IL-10/Fc扩增终末耗竭CD8+ TIL
验证IL-10/Fc处理是否能扩增终末耗竭CD8+ TIL亚群。
在B16F10肿瘤模型中,过继转移PMEL CD8+ T细胞并给予IL-10/Fc或PBS,通过流式细胞术分析CD8+ TIL亚群。
Metabolic reprogramming of terminally exhausted CD8+ T cells by IL-10 enhances anti-tumor immunity
包含体外细胞共培养、Seahorse代谢分析、体内肿瘤模型、基因敲除小鼠及RNA-seq等多层级验证,并明确功能与机制验证。
B16F10黑色素瘤小鼠模型 YUMM1.7-OVA黑色素瘤小鼠模型 MC38-HER2结肠癌小鼠模型 PMEL和OT-I TCR转基因T细胞
IL-10/Fc剂量:20 μg,瘤周注射 过继转移T细胞数量:5×10^6 B16F10肿瘤细胞接种量:1×10^6 处理时间:从第6天开始,隔天给药,共4或8次 MPC1-KO验证:MPC1基因敲除的OT-I T细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证IL-10/Fc处理是否能扩增终末耗竭CD8+ TIL亚群。
在B16F10肿瘤模型中,过继转移PMEL CD8+ T细胞并给予IL-10/Fc或PBS,通过流式细胞术分析CD8+ TIL亚群。
确定IL-10/Fc是否通过T细胞上的IL-10R起作用。
使用IL-10Rα-KO P14 T细胞进行体内共转移实验,并检测其扩增情况。
验证IL-10/Fc是否直接扩增终末耗竭T细胞且是否依赖抗原。
共转移PMEL和OT-I T细胞,或使用Tcf7DTR-GFP系统清除祖细胞后观察终末耗竭T细胞扩增;体外分选PD-1+TIM-3+和PD-1+TIM-3-细胞进行培养。
研究IL-10/Fc对CD8+ T细胞代谢的影响。
使用Seahorse分析OCR和ECAR,检测T细胞氧化磷酸化水平。
验证IL-10/Fc在体内对终末耗竭TIL代谢和基因表达的影响。
从肿瘤中分选PD-1+TIM-3+CD8+ TIL进行Seahorse和RNA-seq分析。
确定IL-10/Fc促进OXPHOS的分子机制。
使用代谢抑制剂(ETO、BPTES、2DG、UK5099)处理T细胞,并检测MPC1-KO T细胞的反应。
评估IL-10/Fc与ACT或ICB联合的抗肿瘤疗效。
在多个肿瘤模型中,给予ACT和IL-10/Fc联合治疗,监测肿瘤生长和生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| T细胞制备 | 小鼠IL-2 | PeproTech | -- |
| 小鼠IL-7 | PeproTech | -- | |
| hgp10025-33肽 | GenScript | -- | |
| OVA257-264肽 | GenScript | -- | |
| Ficoll-Paque PLUS密度梯度离心液 | GE Healthcare | -- | |
| 流式分析 | 抗小鼠CD16/32抗体 | BioLegend | -- |
| DAPI | Sigma-Aldrich | -- | |
| Zombie Aqua固定染料 | BioLegend | -- | |
| Cytofix/Cytoperm固定/透化试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | -- | |
| 细胞刺激混合物 | Invitrogen | -- | |
| Attune NxT流式细胞仪 | Invitrogen | -- | |
| FlowJo 10.6.1软件 | Tree Star | -- | |
| 抗PD-1抗体 (29F.1A12) | BioLegend | -- | |
| 抗TIM-3抗体 (RMT3-23) | BioLegend | -- | |
| 抗TCF-1抗体 (C63D9) | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗颗粒酶B抗体 (GB11) | BioLegend | -- | |
| 抗IFN-γ抗体 (XMG1.2) | BioLegend | -- | |
| 抗TNF-α抗体 (MP6-XT22) | BioLegend | -- | |
| 免疫荧光 | 抗CD3抗体 (SP7) | Abcam | -- |
| Alexa Fluor 488偶联的山羊抗兔二抗 | Invitrogen | A-11008 | |
| MitoTracker Green FM | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MitoTracker Deep Red FM | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞分选 | 小鼠CD8 (TIL) 磁珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| Aria II分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| Seahorse实验 | XF96 Seahorse细胞外流量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 寡霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| FCCP | Sigma-Aldrich | -- | |
| 鱼藤酮 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 代谢抑制实验 | 依托莫昔 | Sigma-Aldrich | -- |
| BPTES | Sigma-Aldrich | -- | |
| UK5099 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Cell Signaling Technology | -- | |
| NuPAGE电泳系统 | Invitrogen | -- | |
| PVDF膜 | Invitrogen | -- | |
| Trans-Blot SD半干转印槽 | Bio-Rad | -- | |
| SignalFire ECL试剂 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗p-STAT3抗体 (Tyr705, D3A7) | Cell Signaling Technology | 9145S | |
| 抗MPC1抗体 (D2L9I) | Cell Signaling Technology | 14462S | |
| HRP偶联的山羊抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| HRP偶联的β-肌动蛋白单克隆抗体 (BA3R) | Invitrogen | MA5-15739-HRP | |
| RNA-seq | Hard-Shell 96孔PCR板 | Bio-Rad | -- |
| RNA酶抑制剂 | Takara | -- | |
| HiSeq3000测序仪 | Illumina | -- | |
| 动物实验 | 白喉毒素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抗PD-1抗体 (RMP1-14) | Bio X Cell | -- | |
| CAR-T生产 | 生物素化的人Her2/ErbB2蛋白 | Acro Biosystems | -- |
| 亲和素-Alexa Fluor 488偶联物 | Invitrogen | -- | |
| pCL-Eco包装质粒 | -- | -- | |
| pVSV-G质粒 | -- | -- | |
| Delta 8.9质粒 | -- | -- | |
| T细胞培养 | 小鼠T细胞活化CD3/CD28 Dynabeads | Gibco | -- |
| RetroNectin重组人纤连蛋白片段 | Clontech | -- | |
| 细胞培养 | ACK裂解液 | Gibco | -- |
| IV型胶原酶 | Gibco | -- | |
| 分散酶II | Sigma-Aldrich | -- | |
| 透明质酸酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | -- | |
| Percoll分离液 | GE Healthcare | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 低糖RPMI培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| FreeStyle 293-F细胞 | Gibco | -- | |
| 蛋白生产 | HiTrap Protein A亲和层析柱 | GE Healthcare | -- |
| AKTA pure 25蛋白纯化系统 | GE Healthcare | -- | |
| Vivaspin超滤管 | GE Healthcare | -- | |
| Superdex 200分子筛层析柱 | GE Healthcare | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型建立 | 肿瘤细胞类型、接种数量、接种部位;小鼠品系和性别;IL-10/Fc剂量和给药途径 阅读提示:Methods:Mice, Cells and tumor models |
| 过继T细胞转移 | T细胞类型(PMEL、OT-I等)、激活状态、转移数量、转移时间 阅读提示:Methods:Preparation of ... T cells, Anti-tumor therapy |
| IL-10/Fc治疗 | IL-10/Fc剂量(20 μg)、给药频率(隔天)、给药次数(4或8次)、给药途径(瘤周) 阅读提示:Methods:Anti-tumor therapy, Figure legends |
| 代谢分析 | Seahorse实验中细胞数、处理条件(IL-10/Fc浓度、抑制剂浓度)、检测指标(OCR、ECAR) 阅读提示:Methods:Seahorse assay, Metabolic inhibitor treatments |
| 基因表达分析 | RNA-seq样本制备、分选策略、测序平台、差异表达阈值 阅读提示:Methods:RNA sequencing and bioinformatics analysis |
| MPC1功能验证 | MPC1-KO小鼠构建、验证方法、体外和体内实验条件 阅读提示:Methods:Mice, Preparation of ... T cells |