临床评估与AZF微缺失检测
明确无精子症诊断、激素特征及是否存在Y染色体AZF大片段缺失
进行病史、体检、至少两次精液分析、内分泌评估、阴囊超声、核型分析及EAA/EMQN指南推荐的AZFa/b/c STS多重PCR检测
DDX3Y Loss-of-Function Variant in AZFa-Like Non-Obstructive Azoospermia Highlights Gaps in Current Y-Chromosome Microdeletion Testing
包含临床评估、micro-TESE、睾丸组织病理、WES和Sanger验证,但仅单例,无功能实验或动物模型验证。
特发性NOA患者 患者睾丸组织样本 外周血基因组DNA
患者激素水平:FSH 10.2 IU/L(参考1–7),LH 7.4 IU/L(参考2–10),T 18.8 nmol/L(参考>12) 标准AZFa/b/c STS微缺失检测阴性 micro-TESE未取到精子,组织学为SCO综合征 WES检出DDX3Y c.1501C>T (p.Arg501*) 变异,Sanger测序验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确无精子症诊断、激素特征及是否存在Y染色体AZF大片段缺失
进行病史、体检、至少两次精液分析、内分泌评估、阴囊超声、核型分析及EAA/EMQN指南推荐的AZFa/b/c STS多重PCR检测
尝试获取精子并评估睾丸组织学表型
全麻下使用手术显微镜行micro-TESE,取睾丸组织样本行H&E染色和全切片数字扫描,由盲法病理学家评估组织学
寻找与男性不育相关的基因变异,解释AZFa样表型
对外周血基因组DNA行WES,针对男性不育相关基因面板分析,过滤罕见变异,Sanger测序验证候选变异
评估DDX3Y变异的致病性及基因对LoF变异的约束
分析变异在人群数据库中的频率,预测NMD和蛋白截短影响,查询gnomAD中DDX3Y的LoF约束指标
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| H&E染色 | VENTANA HE 600自动化染色系统 | Roche Diagnostics | -- |
| 组织切片数字化 | PANNORAMIC 480数字切片扫描仪 | 3DHISTECH Ltd | -- |
| 全外显子测序 | SureSelect XT Human All Exon Kit V6 + UTR | -- | -- |
| Illumina NovaSeq X Plus测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床评估与AZF微缺失检测 | 精液分析按WHO第6版且离心后沉渣镜检;FSH、LH、T参考范围;核型分析方法;AZF STS多重PCR的EAA/EMQN指南版本及 accredited laboratory 阅读提示:Methods: Clinical evaluation and micro-TESE |
| micro-TESE与组织病理 | 每侧睾丸取样数15个;显微切开和取样时间约3小时;精子搜索方案(初始3小时200×,延长10小时三台显微镜含Nomarski光学);固定液Bouin;切片厚度4–5 μm;病理评估盲法 阅读提示:Methods: Clinical evaluation and micro-TESE; Figure 1A legend |
| 全外显子测序与变异解读 | 外显子捕获试剂盒SureSelect XT Human All Exon Kit V6 + UTR;测序平台Illumina NovaSeq X Plus;读长151-bp paired-end;平均覆盖度>100X;参考基因组GRCh37/hg19;变异过滤人群频率<2%;男性不育基因面板来源 阅读提示:Methods: Exome sequencing and variant interpretation |
| 变异致病性分析与基因约束评估 | gnomAD版本v2.1.1;pLI值;观察/预期值及置信区间;NMD预测规则 阅读提示:Results; Discussion |