空间组学揭示肿瘤异质性

Spatial omics illuminates tumor heterogeneity.

作者信息Neha Srinivas, Serap Erdogmus, Gurkan Mollaoglu
PMID42320479
发布时间2026-08-17
DOI10.1016/j.crmeth.2026.101504

实验完整度

低

本文为综述,未提供原始实验方法、样本、分组或验证数据,仅总结已有研究。

摘要

瘤内异质性(ITH)是指单个肿瘤内存在多种癌细胞状态、基因型和微环境生态位,是治疗耐药和疾病进展的主要驱动因素。虽然ITH的临床意义已得到充分认识,但传统方法和模型在解析ITH的空间和功能复杂性方面存在局限。单细胞和空间组学、高多重成像以及体内CRISPR扰动和谱系示踪的最新进展,现在使得对肿瘤生态系统进行前所未有的机制性剖析成为可能。这些技术开始揭示细胞间相互作用、空间组织和克隆演化如何共同塑造肿瘤行为和治療反应。我们综述了空间蛋白质组学和转录组学、功能基因组学和克隆示踪的新兴方法,并强调它们的整合如何重新定义ITH研究。我们还讨论了当前挑战,包括可扩展性、可及性和多模态数据整合,以及癌症生物学进入空间时代的机遇。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何利用新兴空间组学、体内CRISPR扰动和谱系示踪技术解析肿瘤内异质性的空间和功能复杂性?
核心机制
细胞间相互作用、空间组织和克隆演化共同塑造肿瘤行为和治療反应;空间功能基因组学将CRISPR扰动与空间表型读出结合,建立基因事件与表型间的因果机制。
主要证据
综述引用的多项空间蛋白质组学、空间转录组学、空间功能基因组学和空间克隆示踪研究,在多种癌症模型中揭示了空间生态位、克隆动态和免疫微环境特征。
研究意义
空间生物学方法正在革新对肿瘤异质性的理解,有望改进预后预测和免疫治疗反应预测,并推动临床转化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。