筛选并验证 S100A11 响应胆固醇
寻找在肝脏中响应高膳食胆固醇的潜在因子。
整合小鼠、Tibetan pig、Olive baboon 和 rabbit 等胆固醇诱导 MASH 模型的 GSE 数据进行 DEG 分析;检测患者 MASH 肝脏 S100A11;在 HepG2、Huh7、Hepa1–6 细胞和喂食不同胆固醇饮食小鼠中检测 S100A11 表达。
S100A11 regulates hepatic cholesterol metabolism and promotes steatohepatitis via non-canonical SREBP2 signaling
包含细胞系、肝脏特异性 KI/KO 小鼠、AAV8 小鼠及患者 GEO 数据,并有结合、共定位、功能回补和机制验证
HepG2 细胞 Huh7 细胞 Hepa1–6 细胞 293T 细胞 肝细胞特异性 S100A11 敲入小鼠 S100A11HepKI 肝细胞特异性 S100A11 敲除小鼠 S100A11HepKO AAV8 介导 S100A11 过表达 C57BL/6J 小鼠
S100A11 与胆固醇结合及响应:膜脂条带、MST、点突变 N82G/G86T/K36I/D61G S100A11 调控 SREBP2 通路:SREBP2(P/N)、HMGCR、LDLR 的 Western blot 和免疫荧光核定位 S1P/S2P 依赖性:shRNA 敲低及 S1P 抑制剂 PF429242 ANXA1/KPNB 机制:ANXA1 敲低、Co-IP、LC-MS/MS 和 KPNB 抑制剂 importazole 体内表型:HFHC 饮食 20 周或 AAV8 过表达 16 周,检测血浆 TC、LDL-C、ALT、AST、肝脏 TC、TG、FC、F4/80、Picrosirius red、Masson’s trichrome
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找在肝脏中响应高膳食胆固醇的潜在因子。
整合小鼠、Tibetan pig、Olive baboon 和 rabbit 等胆固醇诱导 MASH 模型的 GSE 数据进行 DEG 分析;检测患者 MASH 肝脏 S100A11;在 HepG2、Huh7、Hepa1–6 细胞和喂食不同胆固醇饮食小鼠中检测 S100A11 表达。
确定 S100A11 是否直接结合胆固醇,以及哪些区域和氨基酸位点必需。
进行 AlphaFold 结构预测、分子对接、膜脂条带结合实验、filipin 与 ER 标志物共定位、U18666A 处理、GFP 标记截短和点突变、MST 检测。
探究 S100A11 如何参与胆固醇代谢。
构建 S100A11 稳定过表达和敲低 Huh7、Hepa1–6 细胞,检测 FC、SREBP2(P/N)、HMGCR、LDLR 及 SREBP2 核定位,并用 lovastatin 处理。
理解 S100A11 在肝脏胆固醇代谢中的作用。
生成肝细胞特异性 S100A11-OE 小鼠 S100A11HepKI,与对照 S100A11HepROSA 一起给予 HFHC 饮食 20 周,检测血浆和肝脏脂质、肝组织学、SREBP2 通路和炎症通路。
确定肝脏 S100A11 缺失是否有益。
生成肝细胞特异性 S100A11-KO 小鼠 S100A11HepKO,与对照 S100A11F/F 给予 HFHC 饮食 20 周,检测脂质、组织学、SREBP2 通路和炎症通路。
确定 S100A11 激活 SREBP2 是否依赖 INSIG/SCAP、caspase 2 或 RAGE/TLR4 通路。
在 S100A11-OE 和 KO 小鼠及细胞中检测 INSIG、SCAP、caspase 2、RAGE、TLR4 表达,并用 25-HC 处理 Hepa1–6 细胞观察 SREBP2 和 HMGCR。
探究 S100A11 如何影响 SREBP2 核转位。
检测 S1P 和 S2P 在 S100A11 KI/KO 小鼠肝脏表达;用 shRNA 敲低 S1P 或 S2P 并检测 S100A11-OE 细胞中 SREBP2、HMGCR 和胆固醇蓄积;使用 S1P 抑制剂 PF429242;Co-IP 检测 S100A11 与 S1P 互作及截短体。
确定 S100A11 是否通过 KPNB 以及 ANXA1 促进 SREBP2 核转位。
使用 KPNB 抑制剂 importazole;免疫荧光检测 SREBP2 和 KPNB 核累积;Co-IP 和 LC-MS/MS 筛选 S100A11 互作蛋白;检测 ANXA1 和 KPNB 在 KI/KO 小鼠肝脏表达;ANXA1 敲低、Co-IP、免疫荧光共定位和 ANXA1 截短体实验。
确定抑制 SREBP2 信号能否缓解 S100A11 促进的肝脏胆固醇蓄积和 MASH。
使用 AAV8 介导 S100A11 过表达小鼠,给予 HFHC 饮食,并用 TAT-NTS 或 PF429242 处理,检测肝脏 S100A11、SREBP2、HMGCR、炎症通路、ANXA1-KPNB 互作、组织学和脂质。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | C11995500C |
| 胎牛血清 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 10099–141 | |
| 低胆固醇细胞培养 | 脂质去除血清 | VivaCell | C3840 |
| 动物实验 | 高脂高胆固醇饮食 D12108C | Research Diets | D12108C |
| AAV8 过表达 | AAV8-GFP | Hanheng Biotechnology | -- |
| AAV8-S100A11 | Hanheng Biotechnology | -- | |
| 动物给药 | TAT-NTS | Med Chem Express | -- |
| PF429242 | Med Chem Express | -- | |
| 药物处理 | 洛伐他汀 | -- | -- |
| U18666A | -- | -- | |
| 25-羟基胆固醇 | -- | -- | |
| 机制抑制 | importazole | -- | -- |
| 脂质处理 | 胆固醇 | -- | -- |
| 磷脂酸 | -- | -- | |
| 磷脂酰丝氨酸 | -- | -- | |
| 心磷脂 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | filipin | -- | -- |
| 细胞培养 | HepG2 细胞 | Cell Bank of the Chinese Academy of Sciences | -- |
| Hepa1–6 细胞 | Cell Bank of the Chinese Academy of Sciences | -- | |
| Huh7 细胞 | Kunming Cell Bank of Type Culture Collection | -- | |
| 293T 细胞 | Kunming Cell Bank of Type Culture Collection | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞胆固醇处理和 S100A11 响应 | 细胞系 HepG2、Huh7、Hepa1–6;胆固醇处理浓度和时间;LDS 低胆固醇培养条件;重复数 n = 3 阅读提示:Figure 1 图注及 Results 中“Identification of S100A11 in the liver in response to high dietary cholesterol”部分 |
| S100A11 胆固醇结合和关键位点 | 重组蛋白来源和浓度;膜脂条带条件;MST 条件;点突变 N82G、G86T、K36I、D61G;U18666A 浓度和时间 阅读提示:Figure 2 图注及 Results 中“S100A11 has the ability to bind to cholesterol”部分 |
| 肝特异性 S100A11 KI/KO 小鼠 MASH 模型 | 小鼠性别和年龄:雄性 8 周龄;HFHC 饮食 D12108C 20 周;S100A11HepKI/S100A11HepROSA 与 S100A11HepKO/S100A11F/F 分组;样本量 n = 8–10 或 n = 8–12,组织学 n = 4 阅读提示:Figure 4 和 Figure 5 图注及 Methods 中“A high-fat, high-cholesterol diet–induced mouse model of metabolic dysfunction–associated steatohepatitis”部分 |
| AAV8-S100A11 体内过表达及药物抑制 | AAV8 剂量 100 μL 尾静脉注射;HFHC 饮食 16 周;TAT-NTS 20 mg/kg 或 PF429242 20 mg/kg 每周 i.p.,处死前 1 周隔天注射;每组至少 10 只;PF429242 溶剂组成 阅读提示:Figure 8 图注及 Methods 中“AAV8-mediated S100A11 overexpression”部分 |
| S1P/S2P、ANXA1/KPNB 机制验证 | shRNA 或 siRNA 敲低效率;PF429242 和 importazole 处理浓度及时间;Co-IP 细胞系 293T 或 Hepa1–6;LC-MS/MS 样本;ANXA1 截短体 C3 段 阅读提示:Figure 6、Figure 7、Supplemental Figure 5–7 图注及对应 Results 和 Methods |