LN患者队列免疫状态分析
确定RG肠道bloom和抗LG抗体与LN患者免疫活化的关系
对Pilot队列和Validation队列LN患者进行全血RNA测序,检测血清抗LG IgG抗体、PF4和NET片段,并分析转录组与临床指标的相关性
A pathogenic gut lipoglycan drives systemic thromboinflammation in lupus nephritis
包含人体两个独立队列的转录组分析及小鼠体内定植、LG注射和TLR2-/-机制验证。
LN患者Pilot队列(8例无肾病SLE和8例LN) LN患者Validation队列(20例经活检证实的III或IV型LN) C57BL/6小鼠RG肠道定植模型 FcγRIIb-/-狼疮倾向小鼠RG定植及LG腹腔注射模型
RG肠道bloom定义为粪便RG丰度>1% 血清抗LG IgG抗体 cutoff值为59,000 U/mL LG腹腔注射剂量为1.5 μg/g,单次注射,6天后检测 小鼠抗生素预处理2周(enrofloxacin、ampicillin、metronidazole),随后每两天灌胃一次共5次 TLR2-/-小鼠用于验证LG反应的TLR2依赖性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定RG肠道bloom和抗LG抗体与LN患者免疫活化的关系
对Pilot队列和Validation队列LN患者进行全血RNA测序,检测血清抗LG IgG抗体、PF4和NET片段,并分析转录组与临床指标的相关性
验证产LG的RG菌株肠道定植是否引起血小板活化和肠道屏障损伤
C57BL/6小鼠经抗生素预处理后灌胃RG菌株,检测粪便RG定植水平、肠道通透性、全血转录组和血小板功能
确定LG单独是否足以驱动血小板活化和巨核细胞增多
向C57BL/6、FcγRIIb-/-和TLR2-/-小鼠单次腹腔注射纯化LG制剂,检测血小板活化、巨核细胞数量和转录组变化
验证LG诱导的体内反应是否依赖TLR2
在TLR2-/-小鼠中重复LG注射实验,比较巨核细胞数量、血小板P-selectin外化和转录组变化
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA测序 | 全血RNA测序文库 | -- | -- |
| 流式分析 | 抗P-选择素抗体 | -- | -- |
| 抗CD41抗体 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗F4/80抗体 | -- | -- |
| 抗髓过氧化物酶抗体 | -- | -- | |
| 抗瓜氨酸化组蛋白H3抗体 | -- | -- | |
| 抗CD3抗体 | -- | -- | |
| 肠道通透性检测 | 异硫氰酸荧光素-葡聚糖 | -- | -- |
| 抗生素预处理 | 恩诺沙星 | -- | -- |
| 甲硝唑 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LN患者队列免疫状态分析 | 抗LG IgG抗体 cutoff值59,000 U/mL;RNA-seq使用全血样本;患者分组依据抗LG抗体阳性或阴性 阅读提示:Methods及Supplementary Materials中关于Pilot和Validation队列的详细方法 |
| 小鼠RG肠道定植 | 抗生素预处理2周(enrofloxacin、ampicillin、metronidazole);每两天灌胃一次共5次;RG定植后2周和4周取样;每组n=3或n>7 阅读提示:Figure 3 legend及Methods中关于小鼠定植的详细描述 |
| LG腹腔注射 | LG剂量1.5 μg/g;单次腹腔注射;注射后6天检测;每组n>3 阅读提示:Figure 5 legend及Methods中关于LG注射的详细描述 |
| TLR2依赖性验证 | TLR2-/-小鼠与野生型C57BL/6对照;LG剂量1.5 μg/g;单次腹腔注射 阅读提示:Figure 5 legend及Methods中关于TLR2-/-小鼠实验的描述 |