临床队列分层与预后分析
评估CCNE1表达与HRD状态组合对HGSOC患者生存和治疗反应的影响
对发现队列(n=140)和验证队列(n=267)的HGSOC患者按Cyclin E1表达和HRD状态分层,进行Kaplan-Meier生存分析和Cox回归,并分析PARPi和铂类耐药分布
CCNE1 overexpression drives a cGAS-STING-dependent interferon response and sensitizes HRD-positive ovarian cancer to immune checkpoint blockade
含患者队列、scRNA-seq、mIF、ID8同基因小鼠模型、PDTF离体平台及机制验证(C-176/NAC Rescue)。
HGSOC患者队列(发现队列n=140,验证队列n=267) Brca1−/−Ccne1OE ID8同基因小鼠卵巢癌模型 患者来源肿瘤片段(PDTF)离体培养
CCNE1高/HRD亚组中CD8+ T细胞表达Granzyme B、IFN-γ、TNF-α的比例 PDTF中anti-PD-1(10 μg/mL,48小时)处理后的CD8+ T细胞效应分子变化 ID8同基因模型中anti-PD-1治疗后的腹膜肿瘤负荷(IVIS生物发光) C-176(10 μM)或NAC(1 mM)对p-TBK1、p-STAT1及ISGs的逆转效果 MSA-2(5 μg/mL)对PDTF中CD8+ T细胞和TAM极化的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CCNE1表达与HRD状态组合对HGSOC患者生存和治疗反应的影响
对发现队列(n=140)和验证队列(n=267)的HGSOC患者按Cyclin E1表达和HRD状态分层,进行Kaplan-Meier生存分析和Cox回归,并分析PARPi和铂类耐药分布
描述CCNE1高/HRD亚型的免疫细胞组成和空间分布
使用scRNA-seq数据集(GSE222556)分析上皮、髓系和T/NK细胞亚群;对新鲜HGSOC组织进行流式细胞术和多重免疫荧光(mIF)检测CD8+ T细胞效应分子和CXCL9+ TAM
验证CCNE1过表达在HRD背景中是否通过ROS和胞质DNA激活cGAS–STING–IFN轴
构建Brca1−/−Ccne1OE ID8细胞,检测γH2AX、cGAS阳性微核、总ROS和线粒体超氧化物;用C-176(STING抑制剂)和NAC(ROS清除剂)处理,检测p-STING、p-TBK1、p-STAT1及ISGs表达
验证CCNE1过表达肿瘤细胞对CD8+ T细胞和巨噬细胞活化的影响及STING依赖性
将Brca1−/−Ccne1OE或对照ID8细胞与CD8+ T细胞或巨噬细胞共培养,流式检测CD8+ T细胞增殖(Ki-67)和IFN-γ表达,以及巨噬细胞CXCL9和MHC-II表达;同时检测肿瘤细胞PD-L1和B7-H4
在患者来源肿瘤片段中验证CCNE1高/HRD亚型对PD-1阻断的敏感性
将33例HGSOC新鲜肿瘤组织制成1–2 mm³ PDTF,分别用anti-PD-1(10 μg/mL)或同型对照处理48小时,流式检测CD8+ T细胞Granzyme B、IFN-γ、TNF-α及双阳性比例;另用MSA-2(5 μg/mL)处理6例PDTF
在免疫 competent 小鼠中验证CCNE1过表达联合anti-PD-1的体内抗肿瘤效果及免疫重塑
使用Brca1−/−Trp53−/−Ccne1WT或Ccne1OE ID8细胞建立腹腔播散卵巢癌模型,随机给予anti-PD-1或同型对照,IVIS监测肿瘤负荷,流式分析TIL中CD8+ T细胞亚群和TCR克隆
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PDTF培养与anti-PD-1处理 | PDTF大小1–2 mm³、anti-PD-1浓度10 μg/mL、处理时间48小时、基质胶体积和培养温度 阅读提示:Methods 'PDTF cultures'小节 |
| STING抑制剂和ROS清除剂处理 | C-176浓度10 μM、NAC浓度1 mM、处理时间 阅读提示:Figure 4图注及Methods |
| ID8同基因小鼠模型 | 细胞接种量、anti-PD-1给药剂量和 schedule、n=6/组、IVIS监测时间点 阅读提示:Methods 'Animal models and in vivo experiments'及Figure 6图注 |
| 患者队列分层 | Cyclin E1 IHC阈值(>60%阳性且≥5%强染色)、HRD检测方法(fHR) 阅读提示:Methods 'Immunohistochemistry and evaluation'和'Functional homologous recombination status assessment' |