Gal3在朊病毒感染小鼠中的表达动态与细胞定位
明确Gal3在疾病进展中的时空表达及其细胞来源。
对SSLOW腹腔接种C57BL/6J小鼠不同时间点取脑,Western blot检测Gal3;免疫组化与免疫荧光检测Gal3与IBA1、TMEM119、P2Y12、Vim共定位。
Protective role of Galectin-3 in prion disease through regulation of microglial PrPSc uptake
含体内朊病毒感染小鼠模型、原代脑组织免疫荧光与共定位、Western blot、RT-qPCR、共免疫沉淀及基因敲除小鼠生存分析等多层级功能与机制验证
SSLOW朊病毒株脑内接种C57BL/6J小鼠 Gal3基因敲除小鼠 Becn1条件性敲除小鼠(Becn1flox/floxLyz2Cre/Cre)
SSLOW接种剂量与途径:1%脑匀浆,脑内20 μL或腹腔200 μL Gal3 KO与WT小鼠生存时间比较(i.c.接种SSLOW) 小胶质细胞相关PrPSc puncta及细胞内/细胞外比值的定量 PrPSc与Gal3的共免疫沉淀验证结合 终末期与早期临床期LAMP1、cathepsin D表达及共定位分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确Gal3在疾病进展中的时空表达及其细胞来源。
对SSLOW腹腔接种C57BL/6J小鼠不同时间点取脑,Western blot检测Gal3;免疫组化与免疫荧光检测Gal3与IBA1、TMEM119、P2Y12、Vim共定位。
验证Gal3缺失是否改变朊病毒病的临床进程与生存。
Gal3 KO与WT小鼠脑内接种SSLOW,监测临床体征、发病与生存时间,并进行性别分层分析。
判断Gal3缺失是否改变脑内PrPSc总量及反应性胶质标志物。
终末期与早期临床期取脑,Western blot检测PrPSc(蛋白酶K处理)、CD11b、IFITM3、Vim、LAMP1、cathepsin D;RT-qPCR检测Tlr4、Ccl2、CD68、GPNMB等基因。
检验Gal3是否促进小胶质细胞对PrPSc的吞噬性摄取及其与PrPSc的结合。
脑组织IBA1与PrPSc(3D17/SAF-84)共免疫荧光,定量小胶质细胞相关PrPSc puncta及细胞内/外比值;抗Gal3抗体磁珠免疫沉淀后Western blot检测PrPSc。
验证Gal3缺失是否改变小胶质细胞对神经元的包裹。
NeuN与IBA1共免疫荧光,ImageJ定量神经元密度、被包裹神经元百分比、小胶质细胞密度及参与包裹的小胶质细胞百分比。
检验Gal3是否通过溶酶体功能或小胶质细胞自噬影响疾病进展。
Western blot与免疫荧光检测LAMP1、cathepsin D及其共定位;利用Becn1 cKO小鼠脑内接种SSLOW评估自噬抑制对疾病进展与PrPSc的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光与免疫组化 | 小鼠单克隆抗朊病毒蛋白抗体,克隆SAF-84 | Cayman Chemicals | 189775 |
| 兔单克隆抗朊病毒蛋白抗体,克隆3D17 | Millipore Sigma | ZRB1268 | |
| 兔多克隆抗IBA1抗体 | Fujifilm Wako Chemicals USA | 013-27691 | |
| 山羊多克隆抗IBA1抗体 | Bio-techne | NB100-1028 | |
| 大鼠单克隆抗Gal3抗体,克隆M3/38 | Santa Cruz Biotechnology Inc. | sc-23938 | |
| 兔抗P2Y12抗体 | Anaspec | #55043A | |
| TMEM119抗体 | Cell Signaling Technology | #90840 | |
| 兔抗Vim抗体 | Cell Signaling Technology | #5741 | |
| 小鼠单克隆抗NeuN抗体,克隆A60 | Millipore Sigma | MAB377 | |
| 大鼠单克隆抗LAMP1抗体,克隆1D4B | BioLegend | 121601 | |
| 兔多克隆抗CD11b抗体 | Abcam | ab128797 | |
| 兔多克隆抗干扰素诱导跨膜蛋白3抗体 | Proteintech | 11714-1-AP | |
| 兔单克隆抗组织蛋白酶D抗体 | Cell Signaling Technology | 69854 | |
| 山羊多克隆抗GPNMB抗体 | Bio-techne | AF2320 | |
| Western blot | 小鼠单克隆抗β-actin抗体,克隆AC-15 | Millipore Sigma | A5441 |
| 共免疫沉淀 | 兔单克隆抗Gal3抗体,克隆E7B6R | Cell Signaling Technology | 89572 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488、546和647标记二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫组化 | 自发荧光消除试剂 | Sigma-Aldrich | 2160 |
| 信号增强剂 | Cell Signaling Technology | 11932 | |
| DAB Quanto显色剂与底物 | Thermo Fisher Scientific | TA125QHDX | |
| Western blot | 蛋白酶K | New England BioLabs | P8107S |
| RIPA裂解缓冲液 | Millipore Sigma | 20-188 | |
| NuPAGE 12% Bis-Tris凝胶 | Thermo Fisher Scientific | NP0341BOX | |
| Immobilon Forte Western HRP底物 | Millipore Sigma | WBLUF0100 | |
| SuperSignal West pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 34577 | |
| 共免疫沉淀 | Protein A/G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 88803 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Millipore Sigma | P8340 | |
| RT-qPCR | Trizol | Thermo Fisher Scientific | 15-596-026 |
| Aurum总RNA微型试剂盒 | Bio-Rad | 7326820 | |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708890 | |
| 组织切片 | Superfrost Plus显微镜载玻片 | Thermo Fisher Scientific | 22-037-246 |
| 免疫组化 | 抗原修复液 | Sigma-Aldrich | C9999 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物接种与临床监测 | SSLOW接种途径(i.c. 20 μL或i.p. 200 μL)、1%脑匀浆浓度、6–7周龄小鼠、终末期判定标准(无法直立和/或体重下降20%) 阅读提示:Methods 2.1 Animals |
| Gal3表达时间进程 | SSLOW腹腔接种后取样时间点(92 dpi、122 dpi、终末期157–166 dpi)及每组动物数N=4–5 阅读提示:Results 3.1及Figure 1A图注 |
| 小胶质细胞PrPSc摄取定量 | 每组N=5只动物、每只3个视野、每视野60–80个小胶质细胞、PrPSc puncta判定阈值(>5 pixels)、Gal3阳性判定阈值(>15% IBA1面积) 阅读提示:Methods 2.7与Figure 6图注 |
| PrPSc Western blot检测 | 5%脑匀浆、蛋白酶K 20 μg/mL、37°C 30 min、50 mM Tris pH 7.5与2% Sarcosyl处理条件 阅读提示:Methods 2.8 Western blot |
| 神经元包裹定量 | NeuN与IBA1共染、皮质区域取样、包被判定阈值(NeuN与IBA1重叠>5%)、每组N=5只动物 阅读提示:Methods 2.6与Figure 5图注 |
| Becn1 cKO自噬抑制实验 | Becn1flox/floxLyz2Cre/Cre雌性小鼠、对照Lyz2Cre/Cre、SSLOW脑内接种、每组N=7(Western blot) 阅读提示:Methods 2.1与Figure 9图注 |