研究队列建立与临床数据收集
构建接受T-DXd治疗的晚期乳腺癌患者队列,收集临床特征和安全性数据以评估ILD发生情况。
从26家西班牙机构纳入2022年7月至2024年3月期间接受T-DXd治疗的晚期HER2阳性或HER2低表达乳腺癌患者,收集电子病历中的 demographic 和临床变量,按CTCAE v5.0记录毒性。
Germline pharmacogenetic variants associated with trastuzumab deruxtecan-induced interstitial lung disease in advanced breast cancer: PROCURE project
多中心转化研究,290例患者胚系DNA基因分型(药物基因组学芯片)及逻辑回归关联分析,未进行功能验证。
晚期HER2阳性或HER2低表达乳腺癌患者 患者外周血胚系DNA
患者纳入标准:接受至少一剂T-DXd且随访至少3周 基因分型质量控制:剔除call rate <95%、偏离HWE(P < 1×10-4)、MAF <0.025的变异 逻辑回归模型:单变量加性模型及多变量模型调整年龄、T-DXd初始剂量、既往治疗线数、种族 ILD诊断与分级:依据CTCAE v5.0,由当地研究者判定,影像学评估按常规实践
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建接受T-DXd治疗的晚期乳腺癌患者队列,收集临床特征和安全性数据以评估ILD发生情况。
从26家西班牙机构纳入2022年7月至2024年3月期间接受T-DXd治疗的晚期HER2阳性或HER2低表达乳腺癌患者,收集电子病历中的 demographic 和临床变量,按CTCAE v5.0记录毒性。
基于T-DXd的药代动力学、药效学和药物超敏反应通路选择候选基因。
选择14个候选基因:CYP3A4、CYP3A5、SLCO1B1(PK);ERBB2、FCGR3A、FCGR2A、CTSB、CTSL(PD);HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-E、HLA-F、HLA-G(药物超敏反应)。
获取候选基因区域的遗传变异数据并进行质量控制。
从外周血提取基因组DNA,使用Infinium Global Diversity Array进行基因分型,用PLINK v1.9进行质控和变异过滤。
评估候选基因变异与T-DXd诱导的ILD/肺炎之间的关联。
使用单变量逻辑回归(加性遗传模型)和多变量逻辑回归(调整年龄、T-DXd初始剂量、既往治疗线数、种族)估计OR和95% CI。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| DNA提取 | Maxwell® RSC全血DNA提取试剂盒 | Promega | -- |
| 基因分型 | Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx芯片 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 研究队列建立 | 纳入/排除标准、随访时间、T-DXd初始剂量分布、既往治疗线数 阅读提示:Methods中Study population小节及Figure 1流程图 |
| 基因分型与质控 | DNA提取试剂盒、基因分型芯片型号、变异过滤阈值(call rate、HWE、MAF) 阅读提示:Methods中DNA genotyping and quality control of selected gene regions小节 |
| 关联分析 | 统计模型类型、协变量列表、分析软件及版本 阅读提示:Methods中Statistical analysis小节 |
| ILD判定 | CTCAE版本、影像学监测频率、诊断与分级流程 阅读提示:Methods中Study population小节 |