人体与小鼠模型中EFHD1表达验证
确认EFHD1在肝细胞中表达并在MASH中上调。
分析人肝单细胞RNA-seq、免疫组化及Western blot;给予小鼠正常饮食、HFD和Gubra Amylin MASH饮食,检测肝脏EFHD1蛋白。
Excessive EFHD1-dependent ER-mitochondrial contacts drive a maladaptive antiviral response in metabolic liver disease
含人肝样本、小鼠MASH/HFD/CCl4模型、肝细胞原代培养、HepG2/HAP-1细胞、多组学、MR分析,并有功能与机制验证
人肝组织样本与MASH患者肝组织 小鼠MASH饮食模型及Efhd1–/–小鼠 小鼠原代肝细胞 HepG2与HAP-1细胞 人3D肝微组织
Efhd1–/–小鼠在MASH饮食28周后血清AST、ALT水平约为WT的一半 肝细胞经1 mM ATP或100 μM Ca2+刺激后线粒体形态与裂变事件的检测 splitFAST系统检测ERMCS数量与寿命,EFHD1–/–中荧光斑点更少且寿命更短 MASH饮食WT小鼠肝细胞中dsRNA与PKR免疫沉淀后mtRNA富集程度 Efhd1hKO或AAV8-shEfhd1小鼠在CCl4或MASH模型中的肝酶、炎症与纤维化评分
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认EFHD1在肝细胞中表达并在MASH中上调。
分析人肝单细胞RNA-seq、免疫组化及Western blot;给予小鼠正常饮食、HFD和Gubra Amylin MASH饮食,检测肝脏EFHD1蛋白。
检验EFHD1缺失是否在MASH中具有保护作用且不影响能量平衡。
对Efhd1–/–与WT小鼠进行MASH饮食28周,检测体重、体成分、摄食、活动、胰岛素抵抗、肝/体重比、血清甘油三酯、肝酶、组织学MASH活动评分、炎症和纤维化评分及直接测量。
验证EFHD1是否介导Ca2+依赖性线粒体形态变化和裂变。
分离小鼠原代肝细胞并用MitoTracker Orange标记;使用1 mM ATP触发IP3受体介导的ER Ca2+释放;透化细胞加入100 μM Ca2+;使用ionomycin;在WT和EFHD1–/– HepG2细胞中重复;通过TEM和固定细胞染色确认。
探究EFHD1如何通过肌动蛋白整合空间接近与时间性Ca2+信号来稳定ERMCS。
检测肝脏蛋白表达和DRP1磷酸化;共免疫沉淀验证EFHD1与β-actin相互作用;AlphaFold3建模EFHD1-β-actin;SiR-actin染色观察肌动蛋白网络;TEM测量ERMCS距离;splitFAST系统监测ERMCS数量与寿命;ionomycin诱导核周肌动蛋白环。
定义EFHD1缺失在MASH中恢复的通路。
对WT和Efhd1–/–小鼠正常或MASH饮食肝脏进行RNA-seq和无标记蛋白质组学;使用Hallmark和REACTOME通路分析。
确定MASH中激活ISR的损伤机制。
Western blot检测EIF2α、p-EIF2α、PERK、p-PERK、PKR、p-PKR、ATF4靶基因;人肝和小鼠肝细胞dsRNA与PKR免疫组化;免疫沉淀dsRNA或PKR后RT-qPCR定量mtRNA;检测dsRNA与DRP1距离。
检验人类PKR(EIF2AK2)与肝病之间是否存在因果关联。
查询Common Metabolic Diseases Knowledge Portal;分析UK Biobank中EIF2AK2位点35个遗传变异与AST关联;进行3层MR分析,以AST为暴露、肝病诊断为结局。
建立肝特异性EFHD1抑制是否具有肝保护作用。
使用Efhd1hKO小鼠或Alb-Cre对照,CCl4腹腔注射6周;人3D肝微组织转导shEFHD1 AAV-DJ;6周龄雄性小鼠MASH饮食18周后单次注射AAV8-shEfhd1,12周后检测肝酶、组织学和纤维化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 线粒体染色与活细胞成像 | MitoTracker Orange | -- | -- |
| 肌动蛋白染色 | SiR-actin | -- | -- |
| ERMCS稳定性检测 | splitFAST荧光配体HMBR | -- | -- |
| 线粒体钙单向转运体阻断 | Ru360 | -- | -- |
| Ca2+动员 | 离子霉素 | -- | -- |
| 细胞透化 | 洋地黄皂苷 | -- | -- |
| 线粒体标记 | mito-mGold2s | -- | -- |
| shRNA递送 | AAV8 | -- | -- |
| AAV-DJ | -- | -- | |
| 细胞培养 | HepG2细胞 | -- | -- |
| HAP-1细胞 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠MASH饮食模型 | 饮食成分(40%脂肪、2%胆固醇、20%果糖)、起始8周龄、持续28周、性别与样本量 阅读提示:Methods中Animals和Diet小节;Figure 1图注;Supplemental Figure 1B |
| Ca2+诱导的线粒体重塑 | 1 mM ATP、200 nM MitoTracker Orange、5分钟处理、1 μM Ru360、100 μM Ca2+ bolus、ionomycin浓度 阅读提示:Figure 2图注和对应Methods;Supplemental Figure 3L |
| ERMCS稳定性splitFAST检测 | ER-long-RspA-NFAST与OMM-short RspA-CFAST质粒、HMBR染料浓度、ATP刺激条件、荧光斑点计数与寿命定义 阅读提示:Supplemental Figure 5, I–K;Methods中splitFAST相关段落 |
| mt-dsRNA与PKR免疫沉淀 | dsRNA或PKR抗体、免疫沉淀条件、RT-qPCR引物(Mcu、Gapdh等)、MASH饮食WT与Efhd1–/–肝细胞 阅读提示:Figure 5, J–M图注;Supplemental Figure 8J;Methods中免疫沉淀与RT-qPCR小节 |
| AAV8-shEfhd1体内抑制 | 6周龄雄性小鼠、MASH饮食18周、单次AAV8注射、12周后检测、shEfhd1#1与#2序列及敲低效率 阅读提示:Figure 6, L–S图注;Supplemental Figure 9, E–J;Methods中AAV8递送小节 |
| CCl4肝损伤模型 | 2 μL/g CCl4、3次/周、腹腔注射、6周、8–10周龄雄性Efhd1hKO或Alb-Cre对照 阅读提示:Figure 6, E–I图注;Methods中CCl4模型小节 |