靶点表达与异质性分析
评估HLA-G和CD70作为ccRCC双特异性CAR-T靶点的可行性和安全性
利用TCGA和HPA RNA-seq数据库分析候选抗原表达,并对171例ccRCC患者样本和61例癌旁正常组织进行免疫组织化学染色;利用单细胞RNA测序和IHC分析肿瘤内异质性。
Affinity-optimized bispecific CAR-T cells targeting HLA-G and CD70 for the treatment of clear cell renal cell carcinoma
含公共数据库分析、171例患者样本IHC、多种细胞系体外功能验证及NOG小鼠异种移植模型体内验证
786-O、Caki-1等肾癌细胞系及HEK293T、Jurkat细胞系 171例ccRCC患者肿瘤样本和61例癌旁正常组织 NOG小鼠皮下异质性肿瘤模型(HLA-G+与CD70+ 786-O细胞1:1混合)
CAR-T细胞输注剂量:4×10⁶ CAR+或NT T细胞,尾静脉单次注射 异质性肿瘤模型:HLA-G+与CD70+ 786-O细胞1:1混合,每只小鼠皮下注射5×10⁶细胞 体外杀伤实验效靶比:0.25:1、0.5:1、1:1、2:1,共培养12小时 小鼠分组:每组n=6,于第14天随机分组 连接肽筛选:比较(G4S)2、218、(G4S)4、(EASAAK)2、LHL等连接肽对双特异性CAR功能的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HLA-G和CD70作为ccRCC双特异性CAR-T靶点的可行性和安全性
利用TCGA和HPA RNA-seq数据库分析候选抗原表达,并对171例ccRCC患者样本和61例癌旁正常组织进行免疫组织化学染色;利用单细胞RNA测序和IHC分析肿瘤内异质性。
比较ILT2、ILT4和KIR2DL4来源的HLA-G CAR的抗肿瘤功能
构建含CD8α铰链/跨膜区、CD28共刺激域和CD3ζ信号域的第二代CAR,通过P2A连接mThy1.1报告基因;在HLA-G过表达786-O和Caki-1细胞中检测细胞毒性、增殖、脱颗粒和细胞因子分泌。
提高ILT4与HLA-G的结合亲和力以增强CAR-T抗肿瘤功能
基于ILT4/HLA-G复合物晶体结构(PDB ID: 2DYP)对结合界面关键残基进行两轮饱和突变,构建23个突变体CAR,筛选增强细胞毒性的突变体;纯化ILT4-Fc和Mut-5-Fc蛋白,通过流式细胞术测定结合亲和力;进行重复抗原刺激实验。
构建CD70特异性CAR并防止CD70表达介导的T细胞自相残杀
使用抗CD70纳米抗体VHH序列构建CAR,并在载体中引入U6启动子驱动的CD70 shRNA;检测T细胞扩增、凋亡及对CD70敲除靶细胞的细胞毒性。
筛选最优连接肽以保持双特异性CAR对两种抗原的功能
构建含不同连接肽的双特异性CAR,在DN、HLA-G+、CD70+及双阳性786-O细胞中检测细胞毒性;在HLA-G+与CD70+细胞1:1混合的异质性模型中评估杀伤和重复刺激后的增殖。
评估双特异性CAR-T细胞对异质性肿瘤的体内疗效和安全性
在NOG小鼠皮下接种HLA-G+与CD70+ 786-O细胞1:1混合物,14天后尾静脉单次注射CAR-T或NT T细胞,监测肿瘤体积和体重,终点分析瘤内浸润T细胞、外周血CAR-T持续性和耗竭标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen | -- | |
| T细胞激活 | CD3/CD28磁珠 | GenScript | L00899-1 |
| T细胞转导 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | H9268 |
| 免疫组织化学 | 抗HLA-G单克隆抗体 | Abcam | ab52455 |
| 抗CD70单克隆抗体 | CST | 69209 | |
| 通用二抗 | ZSGB-Bio | PV-6000-18 | |
| DAB底物试剂盒 | ZSGB-Bio | ZLI-9017 | |
| 流式细胞术 | 细胞固定/透化试剂盒 | BD Biosciences | 554714 |
| 抗CD45-APC/Cy7抗体 | BioLegend | 368516 | |
| 抗CD45-APC抗体 | BioLegend | 304012 | |
| 抗CD3-APC/Cy7抗体 | BioLegend | 300318 | |
| 抗CD4-BV605抗体 | BioLegend | 300556 | |
| 抗CD8-PE/Cy7抗体 | BioLegend | 344750 | |
| 抗CD8-Percp/cy5.5抗体 | BioLegend | 344710 | |
| 抗CD25-FITC抗体 | BioLegend | 302604 | |
| 抗CD69-APC抗体 | BioLegend | 310910 | |
| 抗IFN-γ-PE抗体 | BioLegend | 502508 | |
| 抗颗粒酶B-FITC抗体 | BioLegend | 372206 | |
| 抗CCR7-PE/Cy7抗体 | BioLegend | 353226 | |
| 抗CD45RA-PE抗体 | BioLegend | 304108 | |
| 抗CD107a-PE抗体 | BioLegend | 328608 | |
| 抗PD-1-PE抗体 | BioLegend | 379210 | |
| 抗TIM-3-FITC抗体 | BioLegend | 345022 | |
| 抗小鼠Thy1.1-Pacific Blue抗体 | BioLegend | 202522 | |
| 抗小鼠Thy1.1-FITC抗体 | BioLegend | 109008 | |
| Annexin V APC | BioLegend | 640920 | |
| 抗CD70-PE/Cy7抗体 | BioLegend | 355112 | |
| 抗HLA-G-APC抗体 | BioLegend | 335910 | |
| 抗人IgG Fc-APC抗体 | BioLegend | 410712 | |
| 抗HLA-A, B, C-PE/Cy7抗体 | BioLegend | 311430 | |
| 荧光素酶细胞杀伤实验 | 荧光素酶检测系统 | Promega | E4030 |
| T细胞脱颗粒实验 | 莫能菌素 | BioLegend | 420701 |
| 细胞因子表达检测 | 布雷菲德菌素A | MCE | HY-16592-100mg |
| 细胞增殖检测 | CellTrace Violet细胞增殖试剂盒 | Thermo Fisher | C34571 |
| 肿瘤组织消化 | IV型胶原酶 | Invitrogen | 17104019 |
| DNase I | Roche | 11284932001 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAR-T细胞制备 | PBMC来源、CD3/CD28磁珠激活时间24小时、IL-2浓度100 IU/mL、感染复数10、polybrene浓度8 µg/mL 阅读提示:Methods中Lentiviral preparation, transduction, and expansion of human T cells小节 |
| 体外细胞毒性实验 | 靶细胞类型及抗原表达、效靶比(0.25:1至2:1)、共培养时间12小时、荧光素酶检测系统 阅读提示:Methods中Luciferase-based cytolysis assay小节及图2、图6图注 |
| 体内异质性肿瘤模型 | 小鼠品系NOG、周龄5–8周、肿瘤细胞混合比例1:1、接种细胞总数5×10⁶、CAR-T输注剂量4×10⁶、分组n=6、观察终点第30天 阅读提示:Methods中Mouse xenograft models小节及图7图注 |
| 连接肽筛选 | 连接肽序列(见补充表S1)、各连接肽对HLA-G和CD70功能的影响、效靶比及共培养时间 阅读提示:Methods中Generation of CAR constructs小节及图6图注、补充表S1 |
| ILT4亲和力成熟 | 突变位点、突变能量阈值(ΔΔG_mut <-2.5 kcal/mol)、突变体数量23、亲和力检测方法(流式细胞术、系列稀释蛋白) 阅读提示:Methods中Generation and binding assay of recombinant ILT4-Fc protein小节及图3、图4图注 |