AZFa样非梗阻性无精子症中的DDX3Y功能丧失变异突显当前Y染色体微缺失检测的不足

DDX3Y Loss-of-Function Variant in AZFa-Like Non-Obstructive Azoospermia Highlights Gaps in Current Y-Chromosome Microdeletion Testing

作者信息Florence Abou, Netanel Waldenberg, Shany Kravat, Moran Gershoni, Sandra E Kleiman, Naama Steiner, Atef Zeadna, Guy Bar, Oshri Barel, Snir Dekalo, Ruti Parvari, Shlomi Barak
PMID42775988
发布时间2026-09-23
DOI10.1530/RAF-26-0046

实验完整度

中

包含临床评估、micro-TESE、睾丸组织病理、WES和Sanger验证,但仅单例,无功能实验或动物模型验证。

主要模型

特发性NOA患者 患者睾丸组织样本 外周血基因组DNA

重点核对

患者激素水平:FSH 10.2 IU/L(参考1–7),LH 7.4 IU/L(参考2–10),T 18.8 nmol/L(参考>12) 标准AZFa/b/c STS微缺失检测阴性 micro-TESE未取到精子,组织学为SCO综合征 WES检出DDX3Y c.1501C>T (p.Arg501*) 变异,Sanger测序验证

摘要

由生精障碍导致的非梗阻性无精子症(NOA)是手术取精(SSR)最具挑战性的情况之一。Yq11上AZFa的完全缺失通常导致一致的唯支持细胞(SCO)表型,使睾丸取精徒劳。当前的EAA/EMQN指南依赖序列标签位点(STS)为基础的PCR来检测多千碱基的AZFa缺失;然而,这种设计无法捕获关键AZFa基因内的基因内功能丧失(LoF)变异。近期外显子研究已确定DDX3Y是AZFa内的关键生精因子,表明孤立的DDX3Y LoF变异可重现经典AZFa样SCO表型,尽管AZFa STS谱看似正常。我们报告一例特发性NOA且具有AZFa样表型的男性;FSH升高、核型正常、标准AZFa/b/c STS检测阴性,显微切开睾丸取精(micro-TESE)显示完全SCO综合征且未取到精子。全外显子测序(WES)随后揭示DDX3Y一个编码外显子中存在一个新的可能致病性LoF变异,该缺陷无法通过常规AZFa PCR检测。此病例增加了已发表的与NOA和SCO综合征相关的DDX3Y功能丧失变异的少量报道,并说明了基于STS的AZF检测的一个重要诊断局限性。我们建议,对于经微缺失检测阴性但具有AZFa样表现的选择性NOA男性,在外显子或靶向面板解读中应考虑DDX3Y。在建立常规检测算法、SSR禁忌症或成本效益结论之前,需要前瞻性队列研究。经验证后,这种方法将避免不必要的低产出SSR,同时增强预后咨询和资源利用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
标准AZF STS检测阴性的特发性NOA患者是否存在AZFa基因内的致病性变异从而解释AZFa样表型?
核心机制
DDX3Y功能丧失变异(c.1501C>T, p.Arg501*)可能通过提前终止密码子触发无义介导的mRNA降解或产生缺乏C端解旋酶结构域的截短蛋白,导致DDX3Y功能丧失,进而引起AZFa样生精失败。
主要证据
患者表现为NOA、FSH升高、核型正常、AZF STS检测阴性、micro-TESE未取到精子且组织学为SCO;WES发现DDX3Y无义变异,Sanger验证,变异在gnomAD中缺失且DDX3Y对LoF高度约束。
研究意义
提示基于STS的AZF检测无法检出AZFa基因内序列变异,对于经微缺失检测阴性但具有AZFa样表现的选择性NOA男性,考虑DDX3Y测序可能改善遗传诊断和术前咨询,但需前瞻性队列验证。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

临床评估与AZF微缺失检测

明确无精子症诊断、激素特征及是否存在Y染色体AZF大片段缺失

进行病史、体检、至少两次精液分析、内分泌评估、阴囊超声、核型分析及EAA/EMQN指南推荐的AZFa/b/c STS多重PCR检测

2

显微切开睾丸取精(micro-TESE)与组织病理

尝试获取精子并评估睾丸组织学表型

全麻下使用手术显微镜行micro-TESE,取睾丸组织样本行H&E染色和全切片数字扫描,由盲法病理学家评估组织学

3

全外显子测序与变异解读

寻找与男性不育相关的基因变异,解释AZFa样表型

对外周血基因组DNA行WES,针对男性不育相关基因面板分析,过滤罕见变异,Sanger测序验证候选变异

4

变异致病性分析与基因约束评估

评估DDX3Y变异的致病性及基因对LoF变异的约束

分析变异在人群数据库中的频率,预测NMD和蛋白截短影响,查询gnomAD中DDX3Y的LoF约束指标

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
VENTANA HE 600自动化染色系统Roche Diagnostics--
PANNORAMIC 480数字切片扫描仪3DHISTECH Ltd--
SureSelect XT Human All Exon Kit V6 + UTR----
Illumina NovaSeq X Plus测序平台Illumina--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床评估与AZF微缺失检测
精液分析按WHO第6版且离心后沉渣镜检;FSH、LH、T参考范围;核型分析方法;AZF STS多重PCR的EAA/EMQN指南版本及 accredited laboratory
阅读提示:Methods: Clinical evaluation and micro-TESE
micro-TESE与组织病理
每侧睾丸取样数15个;显微切开和取样时间约3小时;精子搜索方案(初始3小时200×,延长10小时三台显微镜含Nomarski光学);固定液Bouin;切片厚度4–5 μm;病理评估盲法
阅读提示:Methods: Clinical evaluation and micro-TESE; Figure 1A legend
全外显子测序与变异解读
外显子捕获试剂盒SureSelect XT Human All Exon Kit V6 + UTR;测序平台Illumina NovaSeq X Plus;读长151-bp paired-end;平均覆盖度>100X;参考基因组GRCh37/hg19;变异过滤人群频率<2%;男性不育基因面板来源
阅读提示:Methods: Exome sequencing and variant interpretation
变异致病性分析与基因约束评估
gnomAD版本v2.1.1;pLI值;观察/预期值及置信区间;NMD预测规则
阅读提示:Results; Discussion