受试者招募与心理评估
获取跨诊断患者和健康对照的样本,并进行TMT心理测试
招募74名患者和41名健康对照,使用M.I.N.I.评估健康对照,进行TMT-A和TMT-B测试并记录完成时间
Predicting trail-making test performance using 7-Tesla structural cerebral MRI
使用7T MRI测量74例患者和41例对照的形态学数据,深度学习模型预测TMT表现,SHAP分析特征重要性。
74名跨诊断患者 41名健康对照 7T MRI结构脑影像数据
样本量:74名患者和41名健康对照 MRI扫描参数:7T Magnetom Terra,MP2RAGE序列,TI=840ms/2370ms,TE=1.99ms,TR=4500ms,分辨率0.75mm各向同性 TMT测试:TMT-A连接1-25数字,TMT-B连接1-13和A-L交替,记录完成时间(秒) 模型训练:10次随机留出循环,严格留一被试交叉验证,最大200轮,Adam优化器学习率0.2 分类终点:基于中位数时间分为高于/低于中位数两组,报告平均准确率
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取跨诊断患者和健康对照的样本,并进行TMT心理测试
招募74名患者和41名健康对照,使用M.I.N.I.评估健康对照,进行TMT-A和TMT-B测试并记录完成时间
获取高分辨率结构脑影像
使用7T Magnetom Terra扫描仪和32通道头线圈,采用MP2RAGE序列采集T1加权图像
从MRI图像中提取灰质体积、皮质厚度和脑回化值
使用CAT12.9工具箱进行VBM预处理,包括不均匀性校正、配准、分割;基于Schaefer 100图谱划分脑区;表面处理提取皮质厚度和脑回化
基于形态学特征预测TMT完成时间是否高于中位数
使用前馈神经网络,三损失目标函数和softmax激活,输入304个特征,两个隐藏层(64和32单元),10次留出循环,严格留一被试交叉验证
识别对模型预测最重要的脑形态学特征
使用Python的SHAP包计算所有10次留出循环的平均SHAP值,绘制汇总图和水fall图
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| MRI数据采集 | 7T Magnetom Terra扫描仪 | Siemens Healthineers | -- |
| 1Tx 32Rx头线圈7T临床版 | Nova Medical | -- | |
| 图像格式转换 | MRIcron软件 | -- | -- |
| 图像质量检查 | FSLeyes View软件 | -- | -- |
| VBM预处理 | v7771软件 | FIL Methods Group, University College London | -- |
| MATLAB R2023a v9.14 | The MathWorks | -- | |
| CAT12.9工具箱 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 受试者招募与分组 | 样本来源:74名患者来自Universitätsklinik Aachen,41名健康对照;患者诊断分布(49名MDD,8名精神分裂症等);纳入标准:右利手,无MRI禁忌症 阅读提示:Methods - Recruitment小节 |
| MRI数据采集参数 | 扫描仪型号:7T Magnetom Terra;序列:MP2RAGE;TI=840ms/2370ms,FA=5°/6°,TE=1.99ms,TR=4500ms,分辨率0.75mm各向同性,208层 阅读提示:Methods - MRI parameters小节 |
| 图像预处理与特征提取 | 预处理软件:CAT12.9工具箱;配准方法:测地线方法;图谱:Schaefer 100;表面配准模板:FsAverage;特征类型:GMV、皮质厚度、脑回化 阅读提示:Methods - Preprocessing小节 |
| 深度学习模型训练 | 网络结构:输入304特征,隐藏层64和32单元;损失函数:三损失函数;优化器:Adam,学习率0.2;最大轮数200;10次留出循环;严格留一被试交叉验证 阅读提示:Methods - Classification小节;Fig. 1 |
| TMT测试与分类 | TMT-A和B测试流程;分类阈值:中位数时间(TMT-A 25.169秒,TMT-B 55.928秒);排除标准:2名患者因拉丁字母知识不足排除出TMT-B分析 阅读提示:Methods - Psychological testing小节;Results第一段 |