检测结直肠癌中铁调素异位表达及铁含量
验证结直肠癌组织中铁含量升高、铁调素表达上调及铁转运蛋白缺失
通过普鲁士蓝染色检测人结直肠癌组织铁含量;通过免疫组化检测小鼠肿瘤中铁转运蛋白表达;通过qPCR检测小鼠和人结直肠癌组织中Hamp mRNA水平;通过Kaplan-Meier生存分析评估铁调素表达与患者生存的关系;通过TCGA数据分析HAMP表达。
Hepcidin sequesters iron to sustain nucleotide metabolism and mitochondrial function in colorectal cancer epithelial cells
包含体内遗传小鼠模型、患者来源类器官、细胞系、代谢组学、海马线粒体功能检测及回补实验等多个独立证据层级,并进行了功能与机制验证。
患者来源结直肠癌肿瘤类器官 散发性结直肠癌小鼠模型(CDX2Cre;APCfl/+;Hampfl/fl 和 CDX2Cre;APCfl/+;Fpnfl/fl) 结直肠癌细胞系(HCT116、SW480、DLD1、RKO、CT26)
小鼠模型中结肠上皮特异性敲除Hamp或Slc40a1(Fpn) 患者来源肿瘤类器官及CRC细胞系使用DFO(10μM或100μM)处理 HIF-2α对铁调素启动子的激活(荧光素酶报告基因) 外源性核苷混合物(100μM)或天冬氨酸(100μM)回补实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证结直肠癌组织中铁含量升高、铁调素表达上调及铁转运蛋白缺失
通过普鲁士蓝染色检测人结直肠癌组织铁含量;通过免疫组化检测小鼠肿瘤中铁转运蛋白表达;通过qPCR检测小鼠和人结直肠癌组织中Hamp mRNA水平;通过Kaplan-Meier生存分析评估铁调素表达与患者生存的关系;通过TCGA数据分析HAMP表达。
确定结肠上皮铁调素和铁转运蛋白对结直肠癌肿瘤发生的影响
构建结肠上皮特异性Hamp敲除(HampΔCE)和Fpn敲除(FpnΔCE)的散发性CRC小鼠模型,分析肿瘤数量、大小和负荷;同时构建CT26细胞过表达铁调素的异种移植模型,测量肿瘤重量。
探究肿瘤微环境中HIF-2α是否直接调控铁调素转录
使用HIF-2α缺陷小鼠检测Hamp表达;利用铁调素启动子荧光素酶报告基因(包含HRE)检测HIF-2α的转录激活;并评估FG4592或HIF-2α稳定表达对HAMP内源表达的影响。
揭示铁在结直肠癌代谢中的优先用途
对患者来源肿瘤类器官进行DFO处理,并进行非靶向代谢组学分析;同时分析HampΔCE和FpnΔCE小鼠肿瘤的代谢组学,比较核苷酸代谢物变化。
验证核苷酸代谢恢复能否逆转铁螯合引起的生长抑制
在CRC细胞系和患者来源类器官中,用DFO处理后,加入核苷混合物(腺苷、鸟苷、胞苷、胸苷)或天冬氨酸,检测细胞生长(MTT、结晶紫、类器官大小)变化。
确定铁螯合对线粒体呼吸和功能的影响
使用海马分析仪测量CRC细胞系在DFO处理后氧消耗率;检测NAD+/NADH比值;通过Western blot检测线粒体呼吸链复合物蛋白(SDHB、FECH等)的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 多西环素 | -- | -- |
| FG4592 | Selleckchem | -- | |
| 人重组铁调素 | Bachem | -- | |
| 去铁胺 | Sigma-Aldrich | 70-51-9 | |
| 5-氮杂胞苷 | Cayman | -- | |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 腺苷 | Sigma | 58-61-7 | |
| 胞嘧啶 | Sigma | 71-30-7 | |
| 胸苷 | Sigma | 50-89-5 | |
| 鸟苷 | Sigma | 118-00-3 | |
| AZ6102 | PeproTech | -- | |
| CPI-455 | Peprotech | -- | |
| 吉维诺司他 | Peprotech | -- | |
| SP2509 | Peprotech | -- | |
| NVP-TNKS656 | Peprotech | -- | |
| I-BET-762 | Peprotech | -- | |
| OTX015 | Peprotech | -- | |
| JIB-04 | Peprotech | -- | |
| 细胞培养 | 杀稻瘟菌素 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | MTT试剂 | Alfa Aesar | 298-93-1 |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| Western blot | GFP抗体 | Proteintech | 66002-1-Ig |
| SDHB抗体 | Proteintech | 10620-1-AP | |
| FECH抗体 | Proteintech | 14466-1-AP | |
| 肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1 | |
| 铁转运蛋白抗体 | Novus | 21502 | |
| 铁蛋白抗体 | Cell Signaling | 3998 | |
| OXPHOS抗体混合物 | Abcam | ab110413 | |
| 流式细胞术 | EPCAM抗体 | BioLegend | 118205 |
| CD11c抗体 | BioLegend | 117305 | |
| CD11b抗体 | EBioscience | 17-0112-83 | |
| Ly6C抗体 | BD Horizon | 560594 | |
| F4/80抗体 | BD Horizon | 563633 | |
| CD45抗体 | Invitrogen | 47-0451-82 | |
| 免疫组化 | 抗铁转运蛋白抗体 | Novus | 21502 |
| 抗铁调素抗体 | Abcam | 30760 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | 15580 | |
| 代谢组学 | KGM-Gold角质形成细胞生长培养基 | Lonza | -- |
| 代谢物检测 | NAD/NADH-Glo试剂盒 | Promega | -- |
| 血清铁调素检测 | 铁调素ELISA试剂盒 | Intrinsic LifeSciences | -- |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | 10540-29-1 |
| 氧化偶氮甲烷 | -- | -- | |
| 硫酸葡聚糖钠 | -- | -- | |
| 铁含量检测 | 普鲁士蓝染色 | -- | -- |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| RNA分析 | Trizol试剂 | -- | -- |
| 蛋白质检测 | 报告基因裂解缓冲液 | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、基因型、年龄、性别、饮食、诱导方法、观察时间 阅读提示:Methods - Animals |
| 细胞系培养 | 细胞系名称、培养基、血清浓度、抗生素、培养条件、处理试剂浓度及时间 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 患者来源类器官 | 类器官来源、培养基、DFO浓度、处理时间、生长测量方法 阅读提示:Methods - Mouse- and patient-derived enteroids |
| 代谢组学 | 样本类型、处理条件、提取方法、LC-MS/MS参数、数据分析方法 阅读提示:Methods - Metabolomics on enteroids |
| 线粒体功能 | 细胞密度、DFO浓度、处理时间、Seahorse分析参数、归一化方法 阅读提示:Methods - Seahorse Mitochondria Stress Test |