数据集构建与预处理
建立可用于以FMP为锚点分析的大规模实验室检测数据集。
纳入NHANES 1999–2022非妊娠个体及Clalit 2004–2024年30–70岁非妊娠个体;对实验室值进行对数转换并按25–45岁参考人群标准化,剔除±5 s.d.离群值;Clalit中排除受药物或疾病影响的检测数据。
Population-scale reconstruction of menopause dynamics reveals a physiological cliff at the final menstrual period
基于两个横断面队列的计算建模分析,含模拟验证及与SWAN纵向数据比对,但无前瞻性功能或机制实验。
NHANES横断面队列(1999–2022,女性与男性) Clalit电子病历队列(约130万30–70岁女性,2004–2024) SWAN纵向队列(用于性激素轨迹验证)
NHANES与Clalit中90项实验室检测的跳跃幅度相关性(r=0.89, P=10−16) 女性与男性在t=0处跳跃的z检验比较(FDR校正,52/90项显著) YoGlen估计与已知绝经状态45–53岁女性直接估计的一致性(r=0.97) YoGlen重建的E2与FSH轨迹与SWAN纵向数据的比较(r=0.98与0.99) MHT使用者与倾向评分匹配对照的跳跃衰减比较(Mann–Whitney U检验,FDR校正)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立可用于以FMP为锚点分析的大规模实验室检测数据集。
纳入NHANES 1999–2022非妊娠个体及Clalit 2004–2024年30–70岁非妊娠个体;对实验室值进行对数转换并按25–45岁参考人群标准化,剔除±5 s.d.离群值;Clalit中排除受药物或疾病影响的检测数据。
验证能否从横断面年龄轨迹中去除FMP年龄变异造成的模糊,重建以时间为FMP函数的轨迹。
基于潜变量模型构建YoGlen方法1(NHANES,利用月经状态与年龄)和方法2(Clalit,分段线性回归),并用模拟数据及不同FMP分布扰动评估稳健性。
检验女性在FMP处是否存在跨系统的阶梯式变化,并与男性比较。
对90项实验室检测应用YoGlen,估计FMP处跳跃大小,按系统分组;男性以相同FMP分布进行同样去卷积作为对照;比较NHANES与Clalit跳跃幅度。
确定AMH、FSH和E2在FMP前何时开始加速变化。
对NHANES中自报非绝经女性的AMH、FSH和E2横断面均值进行分析,并用Clalit去卷积轨迹进行变点分析定位斜率变化点。
检验MHT是否减弱FMP处的生理跳跃。
在NHANES中比较当前MHT使用者与倾向评分匹配对照的检测轨迹;在Clalit中比较至少两次处方Angeliq或Eviana的女性用药前、中、后轨迹与匹配对照。
检验FMP处实验室检测跳跃是否伴随临床结局患病率斜率变化。
对NHANES中31项健康缺陷(诊断、症状)应用去卷积方法,分析其随时间的患病率变化,并与男性比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 数据集与纳入排除 | NHANES波次范围1999–2022;Clalit年龄30–70岁、年份2004–2024;妊娠排除;Clalit药物/疾病相关检测排除依据Cohen et al.的131种慢性病和5,223对药物-检测 阅读提示:Methods的Data and cohorts与Eligibility criteria小节;Extended Data Table 1和2 |
| 实验室值预处理 | log转换与25–45岁参考标准化;离群值±5 s.d. cutoff;零值处理(Clalit剔除,<0.3%) 阅读提示:Methods的Preprocessing小节;Extended Data Table 1和2脚注 |
| 绝经状态与FMP年龄判定 | NHANES自报月经状态问题RHQ030/RHQ031/RHQ040等;子宫切除者重新分类规则;60岁以上无月经者按年龄分类;自报绝经年龄top-coded at 60并用生存模型外推;Clalit无月经数据 阅读提示:Methods的Variable definitions—Menopause status小节 |
| YoGlen方法参数 | 方法1:FMP分布来自NHANES,20–70岁1年分辨率网格,每人15次抽样;方法2:分段线性模型,FMP分布来自306,068名健康女性;变点分析p=1;交叉验证十折十重复 阅读提示:Methods的The YoGlen algorithm、YoGlen method 1和method 2小节;Fig. 4图注 |
| MHT效应分析 | NHANES MHT定义(自报RHQ558/RHQ566/RHQ574或含雌激素药物);倾向评分匹配协变量与平衡阈值(KS 0.1);Clalit MHT药物Angeliq或Eviana至少两次处方;Clalit绝经变化窗口42–48岁与54–60岁;MHT衰减公式1−(ΔMHT/Δcontrol) 阅读提示:Methods的MHT小节与Propensity score matching小节;Fig. 3图注;Supplementary Table 1和3 |
| 统计与显著性判定 | 双侧检验,P<0.05;FDR校正Benjamini–Hochberg;相关系数为Pearson;误差棒为标准误 阅读提示:Methods的Statistics小节 |