CIA小鼠模型建立与BPNSs口服干预
验证清除肠道ROS对关节炎进展的治疗作用。
DBA/1J小鼠以牛II型胶原/CFA初次免疫、21天后IFA加强免疫建立CIA,口服BPNSs或PBS,评估关节炎评分、micro-CT骨形态计量、H&E与TRAP染色。
Targeted intestinal ROS scavenging alleviated rheumatoid arthritis by microbial metabolite kynurenic acid mediated Treg/Th17 balance through AhR pathway activation
包含CIA小鼠模型、体外naïve CD4+ T细胞分化、IEC-6细胞、粪菌移植及宏基因组与代谢组分析,并有AhR拮抗剂功能验证
胶原诱导性关节炎(CIA)DBA/1J小鼠模型 C57BL/6小鼠(FMT、DSS结肠炎及细胞分离) 小鼠脾源naïve CD4+ T细胞体外Treg分化体系 IEC-6肠上皮细胞系
BPNSs口服剂量1 mg/kg bw/d,PBS等体积对照 广谱抗生素鸡尾酒剂量:万古霉素100 mg/kg/d、新霉素硫酸盐200 mg/kg/d、甲硝唑200 mg/kg/d、氨苄青霉素钠200 mg/kg/d KYNA口服50 mg/kg/d,于加强免疫前5天开始;AhR拮抗剂CH-223191口服10 mg/kg/d CIA模型:牛II型胶原1 mg/mL与CFA/IFA乳化,尾根部皮下注射100 μL,第21天加强免疫 体外Treg诱导:anti-CD3e 0.25 μg/ml、anti-CD28 1 μg/ml、IL-2 100 U/ml、TGF-β1 5 ng/ml,KYNA 200 μM用于RNA-seq
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证清除肠道ROS对关节炎进展的治疗作用。
DBA/1J小鼠以牛II型胶原/CFA初次免疫、21天后IFA加强免疫建立CIA,口服BPNSs或PBS,评估关节炎评分、micro-CT骨形态计量、H&E与TRAP染色。
确定BPNSs疗效是否依赖肠道菌群。
以广谱抗生素鸡尾酒耗竭菌群后给予BPNSs,或将BPNSs处理小鼠粪菌移植给抗生素预处理的CIA小鼠,评估关节炎、骨破坏及Treg/Th17。
解析BPNSs对肠道菌群组成及代谢谱的影响并筛选关键代谢物。
对CIAPBS与CIABPNSs组粪便进行宏基因组测序及非靶向代谢组分析,比较菌群多样性、差异菌属及差异代谢物,重点检测色氨酸代谢物KYNA、IAA、IPA。
验证KYNA是否经AhR促进naïve CD4+ T细胞向Treg分化及其信号通路。
分子对接预测KYNA与AhR结合;体外Treg诱导条件下给予不同浓度KYNA及CH-223191,流式检测FOXP3;RNA-seq与GSEA分析;Western blot检测AKT/mTOR通路磷酸化及FOXP3。
验证KYNA在CIA小鼠中的疗效是否经AhR介导。
CIA小鼠口服KYNA或KYNA联合CH-223191,评估关节炎评分、micro-CT、H&E/TRAP染色、脾与MLN的Treg/Th17及结肠ZO-1/Occludin;IEC-6细胞验证紧密连接蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| CIA造模 | 牛II型胶原 | Chondrex Inc. | 20022 |
| 完全弗氏佐剂 | Chondrex Inc. | 7001 | |
| 不完全弗氏佐剂 | Chondrex Inc. | 7002 | |
| 药物处理 | CH-223191 | Aladdin | C303374 |
| DHE染色 | 二氢乙锭 | Absin | abs810256-5mg |
| 免疫荧光 | 兔抗ZO-1抗体 | Proteintech | 21773-1-AP |
| 兔抗Occludin抗体 | Proteintech | 27260-1-AP | |
| Western blot | p-mTOR (Ser2448)抗体 | Zenbio | 381557 |
| mTOR抗体 | Abmart | T55306F | |
| p-p70 S6激酶(Thr389)抗体 | Cell Signaling Technology | 9205 | |
| p70 S6激酶抗体 | Zenbio | R25650 | |
| p-AKT (Ser473)抗体 | Zenbio | 310021 | |
| AKT抗体 | Zenbio | R23411 | |
| p-4E-BP1 (Thr46)抗体 | Zenbio | R22929 | |
| 4E-BP1抗体 | Zenbio | R24197 | |
| FOXP3抗体 | Bioss | bs-10211R | |
| HRP标记β-actin抗体 | ABclonal | AC028 | |
| EZ ECL Pico化学发光底物 | Life-iLab | AP34L024 | |
| 蛋白酶抑制剂 | Biosharp | BL630B | |
| 磷酸酶抑制剂 | Beyotime | P1081 | |
| qPCR | TRIzon试剂 | CWBIO | CW0580S |
| 含gDNA去除剂的qPCR逆转录预混液 | ABclonal | RK20433 | |
| 2X通用SYBR Green快速qPCR预混液 | ABclonal | RK21203 | |
| 流式分析 | 可固定活性染料eFluor 780 | eBioscience | 65-0865-14 |
| 纯化抗小鼠CD16/CD32抗体 | BD Pharmingen | 553141 | |
| CD45-PE抗体 | BioLegend | 103105 | |
| CD45-BV510抗体 | BioLegend | 103137 | |
| CD4-FITC抗体 | eBioscience | 11-0042-82 | |
| CD8α-PE/Cy7抗体 | BioLegend | 100722 | |
| CD11b-PE/Cy7抗体 | BioLegend | 101215 | |
| Gr-1 (Ly6G/Ly6C)-BV421抗体 | BioLegend | 108445 | |
| Ly6C-APC抗体 | BioLegend | 128015 | |
| Ly6G-PerCP/Cy5.5抗体 | BioLegend | 127615 | |
| F4/80-FITC抗体 | BioLegend | 157309 | |
| CD11c-APC抗体 | BioLegend | 117309 | |
| MHC II类(I-A/I-E)-FITC抗体 | BioLegend | 107605 | |
| CD86-PerCP抗体 | BioLegend | 105025 | |
| 细胞激活鸡尾酒(含布雷菲德菌素A) | BioLegend | 423303 | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | 00-5523-00 | |
| IFN-γ-PerCP/Cy5.5抗体 | BioLegend | 163509 | |
| TNF-α-BV421抗体 | BioLegend | 506328 | |
| IL-17A-PE抗体 | eBioscience | 12-7177-81 | |
| FOXP3-APC抗体 | eBioscience | 17-5773-82 | |
| DSS结肠炎造模 | 葡聚糖硫酸钠 | MeilunBio | MB5535 |
| naïve CD4+ T细胞分离 | 小鼠naïve CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-453 |
| T细胞激活 | 抗CD3e抗体 | Thermo Fisher Scientific | 16-0031-82 |
| 抗CD28抗体 | Thermo Fisher Scientific | 16-0281-82 | |
| Treg诱导分化 | 重组人IL-2 | PeproTech | 200-02 |
| 重组人TGF-β1 | PeproTech | 100-21-50UG | |
| 血清炎症因子检测 | RayPlex®小鼠炎症阵列试剂盒1 | RayBiotech | FAM-INF-1-48 |
| micro-CT分析 | Bruker SkyScan 1272系统 | Bruker | SkyScan 1272 |
| RNA-seq | NEBNext Ultra II RNA文库构建试剂盒(Illumina) | New England Biolabs | -- |
| AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter | -- | |
| Agilent 5400片段分析仪 | Agilent Technologies | 5400 | |
| Illumina NovaSeq X Plus测序平台 | Illumina | NovaSeq X Plus | |
| qPCR | CFX96 Touch系统 | Bio-Rad | CFX96 Touch |
| Western blot | Bio-Rad ChemiDoc Touch成像系统 | Bio-Rad | ChemiDoc Touch |
| 流式分析 | BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | FACSCanto II |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CIA小鼠造模与BPNSs口服干预 | 小鼠品系与性别周龄(雄性DBA/1J,8–10周龄)、胶原剂量(1 mg/mL,100 μL)、免疫间隔(21天)、BPNSs剂量(1 mg/kg bw/d口服)、给药起始时间 阅读提示:Methods中CIA mice model establishment and relevant treatments及Figure 1A图注 |
| 抗生素耗竭与粪菌移植 | 抗生素种类与剂量、预处理时长(7天,第二次免疫前12天开始)、FMT时间(加强免疫前5天)与灌胃体积(200 μL) 阅读提示:Methods中FMT and ABX treatment及Figure 2A、Figure 3A图注 |
| KYNA与CH-223191体内给药 | KYNA剂量(50 mg/kg/d)、CH-223191剂量(10 mg/kg/d)、给药起始时间(加强免疫前5天)与途径(灌胃) 阅读提示:Methods中CIA mice model establishment and relevant treatments及Figure 7A图注 |
| 体外naïve CD4+ T细胞Treg诱导 | 细胞接种密度(4×10⁴/孔)、anti-CD3e/anti-CD28浓度、IL-2与TGF-β1浓度、培养时长(3天)、KYNA浓度梯度(具体梯度文中未明确说明) 阅读提示:Methods中Isolation of naïve CD4+ T cells and Treg cell differentiation及Figure 6B图注 |
| 宏基因组与代谢组分析 | 粪便样本来源与分组、测序深度与质控阈值、代谢物鉴定数据库、差异分析统计方法 阅读提示:Methods中Metagenomic sequencing与Fecal non-targeted metabolomics analysis及Figure 4、Figure 5图注 |