人脂肪组织脂质组学分析
表征肥胖与瘦个体白色脂肪组织中TAG和甘油磷脂的脂质种类及饱和度差异。
收集人内脏和皮下脂肪组织,进行基于多维质谱的鸟枪法脂质组学分析,按脂肪酸饱和度、碳数和双键数分层比较TAG种类及浓度,并分析甘油磷脂酰基链组成。
Substrate-Selective Lipolysis Facilitates Unsaturated TAG Accumulation in Obesity
包含人脂肪组织脂质组学、3T3-L1和人前脂肪细胞功能实验、重组ATGL体外酶活实验,多层级证据并含机制验证。
人内脏和皮下白色脂肪组织样本 3T3-L1小鼠脂肪细胞 人皮下前脂肪细胞分化的脂肪细胞 重组人ATGL体外酶反应体系
人脂肪组织样本来源、肥胖与瘦分组及年龄性别混杂因素回归分析 3T3-L1脂肪细胞中棕榈酸或亚油酸预处理48小时,Atglistatin或WWL229预处理2小时,ISO刺激8小时 人脂肪细胞中棕榈酸或亚油酸预处理24小时,WWL229或NG-497预处理2小时,ISO 30 µmol/L刺激 重组ATGL与三棕榈酸甘油酯和三油酸甘油酯按99:1、50:50、1:99摩尔比混合,37°C孵育10、20、30、120分钟 甘油释放和游离脂肪酸释放的检测终点及独立重复次数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
表征肥胖与瘦个体白色脂肪组织中TAG和甘油磷脂的脂质种类及饱和度差异。
收集人内脏和皮下脂肪组织,进行基于多维质谱的鸟枪法脂质组学分析,按脂肪酸饱和度、碳数和双键数分层比较TAG种类及浓度,并分析甘油磷脂酰基链组成。
评估年龄和性别是否影响脂质组学数据的聚类与变异。
对PCA前两个主成分以肥胖类别、BMI、年龄和性别为预测变量进行普通最小二乘回归,并按年龄和性别着色PCA图。
验证饱和与不饱和脂肪酸预处理对脂肪细胞脂解响应的影响,并区分ATGL和CES3的贡献。
分化3T3-L1细胞分别用棕榈酸或亚油酸预处理诱导脂质积累,去除脂肪酸后分别用Atglistatin抑制ATGL或用WWL229抑制CES3,再用ISO刺激脂解,检测甘油释放。
在人脂肪细胞中验证脂肪酸饱和度依赖的脂解差异及ATGL表达变化。
人皮下前脂肪细胞经分化后,用棕榈酸或亚油酸预处理,分别用WWL229抑制CES3或用NG-497抑制ATGL,再用ISO刺激,检测甘油和游离脂肪酸释放;同时用Western blot和免疫荧光检测PPARγ、ATGL和SCD1。
直接验证ATGL对饱和与不饱和TAG混合底物的水解偏好。
重组人ATGL与三棕榈酸甘油酯和三油酸甘油酯按不同摩尔比混合,在37°C孵育不同时间,检测游离脂肪酸释放。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脂质组学蛋白定量 | Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| 脂肪酸准备 | 亚油酸钠 | Sigma-Aldrich | L8134 |
| 脂解实验甘油定量 | EnzyChrom甘油测定试剂盒 | BioAssay Systems | Y-200 |
| 脂解实验游离脂肪酸定量 | 游离脂肪酸定量试剂盒 | Abcam | ab65341 |
| 不饱和脂质种类测定 | 硫代磷酸香草醛测定试剂盒 | Abcam | ab242305 |
| 阻断脂肪生成 | DGAT1抑制剂 | Sigma-Aldrich | SML0539 |
| DGAT2抑制剂PF-06424439 | MedChemExpress | PF-06424439 | |
| Western blot | ATGL抗体 | Cell Signaling Technology | 2138S |
| SCD1抗体 | Cell Signaling Technology | 2794S | |
| PPARγ抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA3821A | |
| 肌动蛋白抗体 | Thermo Fisher Scientific | PIMA515739 | |
| 免疫荧光染色 | BODIPY 558/568 C12 | -- | -- |
| 体外ATGL底物偏好性测定 | 重组ATGL | Abcam | ab226233 |
| 三棕榈酸甘油酯 | Sigma-Aldrich | T5888 | |
| 三油酸甘油酯 | Sigma-Aldrich | T7140 | |
| 细胞培养 | 分化培养基-2 | ZenBio | -- |
| 维持培养基-1 | ZenBio | -- | |
| 细胞成像 | EVOS X1成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫荧光成像 | Olympus Fluoview 3000共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| 脂质组学质谱分析 | TSQ Altis三重四极杆质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Q-Exactive Orbitrap质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 脂质组学样品导入 | TriVersa NanoMate纳喷雾离子源 | Advion | -- |
| 组织匀浆 | Precellys Evolution/Cryolys匀浆器 | Bertin | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人脂肪组织脂质组学 | 样本来源和分组:主要来自中年队列的瘦和肥胖成人内脏及皮下脂肪组织;纳入排除标准、BMI分组、样本量见Supplementary Table 1;脂质组学原始数据来自已发表数据集(文献15)。 阅读提示:回看Research Design and Methods的Adipose Tissue Collection和Lipidomics小节,以及Supplementary Table 1和Supplementary Fig. 1。 |
| 3T3-L1脂肪细胞脂解实验 | 棕榈酸或亚油酸预处理48小时;Atglistatin 50 µmol/L或WWL229 100 µmol/L预处理2小时;ISO 20或30 µmol/L刺激8小时;甘油释放为终点;四次独立实验。 阅读提示:回看Research Design and Methods的Adipocyte FA Uptake and Lipolysis Assay小节和Fig. 4B、4C图注。 |
| 人脂肪细胞脂解实验 | 棕榈酸或亚油酸预处理24小时;WWL229或NG-497预处理2小时;ISO 30 µmol/L刺激;DGAT1/2抑制剂条件下进行;n=8独立实验。 阅读提示:回看Research Design and Methods的Adipocyte FA Uptake and Lipolysis Assay小节和Fig. 5F–I图注。 |
| 重组ATGL体外酶活实验 | 重组人ATGL与三棕榈酸甘油酯和三油酸甘油酯按99:1、50:50、1:99摩尔比混合;蛋白:底物摩尔比1:10,000;37°C孵育10、20、30、120分钟;每个数据点为三次测量均值。 阅读提示:回看Research Design and Methods的In Vitro ATGL Substrate Preference Assay小节和Fig. 6图注。 |
| 人前脂肪细胞来源和分化 | 皮下前脂肪细胞来自48–59岁女性供者,按BMI分为瘦(<25)、肥胖(>30)和中间(25–29.99);脂解研究n=3;使用Differentiation Medium-2分化7天后换Maintenance Medium-1。 阅读提示:回看Research Design and Methods的Human Preadipocyte Source, Quality Control, and Differentiation小节。 |