasy血液和组织试剂盒 | QIAGEN | 69504 |
| PowerUP SYBR绿色预混液 | Applied Biosystems | A25742 | |
| 琥珀酸定量 | 琥珀酸检测试剂盒 | Abcam | ab204718 |
| Seahorse分析 | Seahorse XF完全检测培养基 | Aglient | 103335-100 |
| NADH | Sigma-Aldrich | 10107735001 | |
| 基质胶 | Corning | 354262 | |
| 苹果酸 | Sigma-Aldrich | M0875 | |
| 杜罗醌醇 | TCI | T0822 | |
| ADP | Sigma-Aldrich | A2754 | |
| 皂素 | Sigma-Aldrich | SAE0073 | |
| ATP检测 | Cell Titer Glo 2.0发光检测 | Promega | G9243 |
| 复合体I活性检测 | 复合体I酶活性检测试剂盒 | Abcam | ab109721 |
| NAD+/NADH检测 | NAD+/NADH定量试剂盒 | BioVision | K337-100 |
| CTL实验 | CD8+T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-117-044 |
| Lumaplate闪烁板 | PerkinElmer | 600633 | |
| 重组小鼠IFN-γ蛋白 | R&D Systems | 485-MI | |
| 流式细胞术 | CellROX深红染料 | Thermo Scientific | C10491 |
| MitoSOX染料 | Thermo Scientific | M36008 | |
| JC-1染料 | Thermo Scientific | M34152 | |
| 7-AAD | BioLegend | 420404 | |
| 膜联蛋白V | Biolegend | 640947 | |
| 抗CD16/CD32抗体 | BD Biosciences | 2.4G2 | |
| APC抗CD45.2抗体 | BioLegend | 109814 | |
| FITC抗CD45.2抗体 | Biolegend | 109806 | |
| 绿色CMFDA染料 | Invitrogen | C7025 | |
| 抗SDHA抗体 | Abcam | ab14715 | |
| 抗SDHB抗体 | Abcam | ab178423 | |
| RT-PCR | RNeasy试剂盒 | QIAGEN | 74104 |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4374966 | |
| 染色质免疫沉淀 | SimpleChIP Plus超声染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 56383 |
| CRISPR敲除 | tracrRNA | IDT | 1075928 |
| Cas9蛋白 | Invitrogen | A36499 | |
| 原代细胞核转染液 | Lonza | V4XP-3032 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 造血细胞移植模型 | 照射剂量(10 Gy)、T细胞数(3×10^6)、TCD-BM细胞数(5×10^6)、供体受体组合 阅读提示:Methods: Hematopoietic cell transplantation |
| IEC分离 | CD326+细胞纯化方法、EDTA浓度、孵育时间(40分钟) 阅读提示:Methods: Cell isolation |
| 线粒体呼吸测量 | Seahorse分析条件(细胞数、培养基成分、底物浓度) 阅读提示:Methods: Seahorse analysis |
| SDHA蛋白检测 | 抗体编号(ab14715)、稀释度、样品制备方法 阅读提示:Methods: Immunoblot analysis, Fluorescent immunohistochemistry |
| SDHA功能抑制 | 抑制剂浓度和处理时间(如malonate 5g/kg, itaconate 2.5g/kg) 阅读提示:Methods: Hematopoietic cell transplantation, In vitro allogeneic cytotoxic T lymphocyte assay |
| 遗传模型 | SdhaΔ/IEC小鼠构建方法、品系背景 阅读提示:Methods: Mice |