建立癌细胞与成纤维细胞共培养体系
验证癌细胞是否向成纤维细胞转移线粒体。
将MitoTracker green标记的A431等癌细胞与未标记HPFs共培养24 h,检测MitoTracker高阳性HPFs及TNT样结构。
MIRO2-mediated mitochondrial transfer from cancer cells induces cancer-associated fibroblast differentiation
含体外共培养、线粒体移植、基因敲低/过表达、体内异种移植及患者样本组学分析等多层级证据与功能机制验证
人原代皮肤成纤维细胞(HPFs)与A431等癌细胞共培养 A431、SCC13、MDA-MB-231、PANC1等癌细胞系 NOD scid小鼠耳部异种移植瘤模型 患者皮肤SCC样本及scRNA-seq与空间转录组数据
共培养中MitoTracker高阳性HPFs比例及TNT结构长度10–100 μm 线粒体移植后HPFs中INHBA、IL6、ACTA2、COL1A1等CAF标志物表达 MIRO2敲低或过表达对线粒体转移效率及CAF分化的影响 NOD scid小鼠中A431细胞与成纤维细胞共注射后的肿瘤体积 MitoCeption线粒体供体与受体HPFs数量比1:1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证癌细胞是否向成纤维细胞转移线粒体。
将MitoTracker green标记的A431等癌细胞与未标记HPFs共培养24 h,检测MitoTracker高阳性HPFs及TNT样结构。
确认MitoTracker信号源于线粒体转移而非染料泄漏,并确定转移依赖TNT而非间隙连接。
采用transwell共培养、间隙连接抑制剂carbenoxolone、connexin 26敲低、微管抑制剂nocodazole、肌动蛋白抑制剂dihydrocytochalasin B及SEC3/SEC5敲低处理共培养体系。
验证癌细胞在体内向基质成纤维细胞转移线粒体。
将A431细胞及Su9–RFP标记的A431细胞皮内注射至NOD scid小鼠耳部,对肿瘤切片进行人线粒体抗体与COLI/PDGFRα共染,并从肿瘤中分离培养小鼠成纤维细胞检测人mtDNA。
评估接收癌细胞线粒体的成纤维细胞是否获得CAF表型。
FACS分选MitoTracker-high与-low HPFs,进行RNA-seq和蛋白质组学分析,检测CAF标志物、干扰素反应基因及功能特征。
验证纯化的癌细胞线粒体本身足以诱导致成纤维细胞CAF特征。
使用MitoCeption将A431等癌细胞来源的纯化线粒体移植入HPFs,并用FluidFM直接注射线粒体,检测增殖和CAF标志物表达。
确定线粒体功能及MIRO2对线粒体转移和CAF重编程的必要性。
使用CCCP去极化线粒体、低mtDNA(lmt)A431细胞线粒体、MIRO2敲低或过表达,检测线粒体转移效率、CAF标志物、OCR和肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与线粒体染色 | MitoTracker绿色荧光探针 | Thermo Fisher Scientific | M46750 |
| 线粒体移植 | 线粒体分离试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 89874 |
| 线粒体氧化磷酸化抑制 | 寡霉素 | Sigma-Aldrich | O4876 |
| Seahorse线粒体压力测试 | Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103015-100 |
| Seahorse检测 | Seahorse XF基础培养基 | Agilent Technologies | 103335-100 |
| ATP检测 | CellTiter-Glo检测试剂盒 | Promega | -- |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX红色线粒体超氧化物指示剂 | Thermo Fisher Scientific | M36008 |
| 流式细胞术 | Sytox Blue核酸染料 | Thermo Fisher Scientific | S34857 |
| Foxp3转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | 00-5523-00 | |
| Western blot | 抗MIRO2抗体 | Novus Biologicals | H00089941-B01P |
| 抗MIRO1抗体 | Novus Biologicals | NBP1-59021 | |
| 抗TRAK1抗体 | Invitrogen | PA5-70029 | |
| 抗TRAK2抗体 | Invitrogen | PA5-21858 | |
| 抗EXOC1抗体 | Abcam | ab251853 | |
| 抗EXOC2抗体 | Abcam | ab140620 | |
| 抗vinculin抗体 | Sigma-Aldrich | V4505 | |
| 抗GAPDH抗体 | Hytest | 5G4 | |
| 抗HSP60抗体 | Abcam | Ab59457 | |
| 辣根过氧化物酶标记抗兔IgG | Promega | W4011 | |
| 辣根过氧化物酶标记抗小鼠IgG | Promega | W4021 | |
| DNA提取 | QIAamp DNA迷你试剂盒 | Qiagen | 51306 |
| PCR产物纯化 | QIAquick PCR纯化试剂盒 | Qiagen | 28104 |
| 蛋白质组学样品制备 | SP3磁珠 | GE Healthcare | 45152105050250 |
| SP3磁珠 | GE Healthcare | 65152105050250 | |
| 双辛可宁酸蛋白定量试剂 | Pierce Biotechnology, Thermo Fisher Scientific | PIER23225 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 癌细胞与成纤维细胞共培养 | 癌细胞系、HPF来源与代数、MitoTracker green浓度、共培养时长24 h、共培养比例及n=3重复 阅读提示:Methods“Coculture of fibroblasts with epithelial cells”及Fig. 1图注 |
| 线粒体转移途径验证 | carbenoxolone 100 μM、nocodazole 10 μM、dihydrocytochalasin B 100 nM处理24 h;siRNA序列与转染时长 阅读提示:Methods“Coculture of fibroblasts with epithelial cells”和“siRNA-mediated knockdown” |
| MitoCeption线粒体移植 | 供体细胞数与受体HPFs数量比1:1、1,500g离心15 min 4°C、37°C 5% CO2孵育2 h、重复离心一次、24 h后检测 阅读提示:Methods“MitoCeption”及Fig. 4图注 |
| 体内异种移植瘤实验 | NOD scid小鼠8–12周龄、皮内注射2×10^5癌细胞或10^5癌细胞+10^5成纤维细胞、肿瘤体积检测时间点、n=3–5只小鼠/组 阅读提示:Methods“In vivo tumorigenesis assays”及Fig. 5、Fig. 8图注 |
| MIRO2功能验证 | MIRO2 siRNA序列及24 h转染、MIRO2过表达质粒pRK5-myc-MIRO2(Addgene 47891)、检测线粒体转移的MitoTracker高阳性HPFs比例 阅读提示:Methods“siRNA-mediated knockdown”和“MIRO2 overexpression”及Fig. 7图注 |
| 代谢功能检测 | Seahorse XF96每孔100,000细胞、oligomycin/FCCP/antimycin A+rotenone终浓度分别为1、1.5、1/0.1 μmol/L、OCR归一化至细胞数 阅读提示:Methods“Seahorse XF cell mito stress test”及Fig. 5图注 |