研究队列构建与组织芯片制备
获取LCNEC样本并进行组织芯片构建,以评估TROP2表达。
从临床档案中识别含有LCNEC成分的切除标本,按WHO第5版标准确认诊断,排除LCNEC区域过小、仅CD56阳性及EGFR靶向治疗后的病例。构建组织芯片,每个病例包含两个1 mm的LCNEC成分芯。
TROP2 immunoreactivity in pulmonary large cell neuroendocrine carcinoma
基于58例纯LCNEC和25个混合LCNEC区域的组织芯片,进行TROP2免疫组化及临床相关性分析,无体外或体内功能验证。
58例纯LCNEC组织芯片 25个混合LCNEC肿瘤中的LCNEC成分组织芯片 8例纯LCNEC全切片样本 5例LCNEC合并NSCLC全切片样本
TROP2 IHC阳性阈值:≥1%肿瘤细胞任何强度染色为阳性;≥50%肿瘤细胞染色为弥漫阳性 细胞质型与细胞膜型染色分类:<25%阳性肿瘤细胞为细胞膜多于细胞质染色定义为细胞质型;≥25%为细胞膜型 RB1 IHC评分:分为染色缺失和染色保留 神经内分泌标志物染色:INSM1、突触素或嗜铬粒蛋白在≥20%癌细胞中染色为弥漫性;<20%为局灶性 组织块年龄中位数为9年,用于亚组分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取LCNEC样本并进行组织芯片构建,以评估TROP2表达。
从临床档案中识别含有LCNEC成分的切除标本,按WHO第5版标准确认诊断,排除LCNEC区域过小、仅CD56阳性及EGFR靶向治疗后的病例。构建组织芯片,每个病例包含两个1 mm的LCNEC成分芯。
检测LCNEC中TROP2蛋白表达水平及染色模式。
使用TROP2抗体(克隆ENZ-ABS380-0100,1:1500稀释,孵育30分钟,Cedarlane)在BOND Rx自动染色平台上进行免疫组化,热诱导抗原修复使用Epitope Retrieval 2(Leica)20分钟,BOND Polymer Refine Detection试剂盒(Leica)显色。两位病理学家独立评分,不一致病例共同复核达成共识。
评估TROP2染色与RB1 IHC、神经内分泌标志物染色、NSCLC/SCLC成分及生存结局的关系。
使用卡方检验或Fisher精确检验分析分类变量关联,Cox比例风险模型分析生存数据,Cohen's kappa评估观察者间一致性。生存分析包括47例早期可切除患者的RFS和31例晚期患者的DSS。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| TROP2免疫组化 | TROP2抗体(克隆ENZ-ABS380-0100) | Cedarlane | ENZ-ABS380-0100 |
| BOND Rx自动染色平台 | Leica | -- | |
| 抗原修复液2 | Leica | -- | |
| BOND聚合物精制检测试剂盒 | Leica | -- | |
| 其他免疫组化 | Dako OMNIS平台 | Agilent Technologies | -- |
| Envision Flex检测系统 | Agilent Technologies | -- | |
| 数据分析与统计 | R | R Foundation for Statistical Computing | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TROP2免疫组化染色 | 抗体克隆ENZ-ABS380-0100,稀释比例1:1500,孵育时间30分钟,抗原修复液Epitope Retrieval 2,修复时间20分钟,检测试剂盒BOND Polymer Refine Detection kit,染色平台BOND Rx 阅读提示:Methods中的Immunohistochemistry小节 |
| TROP2染色评分 | 阳性阈值:≥1%肿瘤细胞任何强度染色;弥漫阳性阈值:≥50%肿瘤细胞染色;细胞质型与细胞膜型分类:<25%阳性细胞为细胞膜多于细胞质染色定义为细胞质型 阅读提示:Methods中的Immunohistochemistry小节及Results中的Prevalence of TROP2 Immunostaining小节 |
| RB1和神经内分泌标志物免疫组化 | RB1 IHC评分标准(缺失/保留),神经内分泌标志物染色阈值(INSM1、突触素或嗜铬粒蛋白在≥20%癌细胞中染色为弥漫性),具体方案参见Table S1 阅读提示:Methods中的Study Cohort小节及Supplementary Methods中的Table S1 |
| 研究队列特征 | 58例纯LCNEC,17例合并NSCLC,6例合并SCLC,2例混合三种成分;排除标准:LCNEC区域过小、仅CD56阳性、EGFR靶向治疗后 阅读提示:Methods中的Study Cohort小节及Results中的Study Cohort小节 |
| 生存分析 | RFS分析n=47,DSS分析n=31,使用Cox比例风险模型,P<0.05为显著 阅读提示:Methods中的Statistical Analysis小节及Results中的生存分析部分 |