心内膜特异性Hand2敲除小鼠模型的建立与表型分析
验证HAND2在冠状动脉发育中的作用
使用Cdh5-CreERT2和Bmx-CreERT2小鼠与他莫昔芬诱导产生Hand2内皮/心内膜特异性敲除,收集E15.5胚胎,通过免疫荧光、H&E染色和整体染色分析冠状动脉和心脏形态。
Endocardial transcription factor HAND2 orchestrates hypoxic and TGF-β signaling to modulate coronary artery formation
包含体外细胞实验、小鼠模型、转录组学和CUT&Tag机制验证,且有多重功能验证
Hand2-EKO小鼠(Cdh5-CreERT2介导的EC特异性Hand2敲除) Hand2-EKOBmx小鼠(Bmx-CreERT2介导的心内膜特异性Hand2敲除) HUVECs(HAND2过表达) Hand2-EKOPdgfb小鼠(Pdgfb介导的SV来源冠状动脉EC特异性Hand2敲除)
Hand2-EKO和Hand2-EKOBmx小鼠在E11.5-12.5或E10.5-11.5诱导敲除,E15.5收集胚胎 在E11.5-12.5给予他莫昔芬诱导Cdh5-CreERT2,在E10.5-11.5给予4-羟基他莫昔芬诱导Bmx-CreERT2 通过免疫荧光检测HAND2和ERG共定位验证敲除效率,并通过qPCR检测Hand2 mRNA水平 CUT&Tag使用HAND2抗体(Abcam, ab200040, 1:20)在E14.5分离的EC中进行 TGF-β2重组蛋白处理Hand2-EKO胚胎以评估冠状动脉恢复情况
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证HAND2在冠状动脉发育中的作用
使用Cdh5-CreERT2和Bmx-CreERT2小鼠与他莫昔芬诱导产生Hand2内皮/心内膜特异性敲除,收集E15.5胚胎,通过免疫荧光、H&E染色和整体染色分析冠状动脉和心脏形态。
探究HAND2缺失后的基因表达变化和细胞命运改变
从E14.5 Hand2-EKO和对照心脏中分离CD31+TdTomato+ ECs,进行bulk RNA-seq和scRNA-seq,分析差异表达基因和通路。
鉴定HAND2直接结合的靶基因
从E14.5对照和Hand2-EKO胚胎心脏中分离CD31+TdTomato+ ECs,使用HAND2抗体进行CUT&Tag,分析结合峰。
验证缺氧和TGF-β通路在HAND2介导的冠状动脉发育中的作用
通过遗传抑制HIF通路(Hif1α/Hif2α杂合敲除)或给予重组TGF-β2蛋白处理Hand2-EKO胚胎,评估冠状动脉和心脏表型的恢复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织免疫染色 | Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 |
| OCT包埋剂 | Sakura | 4583 | |
| EdU掺入实验 | EdU | Invitrogen | A10044 |
| Click-iT EdU试剂盒 | Invitrogen | C10340 or C10337 | |
| EC分离和流式分析 | 抗CD31抗体 | BD Pharmingen | 551262 |
| 抗EMCN抗体 | Thermo Fisher Scientific | 50-5851-82 | |
| RNA提取 | RNAeasy微量试剂盒 | Qiagen | 74004 |
| RT-qPCR | HiScript III逆转录预混试剂盒 | Vazyme | R323-01 |
| SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q312-02 | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | P0013B |
| PhosSTOP磷酸酶抑制剂 | Roche | 4693132001 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物A | Beyotime | P1081 | |
| 台式匀浆器(BULLET BLENDER) | Eppendorf | -- | |
| CUT&Tag | Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina Pro | Vazyme | TD904 |
| HAND2抗体 | Abcam | ab200040 | |
| 二抗 | Vazyme | AB207-01 | |
| 心室外植体培养 | 基础培养基 | Gibco | C11995500BT |
| Matrigel基质胶 | Corning | 354230 | |
| VEGF165 | PeproTech | 100-20-10ug |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 内皮特异性Hand2敲除模型 | 他莫昔芬给药时间(E11.5-12.5)和剂量(文中未明确说明);4-羟基他莫昔芬给药时间(E10.5-11.5)和剂量;胚胎收集时间(E15.5) 阅读提示:Methods中的Mice小节和Supplemental Methods中的给药方案 |
| 细胞分选和RNA-seq | 细胞分选标记(CD31+TdTomato+);分选细胞数量(约9,000-12,000);测序平台(Illumina NovaSeq 6000);scRNA-seq细胞数(11,000) 阅读提示:Methods中的EC isolation, RNA extraction, and qPCR和Bulk and scRNA-seq小节 |
| CUT&Tag实验 | 抗体稀释比例(1:20);细胞类型(E14.5 ECs);试剂盒(Vazyme TD904) 阅读提示:Methods中的CUT&Tag assay小节 |
| TGF-β2挽救实验 | TGF-β2给药剂量(剂量依赖,具体文中未明确说明);给药途径(文中未明确说明);分析时间点(E15.5) 阅读提示:Results中的HAND2 harnesses TGF-β部分和图6 |
| 心室外植体培养 | Matrigel比例(1:1);VEGF165浓度(10 ng/mL);培养时间(第3天和第9天) 阅读提示:Methods中的Ventricular explant culture and image小节 |