病例筛选与组织病理学确认
建立PSIL、湿疣和乳头状HSIL的回顾性研究队列并确认诊断。
回顾性检索医院病理数据库,筛选诊断为湿疣、PIM、未成熟湿疣、PSIL、乳头状HSIL及具有乳头状特征的HSIL病例,复习所有H&E染色切片确认诊断,选取代表性组织块。
Hippo pathway disruption and YAP1 activation in anogenital papillary squamous intraepithelial lesion
回顾性队列36例PSIL、20例湿疣、2例乳头状HSIL,行免疫组化、HPV CISH和基因分型,无功能验证。
36例PSIL/乳头状未成熟化生患者组织样本 20例湿疣(尖锐湿疣)患者组织样本 2例乳头状高级别鳞状上皮内病变(HSIL)患者组织样本
act-YAP1免疫组化核染色半定量分级:<15%为局限性,15%–49%为局灶性,>50%为弥漫性 HPV CISH使用RNAscope探针检测6种低危和18种高危HPV E6/E7 mRNA HPV基因分型使用Allplex HPV28检测法(19种高危和9种低危HPV型别) p16免疫组化分类为阴性、局灶/斑片状或块状(弥漫) Ki67增殖指数以百分比记录,范围20%–75%
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立PSIL、湿疣和乳头状HSIL的回顾性研究队列并确认诊断。
回顾性检索医院病理数据库,筛选诊断为湿疣、PIM、未成熟湿疣、PSIL、乳头状HSIL及具有乳头状特征的HSIL病例,复习所有H&E染色切片确认诊断,选取代表性组织块。
确定PSIL、湿疣和乳头状HSIL的HPV感染型别及E6/E7转录本分布模式。
使用RNAscope CISH检测低危和高危HPV E6/E7 mRNA;对部分病例使用Allplex HPV28检测法进行基因分型;对宫颈细胞学样本进行Cobas HPV检测。
评估act-YAP1在PSIL、湿疣和乳头状HSIL中的表达模式,并检测p16、p53、Rb1、CK7和Ki67的表达。
在4μm厚FFPE切片上使用自动染色平台进行免疫组化,一抗包括act-YAP1、p16、p53、Rb1、CK7和Ki67,DAB聚合物检测。
分析YAP1激活与HPV状态、病变部位、原发/复发及其他生物标志物之间的关联。
比较HPV阳性与阴性PSIL、宫颈与非宫颈PSIL、原发与复发PSIL中act-YAP1表达差异,并与p16、p53、Rb1、CK7、Ki67免疫表型进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | Ventana Benchmark Ultrasensitive自动染色平台 | Ventana | -- |
| 活化YAP1抗体(克隆EPR19812) | Abcam | -- | |
| p16抗体(克隆E6H4) | VMS | -- | |
| p53抗体(克隆DO7) | DAKO | -- | |
| Rb1抗体(克隆G3-245) | BD Biosciences | -- | |
| CK7抗体(克隆OV-TL 12/30) | Agilent Dako | -- | |
| Ki67抗体(克隆30-9) | Ventana | -- | |
| 显色原位杂交 | RNAscope探针 | ACD | -- |
| BOND-III自动染色仪 | Leica Biosystems | -- | |
| HPV基因分型 | Allplex HPV28检测试剂盒 | Seegene Inc. | -- |
| HPV检测 | Cobas HPV检测 | Roche Diagnostics USA | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 研究队列与病例筛选 | PSIL 36例(28例患者,含28原发和8复发)、湿疣20例、乳头状HSIL 2例;病变部位分布;患者年龄27–85岁 阅读提示:Materials and methods中Study Cases and Clinicopathologic Data小节及Results中Clinicopathological Characteristics |
| act-YAP1免疫组化 | 抗体克隆EPR19812、稀释比1:3000、品牌Abcam;核染色半定量分级阈值(<15%、15%–49%、50%–75%、>75%);仅核染色判定为阳性 阅读提示:Materials and methods中Immunohistochemical Studies小节 |
| HPV CISH | RNAscope探针检测6种低危和18种高危HPV型别;使用Leica BOND-III自动染色仪;E6/E7转录本分布模式(细点状 vs 大簇状) 阅读提示:Materials and methods中HPV Testing and Genotyping小节及Figure 1–3图注 |
| HPV基因分型 | Allplex HPV28检测法覆盖19种高危和9种低危HPV型别;Cobas HPV检测覆盖14种高危型别,细胞学样本采集于活检前3–8周 阅读提示:Materials and methods中HPV Testing and Genotyping小节及Table 1 |
| p16及其他免疫组化 | p16克隆E6H4即用型、p53克隆DO7 1:20、Rb1克隆G3-245 1:140、CK7克隆OV-TL 12/30 1:40、Ki67克隆30-9即用型;p16分类为阴性、局灶/斑片状或块状 阅读提示:Materials and methods中Immunohistochemical Studies小节及Results中Immunohistochemistry for p16, p53, Rb1, CK7 and Ki67 in PSIL |
| 统计分析 | 卡方检验或Fisher精确检验;双侧P<0.05为显著 阅读提示:Materials and methods中Statistical Analysis小节 |