乳酸通过GCN5介导的H3K9乳酸化增加脂肪酸氧化促进肝再生

Lactate Promotes Liver Regeneration by Increasing Fatty Acid Oxidation Through GCN5-Mediated H3K9 Lactylation

作者信息Xun Qiu, Hanzhi Xu, Lijun Meng, Yunguo Lei, Yawen Tan, Zunqiang Xiao, Xiao Tang, Xinyu Yang, Fengqiang Gao, Yingying Zhang, Libin Dong, Zhoucheng Wang, Yuqi Gong, Xinyang Zhong, Nasha Qiu, Ruhong Zhou, Kai Wang, Xiao Xu
PMID42586207
发布时间2026-08-12
DOI10.1016/j.jcmgh.2026.101859

实验完整度

高

包含小鼠PHx模型、Ldha敲除、细胞、类器官和人肝组织多个独立证据层级,并有功能与机制验证。

主要模型

70%部分肝切除C57BL/6J小鼠模型 肝细胞特异性Ldha敲除小鼠 AML12小鼠肝细胞系和原代肝细胞 小鼠肝细胞类器官及人肝癌癌旁正常肝组织

重点核对

NALA剂量:0.05 g/kg处理组肝重体重比和PCNA最高,术前6小时腹腔注射后每日注射 PHx模型:雄性C57BL/6J小鼠22–24 g,70%部分肝切除术,48小时为主要检测时间点 EdU标记:处死前6小时腹腔注射50 mg/kg EdU,用于检测增殖肝细胞 体外处理:AML12细胞使用10 mM NALA处理24小时,类器官使用10 mM NALA处理72小时 基因干预:LDHA-shRNA、GCN5-siRNA、GCN5 WT或E639Q质粒转染,LDHA抑制剂GSK2837808A和MCT1抑制剂AZD3965处理

摘要

背景与目的:乳酸化已被认为参与包括皮肤和心脏在内的多个器官的修复与再生。肝脏是乳酸代谢的重要器官,但乳酸和乳酸化在肝再生中的作用仍不清楚。方法:对小鼠进行70%部分肝切除术,测量肝重与体重比及增殖标志物。通过免疫共沉淀检测蛋白质-蛋白质相互作用。通过理论建模预测GCN5催化的关键位点。使用CUT&Tag和bulk RNA测序鉴定H3K9乳酸化调控的下游基因。使用小鼠肝细胞类器官和人肝组织验证H3K9乳酸化的效应。结果:在部分肝切除术后48小时,乳酸补充显著改善肝重与体重比,并上调肝脏中Ki-67、增殖细胞核抗原和5-乙炔基-2'-脱氧尿苷掺入水平,而肝细胞特异性Ldha敲除小鼠表现出肝再生能力受损。体外实验表明,细胞内乳酸增加上调H3乳酸化并促进肝细胞增殖。机制上,GCN5而非P300或MOF被确定为催化H3K9乳酸化的关键酶。此外,乳酸处理在肝再生过程中促进GCN5与H3K9之间的相互作用。Glu639被确定为GCN5催化H3K9乳酸化的关键氨基酸残基。CUT&Tag和bulk RNA测序结果进一步揭示,H3K9乳酸化上调Lipin1的表达及其介导的脂肪酸氧化相关基因的转录。乳酸和H3K9乳酸化的促再生效应使用小鼠肝细胞类器官和人肝组织得到验证。结论:乳酸通过促进GCN5介导的H3K9乳酸化促进肝再生,该乳酸化上调Lipin1转录及随后肝细胞中Lipin1介导的脂肪酸氧化。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
乳酸和乳酸化在肝再生过程中发挥什么调控作用及其潜在机制尚不清楚,本研究旨在探究这一问题。
核心机制
乳酸通过增强GCN5介导的H3K9乳酸化,上调Lipin1转录及其介导的脂肪酸氧化相关基因表达,从而促进肝细胞增殖和肝再生。
主要证据
小鼠70% PHx模型显示NALA补充改善肝重体重比和增殖标志物,Ldha敲除损害再生;AML12细胞、原代肝细胞、小鼠肝细胞类器官及人肝组织验证了H3K9la对增殖和Lipin1/FAO基因的调控。
研究意义
本研究提示乳酸补充可能成为促进PHx后肝再生的潜在治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立PHx肝再生模型并检测乳酸与乳酸化变化

明确肝再生过程中肝脏乳酸水平和组蛋白乳酸化水平的动态变化

对小鼠进行70% PHx,在术后24、48、72小时检测肝脏乳酸水平,并用Western blot检测H3PanKla、H3K9la和H3K18la水平

2

评价乳酸补充对肝再生的影响

验证外源乳酸是否促进肝再生并确定合适剂量

小鼠术前和术后腹腔注射不同剂量NALA或PBS,检测肝重体重比、PCNA、Ki-67、EdU掺入、乳酸水平、组蛋白乳酸化及细胞周期和干性相关基因mRNA

3

验证Ldha缺失对肝再生的影响及乳酸补救

明确内源乳酸产生对肝再生的必要性以及外源乳酸能否挽救Ldha缺失表型

对Ldhafl/fl和Ldhafl/fl;Alb-Cre小鼠进行PHx,检测肝乳酸、肝重体重比、血清乳酸、Ki-67、PCNA和细胞周期/干性基因;并在Ldha敲除小鼠中补充NALA观察挽救效果

4

在细胞水平验证乳酸对肝细胞增殖和乳酸化的调控

探究细胞内乳酸水平变化是否调节肝细胞增殖、干性和H3乳酸化

使用NALA或MCT1抑制剂AZD3965处理AML12细胞,检测细胞活力、集落形成、H3PanKla/H3K9la/H3K18la及细胞周期和干性相关基因mRNA;并用LDHA抑制剂GSK2837808A或LDHA敲低进一步验证

5

鉴定催化H3乳酸化的关键酰基转移酶及位点

确定肝细胞中催化H3K9乳酸化的酶和关键氨基酸残基

在HEK293T细胞中共转染Myc-H3与Flag-MOF、Flag-GCN5或Flag-P300,Co-IP检测H3乳酸化;在AML12细胞中敲低GCN5并检测增殖和乳酸化;通过理论建模和E639Q突变验证GCN5与H3K9la的结合及功能

6

筛选H3K9la下游靶基因及脂肪酸氧化通路

鉴定H3K9乳酸化调控的下游基因及其参与的代谢过程

用PBS或10 mM NALA处理AML12细胞,进行H3K9la CUT&Tag和bulk RNA-seq,结合分析筛选同时具有H3K9la增加和转录上调的基因,并进行KEGG和GO富集分析

7

验证H3K9la-Lipin1-FAO轴在体内和类器官中的作用

在体内、类器官和临床样本中验证乳酸通过H3K9la上调Lipin1及FAO相关基因

在NALA处理或Ldha敲除的PHx肝组织中检测Lipin1总蛋白、核/质蛋白、TG含量、油红O染色和FAO相关基因mRNA;在小鼠肝细胞类器官中检测NALA对生长、H3K9la、PCNA和Lipin1/FAO基因的影响;在人肝癌癌旁正常肝组织中检测H3K9la与PCNA相关性

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
高糖Dulbecco改良Eagle培养基Gibco--
胎牛血清Wisent--
青霉素-链霉素Invitrogen--
jetPRIME转染试剂Polyplus--
AZD3965SelleckS7339
GSK2837808ASelleckS8590
NALASigma-Aldrich71,718
EdUMedChemExpressHY-118411
Trizol试剂Invitrogen--
Hifair AdvanceFast一步法RT-gDNA消化SuperMix qPCR试剂盒Yeason--
CFX96 Touch实时PCR系统Bio-Rad--
qPCR SYBR Green预混液Yeason--
放射免疫沉淀分析裂解液FUDE--
BCA蛋白检测试剂盒FUDE--
核蛋白提取试剂盒Solarbio--
protein A/G MagPoly磁珠Smart-Lifesciences--
CCK-8溶液MCE--
乳酸检测试剂盒Solarbio--
甘油三酯检测试剂盒Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute--
Matrigel基质胶Corning--
肝类器官培养基JFKR--
抗H3K9la抗体PTM Bio--
抗IgG阴性对照抗体PTM Bio--
抗β-actin抗体CST4970S
抗P300抗体CST57625S
抗H3抗体CST4499S
抗Myc抗体CST2276S
抗Flag抗体CST8146S
抗Lipin1抗体CST5195T
抗H3K18la抗体PTMPTM-1406RM
抗H3K9la抗体PTMPTM-1419RM
抗PanKla抗体PTMPTM-1401RM
抗MOF抗体Abcamab200660
抗GCN5抗体Abcamab217876
抗LDHA抗体InvitrogenPA5-88137
抗PCNA抗体Proteintech60097-1-Ig

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
PHx肝再生模型
小鼠品系、性别、体重、切除比例、麻醉方式及检测时间点;文中明确为雄性C57BL/6J小鼠22–24 g,70% PHx,异氟烷麻醉,48小时为主要分析点
阅读提示:见Materials and Methods中Animal Experiments小节及Figure 1 legend
NALA处理
NALA剂量、给药途径、给药时间及对照;文中明确0.05 g/kg处理组再生能力最高,术前6小时腹腔注射后每日注射,对照为PBS
阅读提示:见Materials and Methods中Animal Experiments小节及Figure 1 legend
Ldha敲除与NALA挽救
Ldhafl/fl;Alb-Cre小鼠构建方式、对照基因型、PHx后检测时间及NALA处理方案;文中明确由Ldhafl/fl与Alb-Cre杂交,PHx后36或48小时分析,n=5/组
阅读提示:见Materials and Methods中Animal Experiments小节及Figures 1、2 legend
体外细胞处理
细胞系、NALA浓度、处理时间、AZD3965和GSK2837808A剂量范围、siRNA/shRNA靶序列及转染后检测时间;文中明确AML12细胞使用10 mM NALA处理24小时,AZD3965处理24小时,GSK2837808A处理24或48小时,转染后48–72小时收集
阅读提示:见Materials and Methods中Cell Lines, Culture, and Transfection、Reagents小节及Table 1、Table 2、Figure 3、4 legend
小鼠肝细胞类器官实验
类器官来源、接种细胞数、Matrigel品牌、培养基品牌、NALA浓度、处理时间及检测指标;文中明确每孔24孔板接种20,000–50,000个细胞,Matrigel为Corning,培养基为JFKR,10 mM NALA处理72小时
阅读提示:见Materials and Methods中Murine Hepatocyte Organoid Culture and Analysis小节及Figure 12 legend
CUT&Tag与bulk RNA-seq
细胞处理条件、样本量、抗体和测序平台;文中明确AML12细胞用10 mM NALA处理,CUT&Tag使用100,000细胞/样本,H3K9la抗体和IgG对照来自PTM Bio,RNA-seq由BGI Genomics完成,n=3/组
阅读提示:见Materials and Methods中CUT&Tag, Bulk RNA Sequencing, and Functional Enrichment Analyses小节及Figure 10 legend
人肝组织样本分析
样本来源、样本量、伦理批号及检测方法;文中明确来自9例接受肝切除术的肝癌患者癌旁正常肝组织,伦理批号KT2025046,Western blot检测H3K9la和PCNA相关性
阅读提示:见Materials and Methods中Human Liver Tissue Samples小节及Figure 13 legend