队列建立与LBP检测
确定诊断时IBD患者血浆LBP是否升高
前瞻性纳入新诊断未治疗小儿UC、CD、IBD阴性对照和健康对照,测量血浆LBP浓度
Plasma lipopolysaccharide-binding protein (LBP), a proxy for intestinal permeability, relates to clinicopathological and immunological disease activity in inflammatory bowel disease patients at diagnosis and during disease course
包含纵向血浆样本、内镜活检组织学评分、血浆免疫蛋白质组学及免疫组化等多层验证
新诊断未治疗小儿UC患者(n=61,含4例IBD-Unclassified) 新诊断未治疗小儿CD患者(n=115) 小儿IBD阴性对照(n=33)和健康对照(n=28) 纵向随访血浆样本(n=1083,中位随访628天)
血浆LBP浓度(EDTA血浆1000倍稀释,Human LBP DuoSet ELISA) 临床疾病活动度评分(UC用PUCAI;CD用wPCDAI) 内镜评分(UC用UCEIS总分和最高亚分;CD用SES-CD) 组织学活动度评分(改良GHAS) 诱导治疗类型及时间(visit 2约3个月后;UC用皮质类固醇或5-ASA;CD用抗TNF、皮质类固醇或EEN)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定诊断时IBD患者血浆LBP是否升高
前瞻性纳入新诊断未治疗小儿UC、CD、IBD阴性对照和健康对照,测量血浆LBP浓度
评估LBP与临床、内镜和组织学疾病活动度及疾病范围的关系
将血浆LBP与PUCAI、wPCDAI、UCEIS、SES-CD、改良GHAS及疾病范围进行相关性和多变量线性回归分析
探究LBP是否与疾病特异性免疫反应相关
使用Olink proximity extension assay检测92种血浆免疫蛋白,免疫组化检测肠道活检IL-17A和calprotectin阳性细胞,流式检测外周血中性粒细胞
评估不同诱导治疗对LBP浓度的影响
比较诊断时和visit 2(约3个月诱导治疗后)血浆LBP浓度,按治疗类型分层
评估LBP在病程中与临床和内镜疾病活动度的关系
使用线性混合模型分析LBP与PUCAI/wPCDAI随时间的关联,并按疾病活动状态和FCP分层比较LBP
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| LBP检测 | 人LBP DuoSet ELISA试剂盒 | R&D systems | DY870-05 |
| 血浆免疫蛋白检测 | 92种炎症蛋白面板 | Olink | -- |
| 组织学染色 | 多聚赖氨酸粘附载玻片 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫组化 | Vectastain ABC Elite试剂盒 | Vector Laboratories | -- |
| 组织学染色 | 伊红(黄色,醇溶性) | -- | -- |
| Leica Multistainer ST 5020染色机 | Leica | -- | |
| 切片扫描 | 3DHistech PANNORAMIC® MIDI II扫描仪 | 3DHistech | -- |
| 免疫组化 | AB血清 | Sanquin | -- |
| 封片 | Entallan封片剂 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LBP检测 | 血浆样本类型(EDTA血浆)、稀释倍数(1000×)、ELISA试剂盒(R&D systems, cat. DY870-05) 阅读提示:Methods 2.3 LPS-binding protein (LBP) ELISA |
| 队列和样本采集 | 患者纳入标准(新诊断未治疗小儿IBD)、样本来源(TISKids RCT、LONGITUDINAL队列、PIBD-SETQuality队列)、随访时间(中位628天)、样本量(1083份血浆) 阅读提示:Methods 2.1 Patients 和 2.2 Sample and clinical data collection |
| 疾病活动度评分 | 临床评分(UC: PUCAI;CD: wPCDAI)、内镜评分(UC: UCEIS;CD: SES-CD)、组织学评分(改良GHAS)、疾病范围分类(巴黎分类) 阅读提示:Methods 2.2 Sample and clinical data collection 和 2.5 Immunohistochemistry and histological scoring |
| 诱导治疗分层 | UC诱导治疗类型(皮质类固醇、5-ASA)及样本量;CD诱导治疗类型(抗TNF、皮质类固醇、EEN)及样本量;visit 2时间点(约3个月) 阅读提示:Figure 5 legend 和 Results 3.6 |
| 免疫蛋白质组学 | Olink 92 Inflammation Panel、蛋白浓度表达(NPX)、排除标准(>50%样本低于检测限的14种蛋白被排除)、样本量(CD n=115, UC n=58) 阅读提示:Methods 2.4 Plasma immune protein measurement using proximity extension assay |
| 统计方法 | Shapiro-Wilk正态性检验、多重检验校正、多变量线性回归模型协变量(LBP、CRP、ESR、白蛋白、Hb)、线性混合模型固定效应和随机效应、显著性阈值P<.05 阅读提示:Methods 2.6 Statistics 和各Figure legends |