采用CML国际标准后实验室间精密度提高:BCR::ABL1能力验证15年历史

Improved inter-lab precision after CML international scale adoption: a 15-year history of BCR::ABL1 proficiency testing

作者信息Annette S Kim, Thomas Long, Derek A Oldridge, Lawrence J Jennings, Yi Ding, Patricia Vasalos, Christopher Watt, Richard D Press
PMID42509252
期刊Leukemia
发布时间2026-10
DOI10.1038/s41375-026-03062-6

实验完整度

中

基于15年CAP能力验证数据(>5500结果),评估实验室间精密度,属观察性分析,无功能或机制验证。

主要模型

临床实验室能力验证数据 CML细胞系RNA稀释样本

重点核对

能力验证样本:CML细胞系RNA稀释于BCR::ABL1阴性RNA 样本转录本水平:高(10倍稀释)、中(1:100、1:1000、1:5000)、低(1:10,000、1:50,000、1:100,000) 报告单位:log(ratio)和/或log(IS) 时间窗口:早期2009-2015A、中期2015B-2019A、晚期2019B-2023B 统计方法:Pearson相关、ANOVA、Levene方差齐性检验

摘要

精准的BCR::ABL1 RNA实验室间定量对于有效的慢性髓性白血病(CML)疾病管理至关重要。尽管国际标准(IS)标准化报告专门为提高BCR::ABL1定量的实验室间可重复性而开发,但该报告系统的临床影响尚未得到全面评估。我们分析了美国病理学家学会能力验证项目中200多家临床实验室15年(2009-2023年)报告的BCR::ABL1结果(每年6个样本;>5500个结果)。通过高、中、低转录本样本的标准差(SD)评估实验室间精密度。在7年内(2009年8%的实验室;2015年86%)早期快速采用IS与报告的BCR::ABL1结果的实验室间SD逐渐降低相关(高样本r = -0.73,p = 0.004;中样本r = -0.71,p = 0.022;低样本r = -0.84,p = 0.002)。到2019年,IS实施率超过99%,实验室间SD达到最低点(~0.2)。没有其他评估变量与实验室间可重复性的时间依赖性改善相关,包括参考基因选择(ABL1与其他)、RQ-PCR试剂选择、检测类型(FDA批准、商业或实验室开发)或实践环境。因此,基于IS的报告可能是BCR::ABL1定量中实验室间精密度增强的主要驱动因素,验证了在临床分子诊断中采用稳健标准化的真实世界临床相关性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
BCR::ABL1 RNA定量的实验室间精密度是否随时间改善,以及是否归因于基于IS的标准化校准的机构采用。
核心机制
基于IS的报告是BCR::ABL1定量实验室间精密度增强的主要驱动因素,但因果关系不能确定证明。
主要证据
15年CAP能力验证数据(2009-2023年,>200实验室,>5500结果)显示,早期IS采用率从8%升至86%,与实验室间SD降低显著负相关(高样本r=-0.73,p=0.004;中样本r=-0.71,p=0.022;低样本r=-0.84,p=0.002),晚期SD达~0.2 nadir。
研究意义
验证了在临床分子诊断中采用稳健标准化的真实世界临床相关性,强调IS报告在确保CML一致可靠分子监测中的关键作用。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

能力验证数据收集

获取15年实验室间BCR::ABL1定量性能数据。

分析CAP能力验证项目2009A至2023B共30次邮寄的BCR::ABL1结果,每次3个样本,共75样本、5534结果。

2

IS采用率时间趋势分析

评估实验室采用IS报告的比例随时间变化。

计算每次邮寄中报告IS结果的实验室百分比,并拟合时间回归线。

3

实验室间精密度评估

量化不同转录本水平下实验室间SD随时间的变化。

对高、中、低转录本水平分别计算log(ratio)或log(IS)的实验室间SD,并与IS采用率进行相关性分析。

4

混杂因素排除分析

检验其他变量是否与精密度改善相关。

比较ABL1与非ABL1参考基因、FDA批准与实验室开发检测、商业与非商业试剂、学术与参考实验室之间的实验室间方差。

5

临床里程碑识别评估

评估实验室正确识别MMR(≤0.1% IS)样本的能力随时间变化。

计算正确将低转录本样本归类为MMR的受访者百分比。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
SAS 9.4版SAS Institute--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
能力验证样本
样本制备:CML细胞系RNA稀释于BCR::ABL1阴性RNA;转录本水平分类:高(10倍稀释)、中(1:100、1:1000、1:5000)、低(1:10,000、1:50,000、1:100,000);每次邮寄样本数:3个(部分邮寄2个)
阅读提示:Methods中Specimen information小节;Supplementary Table 1
IS采用率分析
IS报告率时间点:2009年8%、2015年86%、2019年>99%;时间窗口划分:早期2009-2015A、中期2015B-2019A、晚期2019B-2023B
阅读提示:Results中Percent of laboratories using IS over time小节;Fig. 1
精密度评估
报告单位:log(ratio)和log(IS);SD计算方式:每个水平、每次邮寄分别计算;离群值筛查:2-pass 3-SD;相关性分析:Pearson相关系数
阅读提示:Methods中Data analysis小节;Table 1
混杂因素分析
参考基因分组:ABL1 vs 非ABL1;检测类型分组:FDA批准 vs 非FDA;试剂来源分组:商业 vs 实验室开发;实验室类型分组:学术 vs 参考;统计检验:ANOVA、Levene检验
阅读提示:Results中Control gene over time、Sources of primers/probes over time等小节;Methods中Data analysis