SMAD4多重免疫荧光检测建立与优化
优化SMAD4和pan-cytokeratin的染色流程,确保定量免疫荧光分析的可行性。
在胰腺癌患者来源异种移植物的FFPE切片(5微米厚)上进行免疫组化,使用Akoya OPAL试剂和Ventana Discovery Ultra系统,进行抗原修复、一抗孵育、二抗和OPAL检测。
High SMAD4 Expression is Associated with Improved Clinical Outcomes in Patients with Resectable Pancreatic Cancer: An Analysis of NRG Oncology/RTOG 9704
基于III期试验肿瘤组织,行多重免疫荧光定量SMAD4,并进行生存与复发分析,但为回顾性探索且无功能机制验证。
可切除胰腺癌患者肿瘤组织微阵列(TMA) NRG/RTOG 9704 III期临床试验入组患者队列(141例可分析)
SMAD4按中位数二分:<median(70例)vs ≥median(71例) 总细胞SMAD4中位值为7.12荧光强度单位/细胞 每个患者TMA肿瘤由两个芯点代表,结果取平均值 免疫荧光检测限定于pan-cytokeratin阳性细胞,使用pan-cytokeratin mask 多变量模型纳入变量:治疗臂、年龄、性别、种族、CA19-9、肿瘤位置、淋巴结受累、肿瘤直径、手术切缘状态
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
优化SMAD4和pan-cytokeratin的染色流程,确保定量免疫荧光分析的可行性。
在胰腺癌患者来源异种移植物的FFPE切片(5微米厚)上进行免疫组化,使用Akoya OPAL试剂和Ventana Discovery Ultra系统,进行抗原修复、一抗孵育、二抗和OPAL检测。
在NRG/RTOG 9704试验的可切除PC患者肿瘤组织中定量总细胞SMAD4表达。
对TMA切片进行多重免疫荧光染色,使用Vectra Polaris显微镜和inForm软件分析pan-cytokeratin阳性细胞中的总细胞SMAD4荧光强度单位/细胞。
评估SMAD4表达与OS、DFS、LRR和DM的关联。
SMAD4按中位数二分(<median vs ≥median),使用Kaplan-Meier法、log-rank检验、累积发生率法、Gray检验以及Cox比例风险和Fine-Gray回归模型进行单变量和多变量分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光染色 | Akoya OPAL试剂 | Akoya Biosciences | -- |
| 自动染色 | Ventana Discovery Ultra系统 | Roche Diagnostics | -- |
| 抗原修复 | Tris/EDTA缓冲液pH 9 | Agilent/Dako | S236784-2 |
| 免疫荧光染色 | SMAD4抗体(克隆EP618Y) | Abcam | Ab40759 |
| 泛角蛋白抗体(克隆AE1/AE3) | Dako | M351501 | |
| 过氧化物酶抑制剂 | Roche Tissue Diagnostics | 760-4840 | |
| OmniMap抗兔HRP | Roche Tissue Diagnostics | 760-4311 | |
| Omni-Map抗鼠HRP | Roche Tissue Diagnostics | 760-4310 | |
| OPAL 620 | Akoya | FP1495001KT | |
| OPAL 570 | Akoya | FP1488001KT | |
| Spectral DAPI | Akoya Biosciences | FP1490 | |
| 封片 | Prolong Diamond抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36970 |
| 图像采集与分析 | Vectra Polaris显微镜 | -- | -- |
| 图像分析 | inForm图像分析软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本与队列 | 样本来源:NRG/RTOG 9704试验的切除肿瘤TMA;可分析患者141例;入组标准:组织学确认PDAC,病理分期T1-4、N0-1、M0,肉眼全切,KPS≥60,血液/肾/肝功能充足 阅读提示:Methods的Patient population小节及Results第一段 |
| SMAD4免疫荧光检测 | 抗体克隆与稀释:SMAD4 Abcam EP618Y 1:500,pan-cytokeratin Dako AE1/AE3 1:100;抗原修复条件:Tris/EDTA pH 9,100°C,24分钟;OPAL试剂浓度1:50;检测系统:Ventana Discovery Ultra 阅读提示:Methods的SMAD4 multiplex immunofluorescent assay小节及Figure 1图注 |
| SMAD4定量与分组 | 定量方法:Vectra Polaris显微镜和inForm软件,限定pan-cytokeratin阳性细胞;每个患者两个芯点取平均;分组:按中位数(7.12荧光强度单位/细胞)二分,<median(70例)vs ≥median(71例) 阅读提示:Methods的SMAD4 multiplex immunofluorescent assay小节和Statistical Analysis小节,及Results第一段 |
| 生存与失败模式分析 | 统计方法:Kaplan-Meier法、log-rank检验、累积发生率法、Gray检验、Cox比例风险模型、Fine-Gray回归模型;多变量模型变量:治疗臂、年龄、性别、种族、CA19-9、肿瘤位置、淋巴结受累、肿瘤直径、手术切缘状态;中位随访:所有患者1.41年,存活患者6.76年 阅读提示:Methods的Statistical Analysis小节及Tables 1-3 |