空间转录组学的临床与转化价值

空间转录组学（ST）与单细胞RNA测序（scRNA-seq）的结合是将人类组织的病理表型与分子改变联系起来的关键组成部分，可界定原位细胞间分子通讯并获得时空分子医学知识。本文概述了ST的发展，旨在评估其在理解分子发病机制和发现疾病特异性生物标志物方面的临床与转化价值。我们比较了基于测序和基于成像的技术的优缺点，并强调了ST的机遇与挑战。我们还描述了解析基因表达和细胞相互作用空间模式所必需的生物信息学工具，以及ST在人类疾病（包括神经病学、胚胎发育、肿瘤学和炎症）中用于临床实践的潜在应用，将其作为临床与转化医学的重要议题之一。因此，明确的临床目标、设计、采样流程和方案的优化、ST的可重复性，以及分析和解释的简化，是将ST从实验室推向临床的关键。