患者队列与临床信息收集
建立结直肠癌患者样本队列并获取临床病理及分子特征,用于后续靶点表达相关性分析。
回顾性分析2016至2025年间在湖北省肿瘤医院经病理确诊的193例中国结直肠腺癌患者肿瘤标本,收集人口学信息、治疗详情和疗效,以及KRAS、BRAF和MMR状态等分子分型数据。
Profiling EGFR, c-MET, and B7H3 co-expression to guide next-generation dual-drug conjugate strategies in colorectal cancer
包含193例患者样本IHC检测和TIMER数据库mRNA表达与生存分析,涵盖蛋白与RNA两个独立证据层级。
193例中国结直肠腺癌患者肿瘤组织样本 TIMER数据库结直肠癌RNA表达与预后队列
B7H3、c-MET、EGFR阳性定义:H-score ≥100 c-MET IHC使用CONFIRM anti-Total c-MET (SP44) 兔单克隆抗体(#790-4430)在Ventana Benchmark Ultra平台检测 B7H3抗体分别使用D9M2L(#14058)和SP206(ab227670)评估胞内与胞外表位染色差异 AI辅助数字病理c-MET评分与病理学家评分在40例样本中验证一致性 CD276高表达与CRC患者总生存期较差相关,HR为1.406(95% CI, 1.033–1.914)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立结直肠癌患者样本队列并获取临床病理及分子特征,用于后续靶点表达相关性分析。
回顾性分析2016至2025年间在湖北省肿瘤医院经病理确诊的193例中国结直肠腺癌患者肿瘤标本,收集人口学信息、治疗详情和疗效,以及KRAS、BRAF和MMR状态等分子分型数据。
评估B7H3、c-MET和EGFR在CRC组织中的蛋白表达水平和阳性率。
组织经10%福尔马林固定、梯度乙醇脱水、石蜡包埋后3 μm切片。c-MET使用CONFIRM anti-Total c-MET (SP44) 兔单克隆抗体在Ventana Benchmark Ultra平台检测,B7H3和EGFR在Leica Bond III平台检测。由两名盲法病理学家独立评估部分或完全细胞膜染色,染色强度分为0、1+、2+、3+,采用H-score半定量,阳性定义为H-score ≥100。
验证AI辅助数字病理评估c-MET表达的可靠性,并用于后续c-MET评分。
使用Aperio CS2扫描仪20×扫描切片,HALO和HALO AI图像分析软件进行肿瘤区域识别、细胞分割与分类及c-MET膜染色强度定量和H-score生成。随机选取40例样本进行独立病理复核,以H-score差异≤30为一致性阈值。
分析B7H3、c-MET和EGFR表达与患者性别、年龄、TNM分期、分化、部位及KRAS/BRAF/MMR状态的相关性。
使用χ2检验评估三个靶点表达与临床特征关联;使用GraphPad Prism 10进行分子特征相关分析,包括非配对t检验、配对t检验、Pearson和Spearman相关分析。同时比较原发灶与转移灶中三个靶点的表达差异。
系统探索B7H3、c-MET和EGFR在泛癌组织中的RNA表达特征及其与CRC患者总生存期的关联。
使用TIMER数据库分析CD276、MET和EGFR的泛癌RNA表达谱及预后价值,比较CRC肿瘤组织与邻近正常组织的表达差异,并分析CD276表达与总生存期的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | CONFIRM抗总c-MET (SP44) 兔单克隆一抗 | Ventana Medical Systems | 790-4430 |
| ultraView通用DAB检测试剂盒 | Ventana Medical Systems | 760-500 | |
| Bond聚合物精炼检测试剂盒 | Leica Biosystems | DS9800-CN | |
| B7H3抗体 (D9M2L) | Cell Signaling Technology | 14058 | |
| B7H3抗体 (SP206) | Abcam | ab227670 | |
| EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 4267S | |
| 数字病理扫描 | Aperio® CS2切片扫描仪 | Leica Biosystems | -- |
| 数字病理分析 | HALO®和HALO AI®图像分析软件 | Indica Labs | v4.1.5944.161 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列与样本纳入 | 样本来源:2016-2025年湖北省肿瘤医院193例中国结直肠腺癌患者;诊断标准:2026年WHO分类;分期标准:AJCC TNM;伦理批号LCKY2024005 阅读提示:Methods中Ethics statement and patient consent小节 |
| 免疫组化染色与评分 | c-MET抗体克隆号SP44及货号#790-4430;B7H3抗体D9M2L (#14058)与SP206 (ab227670);EGFR抗体#4267S;阳性阈值H-score ≥100;两名盲法病理学家独立评分 阅读提示:Methods中Immunohistochemistry evaluation小节及Figure 1 |
| AI辅助数字病理c-MET评分 | 扫描仪Aperio CS2 20×;分析软件HALO v4.1.5944.161;DAB检测阈值调整范围0.1-0.4;40例验证样本;一致性阈值≤30 H-score 阅读提示:Methods中Digital analysis小节及Figure 2 |
| 临床病理与分子特征相关性分析 | 统计软件R 4.4.1和GraphPad Prism 10;显著性p<0.05;检验方法χ2检验、非配对t检验、配对t检验、Pearson和Spearman相关分析;KRAS/BRAF/MMR状态来源 阅读提示:Methods中Statistical methods小节及Table 1、Figure 5 |
| TIMER数据库生存分析 | 数据库TIMER;CD276 HR 1.406 (95% CI, 1.033–1.914);MET HR 1.033 (95% CI, 0.809–1.319);EGFR HR 1.269 (95% CI, 0.996–1.616) 阅读提示:Results中Association between specific target RNA levels and survival outcomes in CRC小节及Figure 6 |