T1D小鼠模型建立与认知评估
确认糖尿病导致认知衰退及肠道菌群的作用
STZ诱导T1D小鼠,11周后通过MWM评估学习记忆,并通过FMT实验验证肠道菌群的作用。
Akkermansia muciniphila protects diabetes-associated cognitive decline by enhancing leucine catabolism and suppressing neuronal excessive mitophagy
包含T1D/T2D小鼠模型、SH-SY5Y细胞及原代神经元体外模型、患者队列,并进行了TBK1敲低功能验证和DARTS/CETSA/Co-IP机制验证。
C57BL/6小鼠T1D模型(STZ诱导) C57BL/6小鼠T2D模型(高脂饮食联合STZ诱导) SH-SY5Y细胞(高糖及亮氨酸处理) 糖尿病患者的血清和粪便样本队列
T1D模型:STZ 60 mg/kg腹腔注射连续5天,血糖>11.1 mmol/L判定为糖尿病 FMT干预:ABX鸡尾酒处理1周后,口服灌胃CON小鼠粪便悬液100 μL/天,连续14天 AKK干预:隔天口服灌胃约1×10^8 CFU AKK,持续12周 亮氨酸干预:T1D小鼠亮氨酸补充8或12周,或隔天喂食亮氨酸缺乏饮食12周 TBK1敲低:尾静脉注射AAV-PHP.eB-hsyn-shTBK1,病毒滴度1.5×10^12,于STZ后0和6周各注射200 μL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认糖尿病导致认知衰退及肠道菌群的作用
STZ诱导T1D小鼠,11周后通过MWM评估学习记忆,并通过FMT实验验证肠道菌群的作用。
鉴定与DACD相关的菌群和代谢物变化
对CON、T1D和FMT小鼠进行16S rRNA测序和血清/海马氨基酸靶向代谢组学分析。
验证过量亮氨酸对神经元活性和认知功能的影响
体外SH-SY5Y细胞活力检测,体内亮氨酸补充(8和12周)和剥夺(12周)实验,结合MWM、组织染色和RT-qPCR。
验证AKK通过分解亮氨酸缓解DACD
体外AKK与亮氨酸共孵育,T1D小鼠口服AKK 12周,检测亮氨酸水平和认知功能。
阐明亮氨酸导致神经元损伤的细胞机制
SH-SY5Y细胞转录组学和GSEA分析,TOM20/LC3B共定位,JC-1染色,ATP和ROS检测,海马组织验证。
鉴定亮氨酸直接相互作用的蛋白
DARTS结合Astral DIA定量蛋白质组学筛选靶点,DARTS和CETSA验证TBK1结合,Western blot检测TBK1磷酸化,Co-IP验证OPTN相互作用。
验证TBK1在亮氨酸诱导的线粒体自噬和认知损伤中的必要性
AAV-shTBK1脑内敲低TBK1,观察亮氨酸对线粒体自噬、神经元损伤和认知功能的影响。
在糖尿病患者中验证AKK、亮氨酸与认知功能的关联
招募健康对照、T1D和T2D患者,评估认知功能,检测粪便AKK丰度和血清亮氨酸水平,分析相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| T1D模型建立 | 链脲佐菌素 | Solarbio | S8050 |
| T2D模型建立 | 高脂饮食 | Research Diets | D12492 |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Biosharp | BL305A |
| 细胞活力检测 | CCK8检测试剂盒 | GlpBio | GK10001 |
| AKK培养 | 脑心浸液培养基 | Oxoid | CM1135B |
| 粘蛋白 | Yuanye Bio-Technology | S12066 | |
| L-半胱氨酸 | Sangon Biotech | A600132-0100 | |
| 厌氧培养 | 厌氧产气袋 | Mitsubishi | C-01 |
| 粪便DNA提取 | 粪便DNA提取试剂盒 | TIANGEN BlOTECH | DP328-02 |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Bio-Rad | 1725124 |
| H&E染色 | 伊红 | ZSGB-BIO | ZLI-9613 |
| 尼氏染色 | 尼氏染色液 | Beyotime | C0117 |
| 免疫组化 | NeuN (D4G4O) XP抗体 | Cell Signaling Technology | #24307 |
| TOM20抗体 | Affinity | AF5206 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| DAB显色试剂盒 | ZSGB-BIO | ZLI-9018 | |
| 免疫荧光 | LC3B抗体 | Affinity | AF4650 |
| TOM20抗体 | Abcam | ab289670 | |
| OPTN抗体 | Proteintech | 60293-1-Ig | |
| TBK1抗体 | Affinity | DF7026 | |
| Alexa Fluor 488标记的抗小鼠IgG | HUABIO | HA1125 | |
| DyLight 488标记的抗大鼠IgG | Earthox | E0322240-01 | |
| Alexa Fluor 555标记的抗兔IgG | Abcam | AB150078 | |
| DAPI | Solarbio | C0065 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TaKaRa | 9109 |
| 逆转录 | HiScript III逆转录预混液 | Vazyme | R323-01 |
| Western blot | 裂解缓冲液 | BOSTER | AR0101; AR0103-100 |
| 蛋白酶抑制剂 | APPLYGEN | p1260 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Beyotime | ST506-2 | |
| PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010 | |
| 脱脂奶粉 | Biofroxx | 1172GR500 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 泛磷酸化丝氨酸兔多克隆抗体 | Abclonal | AP0932 | |
| 泛素抗体 | UpingBio | YP-mAb-18538 | |
| 磷酸化TBK1抗体 | Abclonal | AP0847 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| JC-1染色 | JC-1荧光探针 | Beyotime | C2006 |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0026 |
| DARTS | 链霉蛋白酶 | Roche | 10165921001 |
| SDS-PAGE | 考马斯亮蓝染色液 | Leagene | PT0018 |
| Co-IP | NP40裂解缓冲液 | Beyotime | P0013F |
| PMSF | Beyotime | ST506 | |
| protein A/G琼脂糖珠 | Beyotime | P2055 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| T1D小鼠模型建立 | STZ剂量60 mg/kg,腹腔注射连续5天;血糖>11.1 mmol/L判定标准 阅读提示:Methods 4.3节 |
| FMT干预 | ABX鸡尾酒配方及给药方式;粪便悬液制备比例1:7.5 (w/v),100 μL/天,连续14天 阅读提示:Methods 4.6节 |
| AKK干预 | AKK ATCC BAA-835,隔天灌胃约1×10^8 CFU,持续12周 阅读提示:Methods 4.8节 |
| 亮氨酸补充与剥夺 | 亮氨酸补充8或12周;剥夺采用隔天喂食亮氨酸缺乏饮食12周 阅读提示:Results 2.3节及Figure 3和S6 |
| TBK1敲低 | AAV-PHP.eB-hsyn-shTBK1,病毒滴度1.5×10^12,尾静脉注射200 μL,STZ后0和6周各一次 阅读提示:Methods 4.24节 |
| 临床样本分析 | 队列1:健康对照25例,T1D 19例,T2D 25例;队列2:T2D 145例;认知评分MoCA和MMSE 阅读提示:Methods 4.2节及Results 2.8节 |