cerebroids的建立与验证
确认三维离体人胎儿脑培养体系是否保留皮层结构、细胞多样性和ECM等关键特征。
取妊娠11–14周人胎儿DLPFC切成约10 mm²组织块,游离悬浮于轨道摇床培养;通过免疫荧光、SEM、TEM、EdU脉冲追踪及WGA/ECM染色验证分层结构、NSC极性、增殖分化能力、小胶质细胞、血管结构和ECM成分。
Modeling maternal immune activation in 3D ex vivo human fetal brain cerebroids reveals IL-17A-driven disruption of cortical development
含原代人胎儿脑三维离体培养、iPSC类器官与NPC、转录组/蛋白组多组学及PTL功能回补验证
人胎儿背外侧前额叶皮层来源的三维离体cerebroids 人iPSC来源皮层类器官 人iPSC来源神经祖细胞(NPC)及前脑神经元 人iPSC来源小胶质样细胞
IL-17A处理剂量100 ng/ml、每48 h一次、持续1周,溶剂对照为vehicle PTL处理剂量25 µM(cerebroids)或10 µM(2D NPC),0.2% DMSO作溶剂对照 cerebroids来源于妊娠11–14周人胎儿DLPFC,每孔16–24个,120 rpm轨道摇床培养 EdU脉冲10 µM、2 h脉冲后48 h追踪 主要统计设计:双因素ANOVA及Tukey多重比较,供体水平以mean±s.e.m.表示
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认三维离体人胎儿脑培养体系是否保留皮层结构、细胞多样性和ECM等关键特征。
取妊娠11–14周人胎儿DLPFC切成约10 mm²组织块,游离悬浮于轨道摇床培养;通过免疫荧光、SEM、TEM、EdU脉冲追踪及WGA/ECM染色验证分层结构、NSC极性、增殖分化能力、小胶质细胞、血管结构和ECM成分。
检验IL-17A是否足以在cerebroids中引起皮层折叠、厚度和神经元生成的改变。
对cerebroids给予IL-17A或vehicle处理,通过形态学成像、SEM、DAPI切片、GI计算、分层厚度测量及SOX2/TBR2/CTIP2/SATB2/NeuN免疫荧光定量评估皮层结构。
判断IL-17A处理是否激活cerebroids中的神经炎症反应。
从cerebroids中分离小胶质细胞/BAM进行RNA-seq,分析差异基因及KEGG通路。
确定IL-17A增加神经元数量是否源于新生神经发生增强。
在vehicle和IL-17A处理的cerebroids中进行EdU脉冲–追踪,定量EdU+CTIP2+神经元、EdU+TBR2+ IPC、EdU+SOX2+ NSC及EdU+Ki67+细胞;并在iPSC来源类器官和NPC中验证神经发生。
揭示IL-17A引起异常皮层发育的分子通路。
对全cerebroid及分选的microglia/BAM、NLCC和NSC进行bulk RNA-seq,并对CHAPS、sECM和iECM三个蛋白组分进行质谱蛋白组学分析。
验证NSC是否直接响应IL-17A并激活NF-κB通路。
检测NSC中IL17RA/IL17RC表达及IL-17A处理后的变化,分析IL-17通路基因和ACT1、TRAF6表达,并在iPSC来源NPC中检测p65磷酸化与核转位及PTL的作用。
确认NF-κB通路在IL-17A诱导的异常皮层发育中的作用。
在cerebroids中单独或联合给予IL-17A与PTL,评估GI、分层厚度、CTIP2/SATB2/NeuN神经元数量及BCAN表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脑组织解剖 | Hanks平衡盐溶液 | Gibco | 14175095 |
| cerebroid培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco | 11330-032 |
| Neurobasal培养基 | Gibco | 21103-049 | |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | 35050-038 | |
| MEM非必需氨基酸溶液 | Gibco | 11140-050 | |
| 无血清B27添加剂 | Gibco | 17504-044 | |
| N-2添加剂 | Gibco | 17502-048 | |
| 人重组胰岛素 | Gibco | 12585-014 | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | 15240-096 | |
| 耐CO2轨道摇床 | Fisher Scientific | 15351105 | |
| iPSC培养 | mTeSR Plus基础培养基 | StemCell | 100-0274 |
| mTeSR Plus 5X添加剂 | StemCell | 100-0275 | |
| 青霉素–链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| NPC培养 | STEMdiff神经祖细胞培养基 | StemCell | 05833 |
| 层粘连蛋白/多聚-L-鸟氨酸 | Sigma-Aldrich | LPLO001 | |
| 神经元分化 | STEMdiff前脑神经元分化培养基 | StemCell | 08600 |
| 神经元成熟 | STEMdiff前脑神经元成熟培养基 | StemCell | 08605 |
| 类器官培养 | 超低吸附96孔板 | Corning | 7007 |
| 超低吸附六孔板 | Corning | 3471 | |
| KnockOut血清替代物 | Gibco | 10828-028 | |
| 肝素 | StemCell | 7980 | |
| SB431542 | StemCell | 72234 | |
| LDN-193189 | StemCell | 72147 | |
| CHIR99021 | StemCell Technologies | 72054 | |
| IL-17A处理 | 人重组IL-17A | PeproTech | 200-17 |
| TNF处理 | 肿瘤坏死因子 | PeproTech | 300-01A-50UG |
| PTL处理 | (-)-小白菊内酯 | Selleckchem | S2341 |
| 免疫荧光染色 | 抗原修复液 | Dako Agilent | S169984-2 |
| Coplin染色缸 | Epredia | 194 | |
| 免疫染色湿盒 | Agar Scientific | AGL4555 | |
| WGA染色 | Alexa Fluor 555标记小麦胚芽凝集素 | Invitrogen | 11590816 |
| EdU脉冲–追踪 | EdU | Invitrogen | A10044 |
| EdU检测 | Click-iT EdU细胞增殖成像试剂盒及Alexa Fluor 647染料 | Invitrogen | C10340 |
| 腺病毒标记 | 表达增强型绿色荧光蛋白的重组人5型腺病毒 | Vector Biolabs | 1060 |
| 表达红色荧光蛋白的重组人5型腺病毒 | Vector Biolabs | 1660 | |
| 钙成像 | Fluo-4 AM钙指示剂 | Fisher Scientific | 11504786 |
| Pluronic酸 | Fisher Scientific | P3000MP | |
| EVOS M5000成像系统 | Thermo Fisher | AMF5000SV | |
| EVOS载物台培养箱 | Thermo Fisher | AMC2000 | |
| 冷冻切片 | 冷冻切片机 | Leica Biosystems | CM1850 |
| 电子显微镜 | 甲醛 | Fisher Scientific | 28909 |
| 胎盘组织基线炎症检测 | GoScript逆转录酶试剂盒 | Promega | 2790 |
| 免疫磁珠分选 | EasySep人CD11b阳性选择与去除试剂盒 | StemCell | 100-0742 |
| The Big Easy EasySep磁力架 | StemCell | 18001 | |
| 生物素化抗THY-1(CD90)抗体 | StemCell | 60045BT | |
| 抗CD24抗体 | Miltenyi Biotec | 130-098-902 | |
| EasySep Release人生物素阳性选择试剂盒 | StemCell | 17653 | |
| RNA提取 | RNeasy小量提取试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| 无RNase DNA酶I | Qiagen | 79254 | |
| RNA-seq建库 | Illumina链特异性mRNA建库连接试剂盒 | Illumina | 20040532 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| cerebroids建立与培养 | 组织来源孕周(11–14周DLPFC)、组织块大小(约10 mm²)、每孔数量(16–24个)、摇床转速(120 rpm)及换液频率(隔日) 阅读提示:Methods“Brain dissection and tissue culture”及Extended Data Fig. 1a;供体信息见Supplementary Table 1 |
| IL-17A处理 | IL-17A剂量100 ng/ml、每48 h给药、持续1周、每次更换2/3培养基 阅读提示:Methods“IL-17A treatment”及Fig. 2a、Fig. 3k图注 |
| PTL回补实验 | PTL剂量25 µM(cerebroids)或10 µM(2D NPC)、隔日给药、0.2% DMSO溶剂对照 阅读提示:Methods“PTL treatment”及Fig. 6a图注 |
| EdU脉冲–追踪 | EdU浓度10 µM、脉冲2 h、追踪48 h、检测试剂盒 阅读提示:Methods“EdU pulse–chase experiments”及Fig. 1g、Fig. 3a图注 |
| 皮层折叠与厚度定量 | GI计算公式、分层定义(layer 1–3)、每组cerebroids数与供体数、随机分组与盲法分析 阅读提示:Methods“Measurement of cortical folding”“Measurement of layer thickness”“Statistical analysis”,各图注中n值 |
| 多组学分析 | RNA-seq供体编号(全组织9、11、12;分选细胞5、6、7)、差异阈值log2FC≥0.4与FDR<0.05、蛋白组学三组分提取 阅读提示:Methods“RNA extraction and RNA-seq”“Protein fractionation and proteomic analysis”及Fig. 4图注 |
| NF-κB信号验证 | NPC中IL-17A 12.5 ng/ml处理时长(30 min、24 h、48 h)、TNF 25 ng/ml阳性对照、p65磷酸化与核转位定量方式 阅读提示:Methods“IL-17A treatment”“TNF treatment”及Fig. 5m–p图注 |
| 性别差异分析 | 性别差异:文中未明确说明(Discussion说明受组织来源限制未探索) 阅读提示:Discussion中关于sex differences的段落 |