临床分离株采集与确认
获取经种特异性qRT-PCR确认的间日疟原虫单一感染临床分离株。
在加蓬Moyen-Ogooué省开展横断面家庭监测,采集患者全血,离心去除白细胞,用于涂片、流式、冻存及RNA提取。
Tropism of Plasmodium malariae for young red blood cells and the bone marrow
离体临床分离株流式与成像流式分析,以及人源化HIS-HEry小鼠体内感染验证,含功能与机制验证。
加蓬间日疟原虫单一感染患者外周血分离株(n=4) 恶性疟原虫单一感染患者外周血分离株(n=10)及巴西间日疟原虫分离株(n=3) 人源化HIS-HEry小鼠(n=9,植入2份脐血CD34+造血祖细胞)
临床分离株分组:间日疟原虫n=4、恶性疟原虫n=10、间日疟原虫n=3,均经种特异性qRT-PCR确认为单一感染 流式染色标志物及浓度:Hoechst 33342 16.2 µM、CD45-FITC、CD71-PE-Vio615、CD235a-AlexaFluor647 HIS-HEry小鼠感染:感染前1天及之后每5天静脉注射200 µL氯膦酸盐脂质体,经眶后注射2.5×10⁶–5×10⁶感染红细胞,感染后第9天取材 寄生虫定量:以pLN-Pm18S质粒标准品(5–5×10⁹拷贝/µL)进行18S rRNA qPCR,Cq<38判为阳性 统计方法:图1(a)采用混合效应逻辑回归,图3(b)采用Wilcoxon符号秩检验,P<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取经种特异性qRT-PCR确认的间日疟原虫单一感染临床分离株。
在加蓬Moyen-Ogooué省开展横断面家庭监测,采集患者全血,离心去除白细胞,用于涂片、流式、冻存及RNA提取。
评估间日疟原虫对CD71+网织红细胞与CD71-成熟红细胞的感染比例。
取1 µL去白细胞红细胞,Hoechst 33342染色30分钟,再染CD45-FITC和CD71-PE-Vio615,在BD Symphony A1上采集至少100万事件,FlowJo分析。
直观确认间日疟原虫感染CD71+年轻网织红细胞。
对冻存分离株红细胞染色Hoechst 33342、anti-CD45-FITC、anti-CD71-PE-Vio615、anti-CD235a-AlexaFluor647,在ImageStream ISX MkII上分析,IDEAS软件处理。
确定间日疟原虫感染红细胞中的虫期分布及DNA含量。
对同一批外周血分离株进行Giemsa涂片显微镜检查虫期,并用Hoechst荧光强度区分早期与晚期寄生虫。
验证间日疟原虫能否归巢并感染骨髓。
将人CD34+造血祖细胞经肝内注射至新生免疫缺陷CH1-2hSaW41HHH小鼠,3个月后评估嵌合率,感染前1天及之后每5天静脉注射氯膦酸盐脂质体,经眶后注射间日疟原虫感染红细胞,感染后第9天取血和骨髓。
定量感染负荷并鉴定骨髓中感染细胞表型。
提取血和骨髓RNA,逆转录,用pLN-Pm18S质粒标准品进行qPCR检测间日疟原虫18S rRNA;同时用成像流式分析骨髓CD235a+CD71+细胞内DAPI+寄生虫。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取与qRT-PCR | PAXgene稳定化血液采集管 | BD | 12937706 |
| RNA提取 | Mag-Bind总RNA 96试剂盒 | Omega Bio-Tek | M6731-01 |
| KingFisher Flex仪器 | Thermo Scientific | -- | |
| qRT-PCR | SensiFAST一步法预混液 | Bioline | BIO-76005 |
| LightCycler 480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 流式细胞术 | Hoechst 33342 | Thermo Fisher | H3570 |
| 抗CD45-FITC抗体 | BioLegend | 368508 | |
| 抗CD71-PE-Vio615抗体 | Miltenyi Biotec | 130-115-036 | |
| BD Symphony A1流式细胞仪 | BD | -- | |
| 成像流式细胞术 | 抗CD235a-AlexaFluor647抗体 | BioLegend | 349130 |
| 抗CD235a-FITC抗体 | Biolegend | 349104 | |
| 抗CD71-AlexaFluor700抗体 | Biolegend | 334130 | |
| ImageStream ISX MkII成像流式细胞仪 | Amnis Corp. | -- | |
| 人源化小鼠构建 | EasySep人CD34阳性选择试剂盒II | Stemcell Technologies | 17856 |
| RNA提取 | NucleoZol RNA提取试剂 | Machery-Nagel | 740404.200 |
| NucleoSpin RNA提取试剂盒 | Machery-Nagel | 740406.50 | |
| 逆转录 | SuperScript II逆转录酶 | Invitrogen | 18064-022 |
| qPCR | SsoAdvanced通用SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1725271 |
| CFX96 Touch实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床分离株流式细胞术 | 样本量(间日疟原虫n=4,恶性疟原虫n=10,间日疟原虫n=3)、Hoechst 33342浓度(16.2 µM)、抗体克隆与货号、采集事件数(≥1×10⁶) 阅读提示:Methods中“Flow cytometric analysis of infected red blood cells from clinical isolates”及Figure 1图注 |
| 人源化HIS-HEry小鼠感染 | CD34+细胞注射量(1.7–1.9×10⁵)、小鼠品系(CH1-2hSaW41HHH)、氯膦酸盐脂质体给药方案(200 µL,感染前1天及之后每5天)、感染红细胞数量(2.5×10⁶–5×10⁶)、感染后取材时间(第9天) 阅读提示:Methods中“Generation of humanized mice (HIS-HEry)”和“Infection of HIS-HEry mice with P. malariae” |
| 小鼠寄生虫定量qPCR | RNA提取试剂盒、逆转录酶、qPCR预混液、质粒标准品浓度范围(5–5×10⁹拷贝/µL)、Cq阳性阈值(<38) 阅读提示:Methods中“Parasite quantification in HIS-HEry mice” |
| 成像流式细胞术 | 抗体组合(CD45-FITC、CD71-PE-Vio615、CD235a-AlexaFluor647或DAPI、CD235a-FITC、CD71-AlexaFluor700)、固定条件(4% PFA/0.075% glutaraldehyde) 阅读提示:Methods中“Imaging flow cytometry”及Supplementary Figures S2–S4 |
| 数学模型校正 | 疟原虫红细胞周期假设(间日疟原虫T=2天,间日疟原虫T=3天)、CD71半衰期范围(0.5–1.6天) 阅读提示:Methods中“Statistical analysis and mathematical modelling”及Figure 2 |