早期CD25/IL-2/CXCR5表达分析
检测体内免疫或感染后早期激活CD4+ T细胞中CD25、IL-2和CXCR5的表达动态。
OT-II或OT-II-IL-2-eGFP细胞过继转移至CD45.1+ SMARTA小鼠,i.n. NP-OVA/LPS免疫或PR8-OVA感染,在指定时间点分析引流淋巴结中供体细胞的CD69、PD-1、CXCR5、CD25和IL-2-eGFP表达。
Bidirectional regulation by BACH2 coordinates systemic CXCR5- vs. CXCR5+ CD4+ T cell differentiation
包含体外细胞实验、多种小鼠过继转移与免疫/感染模型、流式、免疫印迹、ChIP-qPCR、ATAC-seq等多层级功能与机制验证
OT-II过继转移小鼠模型 PR8-OVA流感病毒感染小鼠模型 OT-II与B1-8i B细胞共转移小鼠模型 体外抗CD3/CD28刺激的naïve CD4+ T细胞
OT-II细胞转移数量:1×10^6或3×10^4,静脉注射 免疫方式与剂量:i.n.或s.c. NP-OVA 100 μg加LPS 3 μg,或i.p. NP-OVA 100 μg加25% Alum;低剂量1 μg或0.2 μg NP-OVA加LPS 病毒感染剂量:PR8 15,000 v.f.u.或PR8-OVA 1,000 v.f.u.,i.n.感染 检测时间点:免疫后第1、2、3天(部分实验第2.5、4天) 流式检测标志物:CD25、CXCR5、PD-1、CD69、IL-2-eGFP、Blimp1-YFP等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测体内免疫或感染后早期激活CD4+ T细胞中CD25、IL-2和CXCR5的表达动态。
OT-II或OT-II-IL-2-eGFP细胞过继转移至CD45.1+ SMARTA小鼠,i.n. NP-OVA/LPS免疫或PR8-OVA感染,在指定时间点分析引流淋巴结中供体细胞的CD69、PD-1、CXCR5、CD25和IL-2-eGFP表达。
确定STAT5信号对CXCR5−和CXCR5+ CD4+ T细胞应答的影响。
OT-II-WT和OT-II-Stat5-KO细胞共转移至CD45.1+ SMARTA小鼠,i.n. NP-OVA/LPS免疫,第3天分析供体细胞比例及PD-1/CXCR5表达。
验证BACH2是否阻断STAT5介导的Blimp1诱导。
体外激活OT-II-WT-Blimp1-YFP和OT-II-Bach2-KO-Blimp1-YFP细胞,或用Blimp1-YFP报告小鼠进行体内过继转移,检测Blimp1-YFP表达;免疫印迹检测BACH2蛋白水平。
检验BACH2缺失对Tfh细胞分化的影响,以及Blimp1或Stat5共缺失是否能挽救该表型。
OT-II-WT、OT-II-Bach2-KO、OT-II-Bach2/Blimp1-DKO或OT-II-Bach2/Stat5-DKO细胞共转移至CD45.1+ SMARTA小鼠,i.n. NP-OVA/LPS免疫,第3天分析PD-1/CXCR5表达。
验证BACH2在引流淋巴结和非引流淋巴结中对Tfh分化的双向调节作用。
OT-II-WT和OT-II-Bach2-KO细胞共转移至CD45.1+ SMARTA小鼠,进行i.n.或s.c. NP-OVA/LPS免疫,分析引流和非引流淋巴结中供体细胞的CD25、CXCR5、PD-1表达。
检验抗原剂量是否决定BACH2对Tfh分化的双向调节方向。
OT-II-WT和OT-II-Bach2-KO细胞共转移,s.c.或i.n.免疫不同剂量NP-OVA加LPS,分析引流淋巴结中PD-1/CXCR5表达。
探究BACH2抑制STAT5介导Blimp1诱导的表观遗传机制。
分析BACH2和STAT5 ChIP-seq数据集,ATAC-seq检测Bach2-KO、Stat5-KO和双敲除细胞中Prdm1位点染色质可及性,H3K27ac ChIP-qPCR检测Prdm1位点H3K27ac水平,并用p300抑制剂RGFP966处理Bach2-KO-Blimp1-YFP细胞检测Blimp1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dynabeads CD4阳性分离试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 小鼠CD4(L3T4)微珠 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 流式分析 | 抗CD16/CD32抗体 | BioLegend | -- |
| 可固定活性染料eFluor 780 | Invitrogen | -- | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | -- | -- | |
| T细胞刺激 | 抗CD3抗体 | eBioscience | -- |
| 抗CD28抗体 | eBioscience | -- | |
| 山羊抗仓鼠IgG | MP Biomedicals | -- | |
| 细胞培养 | 重组人IL-2 | -- | -- |
| 逆转录病毒转导 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- |
| p300抑制实验 | RGFP966 | -- | -- |
| 染色质免疫沉淀 | truChIP染色质剪切试剂盒 | Covaris | -- |
| H3K27ac抗体 | Abcam | -- | |
| 免疫印迹 | 兔抗BACH2抗体 | -- | -- |
| 兔抗β-Actin抗体 | -- | -- | |
| 抗兔IgG辣根过氧化物酶标记二抗 | -- | -- | |
| 流式分析 | APC偶联流感核衣壳蛋白(NP311–325)四聚体 | NIH Tetramer Core Facility | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| OT-II细胞过继转移与免疫 | OT-II细胞转移数量(1×10^6或3×10^4)、转移途径(静脉)、免疫方式(i.n.或s.c.或i.p.)、抗原剂量(NP-OVA 100 μg或1 μg或0.2 μg)、佐剂(LPS 3 μg或Alum 25%)、检测时间点(第1-4天) 阅读提示:Materials and methods中Adoptive transfer, infection, and immunization小节及相应Figure legends |
| 流感病毒感染 | 病毒株(PR8或PR8-OVA)、感染剂量(15,000 v.f.u.或1,000 v.f.u.)、感染途径(i.n.)、检测时间点(第3天) 阅读提示:Materials and methods中Adoptive transfer, infection, and immunization小节 |
| 体外T细胞刺激与分化 | 抗CD3和抗CD28抗体浓度(0.5 μg/ml和1 μg/ml或系列稀释)、培养时间(48 h加1-2天扩增)、IL-2浓度(20 U/ml)、ThNone培养条件 阅读提示:Materials and methods中T cell stimulation, retroviral transduction, and T cell/APC co-culture小节 |
| 流式细胞术检测 | 表面标志染色条件(CXCR5室温1 h,其他4°C 30 min)、pSTAT5/pSTAT3固定破膜条件、抗体来源和稀释度 阅读提示:Materials and methods中Cell preparation, staining, and flow cytometry小节及Figure legends |
| ChIP-qPCR和ATAC-seq | 细胞激活时间(48 h)、H3K27ac抗体用量、ATAC-seq细胞数(5×10^4)、测序深度、数据分析参数 阅读提示:Materials and methods中Chromatin immunoprecipitation、ChIP-seq和ATAC-seq小节 |