人MASLD单核转录组解析LSEC中cGAS/STING激活
明确LSEC在人类MASLD进展中是否以及如何响应代谢应激并激活天然免疫通路。
分析已发表的人肝活检单核RNA-seq数据集(47例,多疾病阶段),对LSEC重聚类并进行GSVA、AddModuleScore和相关性分析,比较LSEC与巨噬细胞中脂代谢、损伤响应和天然免疫通路的关联。
Metabolic stress-activated endothelial STING rewires the sinusoidal immune niche in MASLD
包含人单核/单细胞转录组、内皮特异性Sting敲除小鼠两种MASH模型、体外LSEC与CD4+ T细胞共培养、ChIP-qPCR及双荧光素酶机制验证、纳米颗粒体内治疗。
人MASLD肝脏单核/单细胞转录组数据集 内皮细胞特异性Sting敲除小鼠(StingΔEC) CDAHFD和WD-CCl4诱导的小鼠MASH模型 原代小鼠肝窦内皮细胞(LSEC)与naive CD4+ T细胞
内皮特异性Sting敲除小鼠(Stingfl/fl Cdh5-Cre+)及其同窝对照(Stingfl/fl Cdh5-Cre–)的基因型验证 CDAHFD模型诱导10周和WD-CCl4模型诱导12周(WD 12周,最后4周腹腔注射CCl4 12.5%、1 mL/kg,每周2次) LSEC中STING、p65、p-p65、IRF3和p-IRF3的Western blot检测 BMP信号抑制剂LDN-193189(3 mg/kg,每周2次,最后4周)的体内 rescue 实验分组 RLH(H-151 1 mg/kg,静脉注射)与游离H-151(10 mg/kg,腹腔注射)在WD-CCl4模型第5–8周共8次给药的剂量与给药途径对比
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确LSEC在人类MASLD进展中是否以及如何响应代谢应激并激活天然免疫通路。
分析已发表的人肝活检单核RNA-seq数据集(47例,多疾病阶段),对LSEC重聚类并进行GSVA、AddModuleScore和相关性分析,比较LSEC与巨噬细胞中脂代谢、损伤响应和天然免疫通路的关联。
验证LSEC中脂毒性是否通过mtDNA释放激活cGAS/STING通路。
用棕榈酸(PA)处理原代LSEC,检测mtDNA释放及p65和IRF3磷酸化;用2′,3′-dideoxycytidine清除mtDNA后检测STING通路激活。
确认STING在肝内皮细胞中相对富集,并在代谢损伤下表达和信号进一步增强。
分析Human Protein Atlas、原代小鼠肝脏细胞mRNA、人肝免疫荧光共染;在CDAHFD和WD-CCl4小鼠MASH模型中分离原代LSEC进行Western blot,并对小鼠MASH LSEC转录组(GSE164006)进行GSEA。
验证内皮细胞内在STING信号在MASH进展中的功能必需性。
构建Stingfl/flCdh5-Cre+(StingΔEC)小鼠及同窝对照,在CDAHFD和WD-CCl4两种MASH模型中评估NAS、SAF、H&E、Oil Red O、Masson染色及血清ALT、AST、TBIL。
明确LSEC-STING缺失如何改变MASH肝脏中的免疫细胞组成,尤其是CD4+ T细胞亚群。
对WD-CCl4处理的StingΔEC和对照小鼠肝组织进行scRNA-seq,注释细胞类型,分析CD4+ T细胞亚群、Treg亚群、Th17异质性,并用流式验证Th17和Treg比例。
阐明LSEC-STING如何通过BMP4调控CD4+ T细胞命运。
在PA处理的LSEC中检测Bmp4表达,使用TNF-α激活NF-κB,双荧光素酶报告、JASPAR motif预测、ChIP-qPCR验证p65和AP-1结合;用LSEC条件培养基诱导naive CD4+ T细胞Treg分化。
验证内皮来源BMP信号是否介导StingΔEC的保护效应。
在WD-CCl4模型中给予BMP信号抑制剂LDN-193189,比较Stingfl/fl和StingΔEC小鼠的NAS、脂质蓄积、纤维化、SAF、血清肝损伤指标和Th17/Treg比例。
验证小鼠发现的LSEC-STING/BMP4血管分泌轴在人类MASH中是否保守。
分析人肝硬化scRNA-seq数据集(GSE136103),评估STING表达、cGAS/STING通路活性、BMP4表达及STING–与STING+内皮细胞与CD4+ T细胞的BMP配体-受体互作。
探究LSEC-STING是否影响MASH中CD8+ T细胞状态。
scRNA-seq分析StingΔEC和对照WD-CCl4小鼠中CD8+ T细胞亚群(Tex、Teff、Trm),功能富集、TF活性、CytoTRACE和拟时序分析,流式验证肝脏、循环和脾脏中Tex频率。
评估靶向LSEC递送STING抑制剂治疗MASH的疗效并与全身给药比较。
构建RLTR-liposome@H-151(RLH),表征粒径、封装效率、体内分布和LSEC摄取;在WD-CCl4模型中静脉注射RLH(H-151 1 mg/kg)8次,与腹腔注射游离H-151(10 mg/kg)比较肝损伤、脂质蓄积、纤维化及Th17/Treg比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 | ScienCell | 1001 |
| DMEM培养基 | Gibco | 10569010 | |
| 胎牛血清 | Bio-One Biotechnology | F05-001-B160216 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 肝细胞分离 | 肝脏灌注培养基 | Thermo Fisher Scientific | 17701-038 |
| 肝脏消化培养基 | Thermo Fisher Scientific | 17701-034 | |
| Percoll分离液 | GE Healthcare | 17-0891-02 | |
| LSEC分离 | 抗CD146磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-092-007 |
| MACS磁力分离器 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 药物处理 | 棕榈酸 | Sigma-Aldrich | P0500 |
| T-5224 | MedChemExpress | HY-12270 | |
| 2′,3′-双脱氧胞苷/扎西他滨 | Selleck | S1719 | |
| 细胞因子处理 | 肿瘤坏死因子-α | -- | -- |
| Treg分化 | naive CD4+ T细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480039 |
| 抗CD3抗体 | BioLegend | 100340 | |
| 抗CD28抗体 | BioLegend | 102116 | |
| 白细胞介素-2 | PeproTech | 212-12-20UG | |
| 转化生长因子-β1 | PeproTech | 100-21-10UG | |
| 骨形态发生蛋白4 | MedChemExpress | HY-P74379 | |
| 双荧光素酶报告 | Dual-Glo荧光素酶检测系统 | Promega | E5311 |
| 细胞裂解试剂 | Promega | E1941 | |
| GloMax 20/20发光检测仪 | Promega | -- | |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P2078 |
| 抗FLAG抗体 | MBL Life Science | M185 | |
| 对照IgG | ABclonal | AC011 | |
| DNA纯化试剂盒 | Beyotime Biotechnology | D0033 | |
| 动物实验 | LDN-193189 | MedChemExpress | HY-12071 |
| SB4 | MedChemExpress | HY-124697 | |
| SJ000291942 | MedChemExpress | HY-112331 | |
| H-151 | MedChemExpress | HY-112693 | |
| 异氟烷 | -- | -- | |
| 纳米颗粒合成与表征 | DMPE-PEG2000-NHS | -- | -- |
| 微型挤出器 | Avanti | -- | |
| NanoBrook 90Plus PALS | Brookhaven Instruments | -- | |
| EClassical3200高效液相色谱仪 | Elite Analytical Instruments | -- | |
| TF20透射电子显微镜 | FEI | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠MASH模型 | CDAHFD模型(A06071309,Research Diets,18%蛋白、46%脂肪、36%碳水化合物)喂养10周;WD-CCl4模型(D12079B,Research Diets,17%蛋白、40%脂肪、43%碳水化合物、0.21%胆固醇)喂养12周,最后4周腹腔注射CCl4(12.5%,1 mL/kg,每周2次);对照为正常饮食(XTI01WC,21.5%蛋白、11.1%脂肪、67.4%碳水化合物) 阅读提示:Methods的Animal models小节 |
| 内皮特异性Sting敲除小鼠构建 | Stingfl/fl(Tmem173-Flox,NM-CKO-00014,上海模式生物中心)与Cdh5-Cre(006137,Jackson Laboratory)杂交删除外显子3–5;PCR基因型验证引物P1–P7及条带大小(flox 800 bp,对照672 bp;Cre+ 345 bp,阴性521 bp) 阅读提示:Methods的Generation and genotyping of StingΔEC mice小节及Supplemental Table 1 |
| LSEC分离与培养 | 8–10周龄雄性C57BL/6小鼠,两步灌注(Liver Perfusion Medium 17701-038和Liver Digestion Medium 17701-034,Thermo Fisher),70 μm滤网,50g 4分钟和350g 10分钟离心,17.6%/11.0% Percoll梯度,anti-CD146磁珠(130-092-007,Miltenyi)30分钟4°C,MACS分选;内皮细胞培养基(1001,ScienCell) 阅读提示:Methods的Cell lines and primary cells小节 |
| 体外STING激活与BMP4调控实验 | PA 100 μM处理12小时;TNF-α 10 ng/mL处理12小时;T-5224 10 μM处理12小时;2′,3′-dideoxycytidine 20 μM处理7天;检测Bmp4转录和p65/IRF3磷酸化 阅读提示:Methods的Cell lines and primary cells小节及Figure 5 legend |
| 体内BMP信号抑制rescue实验 | WD-CCl4模型最后4周腹腔注射LDN-193189 3 mg/kg,每周2次;分组为Stingfl/fl±LDN和StingΔEC±LDN;每组n=5;检测NAS、SAF、ALT、AST、TBIL和Th17/Treg比例 阅读提示:Methods的Animal models小节及Figure 6 legend |
| RLH纳米颗粒制备与治疗给药 | RLTR肽通过DMPE-PEG2000-NHS偶联;薄膜水化、180 W水浴超声、100 nm聚碳酸酯膜挤出;RLH粒径约110 nm,H-151封装效率84.3%;WD-CCl4模型第5–8周静脉注射RLH(H-151 1 mg/kg)共8次,对照腹腔注射游离H-151 10 mg/kg;每组n=5 阅读提示:Methods的RLH synthesis and characterization小节及Figure 8 legend |
| Treg体外分化 | 24孔板预包被anti-CD3(5 μg/mL);naive CD4+ T细胞在含anti-CD28(5 μg/mL)、IL-2(5 ng/mL)、TGF-β1(10 ng/mL),有或无BMP4(15 ng/mL)的T细胞扩增培养基中,以5×10^5细胞/孔培养5天 阅读提示:Methods的In vitro Treg cell differentiation小节及Figure 5B legend |