验证人TS细胞干性与分化能力
确认人TS细胞在适当条件下可形成STB和EVT亚群
2D人TS细胞在干性条件下维持,或在STB或EVT分化培养基中培养;检测TEAD4、CGB、HLA-G和NOTUM表达
Hippo signaling regulates spontaneous human trophoblast syncytialization in three-dimensional cultures
含2D/3D人TS细胞、BeWo与HTR细胞系、RNA-seq、qPCR、Western blot、ELISA、免疫荧光及LATS-IN-1功能验证
人滋养层干细胞CT27(7周女性)2D与3D无基质培养 BeWo绒毛膜癌细胞2D与3D培养 HTR-8/SVneo永生化滋养层细胞2D与3D培养
3D培养使用AggreWell 800板,每微孔3000个细胞,聚集48小时后转超低吸附板悬浮培养4天 LATS-IN-1处理浓度为10 μM,处理6天,对照为等体积DMSO RNA-seq以FDR < 0.01且绝对倍数变化≥2判定差异基因,每组n=3独立实验 qPCR以EEF2与GAPDH(BeWo)或EEF2与YWHAZ(其他细胞)为内参,采用2-ΔΔCt法 免疫荧光定量:hCG阳性面积/细胞数,Ki67与TEAD4阳性核/总核
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认人TS细胞在适当条件下可形成STB和EVT亚群
2D人TS细胞在干性条件下维持,或在STB或EVT分化培养基中培养;检测TEAD4、CGB、HLA-G和NOTUM表达
检测3D无基质培养是否改变滋养层亚群身份
人TS细胞在AggreWell板中聚集48小时,随后在超低吸附板中悬浮培养4天;与2D培养比较CTB、STB标志物表达和定位
检测3D无基质培养是否在常用滋养层细胞系中诱导类似STB反应
BeWo和HTR细胞按相同3D方案培养,比较CTB和STB标志物表达及hCG免疫荧光
鉴定3D与2D培养间差异表达基因和富集通路
对2D和3D人TS培养进行bulk RNA-seq,PCA、火山图、热图及KEGG/GO富集分析
验证激活YAP1/TAZ-TEAD信号是否影响3D培养中自发STB形成
3D人TS培养用LATS-IN-1或DMSO处理6天;检测YAP1磷酸化、YAP1定位、STB标志物表达、hCG蛋白和分泌CGB
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Corning Inc. | 10-090-CV |
| 胚胎干细胞胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 16141061 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A1595/A9205 | |
| 表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | E9644 | |
| L-抗坏血酸 | Sigma-Aldrich | A8960 | |
| Y27632 | Biogems | 1293823 | |
| A83-01 | Biogems | 9094360 | |
| CHIR99021 | Biogems | 2520691 | |
| SB431542 | Biogems | 3014193 | |
| 丙戊酸 | Sigma-Aldrich | P4543 | |
| 细胞传代 | TrypLE消化液 | Thermo Fisher Scientific | 12604013 |
| Accutase消化液 | STEMCELL Technologies | 07920 | |
| HTR细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Sigma-Aldrich | R8758 |
| BeWo细胞培养 | 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 12483020 |
| 2D培养包被 | IV型胶原蛋白 | Bio-Techne R&D Systems | 3410-010-02 |
| STB分化 | 敲除血清替代物 | Thermo Fisher Scientific | 10828-010 |
| 佛司可林 | Sigma-Aldrich | F6886 | |
| EVT分化 | Cultrex基底膜提取物 | Bio-Techne R&D Systems | 3432-010-01 |
| 神经调节蛋白 | Cell Signaling Technology | 26941S | |
| 3D培养 | AggreWell 800培养板 | STEMCELL Technologies | 34815/34825 |
| 抗黏附冲洗液 | STEMCELL Technologies | 07010 | |
| 37 µm可逆过滤器 | STEMCELL Technologies | 27215 | |
| 超低吸附6孔板 | Corning Inc. | 3471 | |
| 小分子抑制剂处理 | LATS-IN-1 | Cayman Chemicals | 36623 |
| RNA提取 | TRIzol | Thermo Fisher Scientific | -- |
| TRAzol | GeneBio Systems | -- | |
| qPCR | GB-Amp Sybr Green qPCR预混液 | GeneBio Systems | -- |
| CFX96 Connect实时PCR检测系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 免疫荧光 | 山羊血清 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CGB抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-16265 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3195P | |
| hCG抗体 | Abcam | ab9376 | |
| HLA-G抗体 | Santa Cruz Biotechnology | 21799 | |
| Ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| TEAD4抗体 | Sigma-Aldrich | HPA056896 | |
| YAP1抗体 | Abcam | ab205270 | |
| ZO-1抗体 | Thermo Fisher Scientific | 33-9100 | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Fluoromount-G封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | P8340 |
| YAP1抗体 | Cell Signaling Technology | 14074 | |
| 磷酸化YAP1抗体 | Cell Signaling Technology | 13008 | |
| ACTB抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| ELISA | CGB ELISA试剂盒 | DRG International | EIA1911R |
| RNA-seq | RNeasy微型试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| DNase I | Qiagen | 79254 | |
| YAP1/TAZ-TEAD报告基因实验 | GTIIC荧光素酶报告质粒 | Addgene | 34615 |
| jetPRIME转染试剂 | Polyplus Transfection | -- | |
| Bright-Glo荧光素酶检测系统 | Promega | E2610 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 3D无基质人TS培养建立 | 细胞接种密度(每微孔3000个细胞)、AggreWell板预处理、聚集离心条件(100×g 3分钟)、悬浮培养4天、培养基为complete TS media 阅读提示:Methods '3D matrix-free cultures via cell aggregation';Figure 1a |
| LATS-IN-1处理 | LATS-IN-1浓度(10 μM)、处理时长(6天)、对照为等体积DMSO、溶剂为complete TS media 阅读提示:Methods 'Small molecule inhibitors';Figure 5 |
| RNA-seq与差异表达分析 | 每组n=3独立实验、FDR < 0.01且绝对倍数变化≥2、参考基因组GRCh38、测序深度约25 million reads/样本 阅读提示:Methods 'RNA-sequencing';Figure 3、Figure 4 |
| qPCR相对定量 | 内参基因选择(BeWo用EEF2和GAPDH,其他细胞用EEF2和YWHAZ)、2-ΔΔCt法、每个实验独立重复次数(n=3或4) 阅读提示:Methods 'Quantitative RT-PCR';Figure 1b-c、Figure 2a-b、Figure 5c |
| 免疫荧光定量 | hCG阳性面积/细胞数、Ki67和TEAD4阳性核/总核、YAP1胞质百分比计算方法、n=3独立实验 阅读提示:Methods 'Immunofluorescence';Figure 1f-g、Figure 2c、Figure 5b,f |